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文檔簡(jiǎn)介
1、糖組學(xué)研究是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后的一個(gè)新的生物學(xué)研究熱點(diǎn),其中糖蛋白質(zhì)聚糖是糖組學(xué)研究的重中之重。N-糖酰胺酶(PNGase)是糖蛋白N-連接糖基化研究中主要的工具酶,其作用是將糖鏈從所連接的蛋白質(zhì)分子上釋放下來(lái)進(jìn)行分析,被廣泛用于糖鏈結(jié)構(gòu)信息、糖鏈結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系、糖鏈對(duì)糖蛋白功能的影響以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析等方面的研究。目前廣泛使用的商業(yè)化N-糖酰胺酶主要有兩種:PNGase F和PNGase A,但是這兩種酶在使用中都有各自不可克
2、服的缺點(diǎn),不能完全滿足糖組學(xué)飛速發(fā)展的需要。因此通過(guò)進(jìn)一步的挖掘和篩選,開(kāi)發(fā)出不具備自身糖基修飾、能夠使用原核系統(tǒng)進(jìn)行表達(dá)、且能最大限度酶切不同糖鏈結(jié)構(gòu)的新N-糖酰胺酶,是糖組學(xué)研究發(fā)展的必然需求。
本研究從細(xì)菌Terriglobus roseus中發(fā)現(xiàn)了一種編碼新型N-糖酰胺酶PNGase H+的基因,并對(duì)該基因進(jìn)行了分子克隆和體外重組表達(dá),并對(duì)重組表達(dá)的PNGase H+的活性及酶學(xué)特性進(jìn)行了研究。具體內(nèi)容如下:
3、 1.本研究從酸桿菌屬Terriglobus roseus DSM18391中發(fā)現(xiàn)了一種新型的N-糖酰胺酶PNGase H+基因,并對(duì)其進(jìn)行了基因克隆。將獲得的PNGase H+基因連接到pET30a載體上,然后轉(zhuǎn)化至E.coli BL21(DE3)中,得到含有重組PNGase H+質(zhì)粒的工程菌。在特定的條件下對(duì)此工程菌進(jìn)行了培養(yǎng)及誘導(dǎo)表達(dá),進(jìn)而通過(guò)Ni-NTA親和層析柱進(jìn)行分離純化,得到了純度較高的重組PNGaes H+酶。
4、 2.為了確定重組蛋白的活性,本研究以商業(yè)化的PNGase F為對(duì)照,以核心結(jié)構(gòu)含有α1,3-巖藻糖的糖蛋白HRP為底物,利用超高效液相進(jìn)行活性初測(cè),證明重組蛋白具有N-糖酰胺酶A樣活性。以熒光標(biāo)記的糖肽GNGN為底物建立了基于超高效液相的酶活性檢測(cè)方法。在對(duì)重組PNGase H+酶學(xué)特性進(jìn)行研究的過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)重組PNGase H+酶的最適pH為2.6,最適反應(yīng)溫度為30℃,重組PNGase H+酶無(wú)任何金屬離子依賴性,而大部分常用的表
5、面活性劑會(huì)影響其活力。
3.對(duì)重組PNGase H+酶的底物特異性研究顯示:重組PNGase H+酶既可像PNGaseF一樣作用于哺乳動(dòng)物來(lái)源的高甘露糖型、復(fù)合型以及雜合型N-糖鏈,又可如PNGaseA一樣作用于植物來(lái)源具有核心α1,3-巖藻糖連接的N-糖鏈,并克服了PNGase A不能直接作用于糖蛋白的缺點(diǎn)。此外,在作用于植物來(lái)源的糖蛋白時(shí),其對(duì)不合有核心α1,3-巖藻糖的N-糖鏈的酶解效率要高于PNGase F。
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