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文檔簡介
1、目的:明確肺炎鏈球菌非經典分泌蛋白GAPDH的分泌是否由細菌裂解引起,并確定 GAPDH分泌必需結構域。同時,驗證該蛋白與熱休克蛋白的DnaJ的相互作用,為深入研究GAPDH的分泌機制奠定基礎。
方法:原核表達GAPDH重組蛋白并制備其多克隆抗體,利用該多克隆抗體通過Western Blot評價GAPDH在肺炎鏈球菌中的保守性。缺失肺炎鏈球菌主要自溶酶 LytA使其喪失自溶能力,通過 Western Blot比較野生菌和Lyt
2、A缺陷菌GAPDH的分泌是否存在差異。同時以只在細胞內表達的CodY蛋白為參照,鑒定肺炎鏈球菌對數生長早期GAPDH的分泌是否伴有細菌裂解。利用Jpred3軟件分析GAPDH二級結構和功能結構域,利用Swiss-Model軟件對GAPDH進行同源模建,根據生物信息學結果進行截短表達設計。利用分子克隆技術將不同GAPDH截短表達基因片段克隆到異位表達載體pJW-v25質粒,經測序鑒定后將重組質粒轉化肺炎鏈球菌D39,采用0.15mm Zn
3、2+誘導表達含有GFP標簽的GAPDH。分離亞組份,采用Western Blot檢測截短表達的GAPDH在肺炎鏈球菌的定位,初步確定分泌必需結構域。采用結構替代和氨基酸突變兩種方法進一步驗證分泌必需結構域在GAPDH分泌中的作用,并確定參與GAPDH分泌的關鍵性氨基酸。將肺炎鏈球菌 GAPDH分泌必需結構域和枯草芽孢桿菌168菌株的GAPDH同源序列進行替換,評價該分泌必需結構域是否具有普遍性。在肺炎鏈球菌中,將GAPDH的結構域I進行
4、直接連接或柔性結構連接后,與GFP標簽蛋白融合表達,觀察融合蛋白的分泌及表面定位情況,以確定結構域I能否作為一個信號肽介導蛋白質的分泌。在肺炎鏈球菌中異位表達枯草芽孢桿菌168菌株 GAPDH,觀察其分泌情況,探討GAPDH在肺炎鏈球菌和枯草芽孢桿菌中是否具有共同的分泌途徑。采用大腸桿菌雙雜交系統(tǒng)、直接結合實驗、生物膜干涉技術驗證GAPDH和熱休克蛋白DnaJ的相互作用,并初步探討DnaJ對GADPH分泌的影響。
結果:獲得了
5、純度達90%的GAPDH重組蛋白,并制備了效價達107的抗GAPDH多克隆抗體。Western blot結果顯示,在對數生長早期二型肺炎鏈球菌莢膜型D39和莢膜缺陷型R6細胞壁及培養(yǎng)上清中均檢測到GAPDH的表達,但是并沒有檢測到CodY的表達。同時,主要自溶酶 LytA缺失后,培養(yǎng)上清依舊檢測到 GAPDH的表達,與野生菌相比無明顯差異。提示,肺炎鏈球菌GAPDH的分泌不是由于細菌自溶引起。用Jpred3軟件分析發(fā)現,GAPDH具有兩
6、個結構域:結構域I和II。結構域I由N末端的1-150aa和C末端α螺旋(317-335aa)構成。結構域II由151-316aa構成。對GAPDH進行同源建模,也發(fā)現GAPDH N末端和C末端在空間上相互靠近構成結構域I。根據以上生物信息學結果我們設計了GAPDH截短表達。Western blot結果顯示,結構域I的 N末端1-30aa和(或) C末端α螺旋缺失后, GAPDH都不能定位于細菌表面及分泌到培養(yǎng)上清,提示結構域 I是GA
7、PDH在細胞表面定為及分泌的必需結構域。氨基酸突變結果顯示, N末端的氨基酸3VKVGIN9、18GGG20和C末端325RTLEYF330突變后GAPDH的表面定位和胞外分泌都缺失,提示這些氨基酸是 GAPDH的表面定位和分泌的關鍵氨基酸。此外10F突變后,GAPDH在上清中消失,但仍出現于細胞表面,提示該突變只影響了GAPDH在上清的分泌,并不影響 GAPDH在細胞表面的定位;而322QLV324突變后, GAPDH不能定位到細胞表
8、面,但是可以分泌到培養(yǎng)上清,提示該突變只影響了GAPDH在細胞表面的定位,并不影響GAPDH在上清的分泌。單獨的結構域I與GFP融合后,其只表達于胞內,上清中沒有檢測到融合蛋白,柔性結構連接的結構域I也不能分泌到胞外,提示單獨的結構域 I不能介導蛋白質的分泌??莶菅挎邨U菌168菌株GAPDH在肺炎鏈球菌中能夠表達,但在細胞表面和上清中均檢測不到該蛋白,提示其在肺炎鏈球菌中不能定位到細胞表面及分泌到胞外,表明GAPDH在枯草芽孢桿菌和肺炎
9、鏈球菌中的分泌途徑存在差異。大腸桿菌雙雜交、ELISA直接結合實驗和BLI生物膜干涉技術結果顯示GAPDH和熱休克蛋白DnaJ具有直接的相互作用。
結論:肺炎鏈球菌GAPDH的分泌并不是細菌自身裂解引起的,結構域I的是其表面定位及分泌所必需的,但不足以使蛋白分泌到胞外。N末端氨基酸3VKVGIN9、18GGG20和C末端325RTLEYF330是GAPDH的表面定位和分泌的關鍵氨基酸。肺炎鏈球菌和枯草芽孢桿菌中的GAPDH分泌
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