丹參抗心血管疾病有效成分的虛擬篩選研究.pdf

1、中國(guó)的傳統(tǒng)中藥作為中華五千年文明的一大瑰寶，數(shù)千年來(lái)積累了豐富的臨床醫(yī)學(xué)經(jīng)驗(yàn)，在人類(lèi)醫(yī)學(xué)的發(fā)展史上占有舉足輕重的地位。中藥的活性成分以及藥效作用機(jī)理是中藥現(xiàn)代化研究的重要組成部分。利用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)理論研究中藥中活性成分的藥理作用，對(duì)于闡明中藥多組分多靶點(diǎn)協(xié)同作用的機(jī)理，乃至對(duì)于中藥現(xiàn)代化的進(jìn)展都有重要的意義。在本實(shí)驗(yàn)中，我們利用分子對(duì)接方法對(duì)中草藥丹參抗心血管疾病的有效成分進(jìn)行了虛擬篩選，并對(duì)其藥理作用進(jìn)行了初步研究。
　　

2、 使用Accelrys公司開(kāi)發(fā)的Cerius2軟件包，結(jié)合化學(xué)信息學(xué)方法對(duì)查到的中草藥丹參中所含143個(gè)化合物進(jìn)行了系統(tǒng)的研究。通過(guò)計(jì)算所有分子的特征描述符，分析了丹參中所含分子的化學(xué)空間，并與112個(gè)治療心血管疾病的藥物類(lèi)藥分子進(jìn)行比較，為更加直觀的分析兩類(lèi)分子在化學(xué)空間上的分布，我們利用主成分分析法將兩類(lèi)分子的化學(xué)空間映射到了二維空間上，結(jié)果顯示在化學(xué)空間分布上除了有個(gè)別離群點(diǎn)外，兩類(lèi)分子有較大的重疊，這就說(shuō)明丹參中很可能含有能夠

3、治療心血管疾病的化合物，為我們下一步的篩選提供了依據(jù)。
　　 利用分子對(duì)接方法我們研究了這143個(gè)分子與治療心血管疾病有關(guān)的23個(gè)靶標(biāo)蛋白（37個(gè)結(jié)合位點(diǎn)）的相互作用，其中有20個(gè)分子與8個(gè)以上的活性位點(diǎn)有較好的相互作用，這一點(diǎn)充分驗(yàn)證了丹參在抗心血管疾病方面并不是作用于單一靶點(diǎn)而是作用在多個(gè)靶點(diǎn)上，這也說(shuō)明了中藥多組分多靶點(diǎn)協(xié)同作用的藥效機(jī)理。我們還統(tǒng)計(jì)了對(duì)接得分在前20位的分子，其中有9個(gè)分子與20個(gè)以上的活性位點(diǎn)有較好的相