Y染色體NC-DNA結(jié)構(gòu)比較分析.pdf

1、生物信息學(xué)的主要任務(wù)是利用信息處理方法揭示海量生物學(xué)數(shù)據(jù)中蘊(yùn)涵的生物學(xué)意義、探索生命活動(dòng)的奧秘。生物基因組中存在大量的非編碼區(qū)序列，這些序列中包含許多未知的生物功能或信息，對(duì)它的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析已成為生物信息學(xué)研究最重要的課題之一。
　　 論文通過(guò)對(duì)Y染色體NC-DNA結(jié)構(gòu)比較分析的研究，尋找非編碼區(qū)中具有“錘頭結(jié)構(gòu)序列+串聯(lián)重復(fù)序列”的模式結(jié)構(gòu)，探索其中可能具有的生物意義。主要研究的內(nèi)容和取得的成果如下：
　　 (1)通過(guò)

2、對(duì)生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)的分析，根據(jù)ncbi上獲取非編碼區(qū)序列的方法，使用VC++網(wǎng)絡(luò)編程技術(shù)，設(shè)計(jì)并實(shí)現(xiàn)非編碼區(qū)序列智能下載工具，方便快捷地在Oracle中建立Y染色體NC-DNA本地二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。
　　 (2)對(duì)串聯(lián)重復(fù)序列識(shí)別算法進(jìn)行研究，結(jié)合非編碼區(qū)的特點(diǎn)，使用DC3算法構(gòu)建后綴數(shù)組，結(jié)合最長(zhǎng)公共前綴識(shí)別精確的串聯(lián)重復(fù)，并使用回繞動(dòng)態(tài)規(guī)劃對(duì)其進(jìn)行擴(kuò)展，實(shí)現(xiàn)模糊串聯(lián)重復(fù)識(shí)別。使用“變異度”來(lái)衡量模糊串聯(lián)重復(fù)序列的有效性。該算法能