豬動(dòng)靜脈血液miRNA表達(dá)譜分析.pdf

1、MicroRNAs(miRNAs)是一類(lèi)長(zhǎng)度約18～24 nt的非編碼RNA，能夠與mRNA特異性結(jié)合從而調(diào)控基因的表達(dá)，在細(xì)胞增殖、分化、代謝、凋亡和免疫應(yīng)答等生物學(xué)過(guò)程中具有重要作用。血液作為最重要的體液廣泛參與機(jī)體各個(gè)生物學(xué)過(guò)程，血液中的miRNAs被報(bào)道能穩(wěn)定的存在于血液中作為生物體生理狀態(tài)和病理狀態(tài)的重要分子標(biāo)記。然而目前對(duì)于豬血液miRNA的研究相對(duì)較少，且都是對(duì)靜脈血液miRNA的研究，對(duì)于動(dòng)脈血液中miRNA研究還完全是

2、空白。為了鑒定豬血液miRNA表達(dá)譜和動(dòng)靜脈血液在miRNA表達(dá)水平的差異，我們利用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)了豬的動(dòng)脈血液和靜脈血液的miRNA表達(dá)譜，并用熒光定量方法進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果如下:
　　(1)通過(guò)建庫(kù)測(cè)序，分別在動(dòng)脈血液和靜脈血液獲得了5.21 million(M)和8.61 M原始數(shù)據(jù)。經(jīng)過(guò)濾后，超過(guò)78％的序列達(dá)到質(zhì)量要求成為mappable序列，這些mappable序列長(zhǎng)度集中在21～23 nt。
　　(2)兩個(gè)文庫(kù)

3、共鑒定出272個(gè)豬已知的miRNAs，52個(gè)保守的miRNAs和281個(gè)候選miRNAs，其中表達(dá)量位于前20位的miRNAs分別占據(jù)動(dòng)脈血液和靜脈血液全部序列的85.35％和84.75％。
　　(3)在表達(dá)量前20的miRNAs中有17個(gè)是在兩個(gè)文庫(kù)中共同表達(dá)的，通過(guò)靶基因預(yù)測(cè)和KEGG通路分析發(fā)現(xiàn)在血液中高表達(dá)的miRNAs主要與紅細(xì)胞的生成以及血管生成相關(guān)。
　　(4)用IDEG6對(duì)兩個(gè)文庫(kù)中的miRNAs進(jìn)行差異分析

4、得到57個(gè)差異表達(dá)的miRNAs(p＜0.001)，其中差異倍數(shù)達(dá)到1.5倍的miRNAs有12個(gè):在動(dòng)脈血液富集的miR-18a，miR-21，miR-99a，miR-144和miR-7以及在靜脈血液富集的miR-423，miR-16，miR-181a，miR-425，miR-151，miR-192和miR-142。
　　(5)差異miRNAs生物信息學(xué)分析顯示動(dòng)脈血液富集的miRNAs與免疫反應(yīng)過(guò)程相關(guān)，而靜脈血液富集的miR