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文檔簡介
1、目的:通過制備不同混合比例的模擬混合DNA,利用混合DNA分型中的峰高或峰面積信息,采用一定的參數(shù)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)建立在峰高或峰面積基礎(chǔ)上各基因座的表型組合進(jìn)行分析,篩選出合理的表型組合,建立限制性組合分析法對(duì)混合DNA分型的結(jié)果進(jìn)行解釋,從而對(duì)男/女兩人混合DNA分型的組分來源進(jìn)行認(rèn)定。并通過實(shí)際案例的驗(yàn)證,對(duì)建立的分析法在法醫(yī)學(xué)應(yīng)用中的適用范圍進(jìn)行探索,為解決法醫(yī)學(xué)應(yīng)用中男/女兩人混合DNA分型結(jié)果的解釋提供科學(xué)合理的途徑。 方法:選
2、擇AB-YfilerTM試劑盒中007陽性對(duì)照品作為已知男性DNA,選擇AB-IdentifilerTM試劑盒中9947A陽性對(duì)照品作為已知女性DNA(兩者濃度均為0.1ng/μl)。制備8個(gè)梯度比例的25例常量和不同混合比例不同混合DNA總模板量的19例低拷貝男/女兩入模擬混合DNA(每個(gè)梯度比例同時(shí)做三次平行試驗(yàn)),應(yīng)用雜合型均衡比和混合比兩個(gè)參數(shù),通過性別基因座估計(jì)男/女兩人混合DNA中男性DNA所占的比例,對(duì)在峰高(峰面積)信息
3、基礎(chǔ)上各基因座的表型組合進(jìn)行限制性的分析,篩選出合理的表型組合,建立限制性組合分析法。對(duì)男性組分混合比為95%、50%、5%的9個(gè)模擬混合樣本的峰高和峰面積信息分別進(jìn)行分析,比較其在限制性組合分析法中的應(yīng)用有無差別。通過12例常量和5例低拷貝男/女兩人混合DNA案件對(duì)建立的分析法進(jìn)行驗(yàn)證,觀察分析結(jié)果。 對(duì)混合DNA分型中出現(xiàn)的一個(gè)等位基因缺失、兩個(gè)等位基因缺失及低拷貝DNA分型中等位基因缺失三種類型,參考PeterGill推薦
4、的相應(yīng)的量化公式[2]進(jìn)行似然率(LR)計(jì)算。 結(jié)果:25例模擬常量混合DNA分析的結(jié)果顯示:3例混合樣本檢出的基因座數(shù)為15個(gè)(檢出率100%),5例檢出數(shù)為14個(gè)(檢出率93%),4例檢出數(shù)為13個(gè)(檢出率87%),6例檢出數(shù)為12個(gè)(檢出率80%),3例檢出數(shù)為11個(gè)(檢出率73%),最低檢出數(shù)為8個(gè)(檢出率53%)僅1例;在男性組分混合比為95%的三次重復(fù)混合樣本中,分離得到的男性DNA分型依次出現(xiàn)2個(gè)、1個(gè)和4個(gè)等位基
5、因缺失,其余混合樣本均無缺失;6例混合樣本出現(xiàn)等位基因的錯(cuò)判,其中5例樣本錯(cuò)判數(shù)1個(gè)基因座、1例錯(cuò)判2個(gè)基因座,6例中的3例均為男性組分混合比為30%的樣本;25例混合樣本的似然率(LR)值均達(dá)到14個(gè)數(shù)量級(jí)以上。 19例模擬低拷貝混合DNA分析的結(jié)果顯示:1例低拷貝混合樣本的檢出基因座數(shù)為12個(gè)(檢出率80%),1例檢出數(shù)為11個(gè)(檢出率73%),最低檢出基因座數(shù)為3個(gè)(檢出率20%)共4例;6例樣本出現(xiàn)等位基因缺失,缺失集中
6、在男性混合比低于20%或混合DNA模板量為100pg的樣本中;18例樣本出現(xiàn)等位基因錯(cuò)判;同一混合比的三次重復(fù)樣本間LR值差別多數(shù)在6個(gè)數(shù)量級(jí)以內(nèi)。 選擇峰高與峰面積信息進(jìn)行混合DNA的分析在檢出基因座數(shù)、等位基因缺失數(shù)和錯(cuò)判基因座數(shù)三方面無明顯差別。 17例混合DNA案件驗(yàn)證的結(jié)果顯示:12例常量混合DNA案件中,4例案件檢出基因座數(shù)為15個(gè),2例檢出數(shù)為14個(gè),1例檢出數(shù)為13個(gè),2例檢出數(shù)為12個(gè),2例檢出數(shù)為11
7、個(gè),最低檢出數(shù)為10個(gè)僅1例;5例案件出現(xiàn)等位基因缺失,其中4例均缺失1個(gè)基因座、1例缺失3個(gè)基因座;12例案件均無等位基因錯(cuò)判。5例低拷貝混合DNA案件中,最高檢出基因座數(shù)為9個(gè),最低檢出數(shù)僅為3個(gè);僅1例出現(xiàn)缺失現(xiàn)象;錯(cuò)判基因座數(shù)共10個(gè)。 結(jié)論:結(jié)合44例模擬混合DNA和17例混合DNA案件的分析,建立的限制性組合分析法的適用范圍是:混合DNA分型的15個(gè)基因座中最高等位基因條帶的相對(duì)熒光強(qiáng)度應(yīng)大于1000rfu,且混合比
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