馬屬雄性動物DDX3Y基因片段克隆測序及生物信息學(xué)分析.pdf

1、本文選取健康成年的公馬(Equus caballus)、公驢(Equus asinus)、公馬騾(Equus mulus)、公驢騾（Equus hinnus）和公騾駒(foal)，采集耳部皮膚組織，建立成纖維細(xì)胞系，并進(jìn)行核型分析，以確認(rèn)品種的正確性。染色體核型結(jié)果是公馬為2n=64(XY)，公驢為2n=62(XY)，公馬騾為2n=63(XY)，公驢騾為2n=63(XY)，公騾駒為2n=62(XY)。這5種動物的核型與前人研究的結(jié)果一致

2、。
　　本研究參考人、鼠、牛Y連鎖保守框3(DEAD box3，Y-linked，DDX3Y)基因序列，用比較基因組和克隆測序的方法，得到公馬(Equus caballus)、公驢（Equus asinus）、公馬騾(Equus mulus)、公驢騾(Equus hinnus)和公騾駒(foal)的DDX3Y基因部分序列，并用生物信息學(xué)方法分析這5種基因片段相互間的差異。結(jié)果表明，公馬、公驢、公馬騾、公驢騾和公騾駒DDX3Y基因片

3、段包含從第5外顯子后半部分到第17外顯子的前半部分，大小分別為4917bp、4912bp、4917bp、4917bp、4918bp，序列相似性是99.0％，這5個基因片段之間存在55個堿基的差異。上述5種動物的DDX3Y基因編碼均為521個氨基酸，編碼區(qū)有5個堿基的差異，氨基酸有兩處差異，包含類DEAD解旋酶超家族(DEAD-like helicases superfamily，DEXDc)和解旋酶超家族c端結(jié)構(gòu)域(helicase s