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1、褶皺假絲酵母脂肪酶(Candida rugosa lipase)基因工程菌的高密度發(fā)酵研究經(jīng)歷了從5L到800L規(guī)模的逐級放大過程,研究顯示在小規(guī)模(30L以下)發(fā)酵條件下,維持pH條件穩(wěn)定的指數(shù)流加控制方式即已能滿足高密度生產(chǎn)需求。隨著規(guī)模擴大,諸多在小規(guī)模發(fā)酵時可忽略的因素,如環(huán)境穩(wěn)定、產(chǎn)物蛋白降解等,成為了新限制條件,對這些條件進行的單因子和正交優(yōu)化研究表明,需要采用分段流加控制策略才能夠保證大規(guī)模發(fā)酵成功。該策略將發(fā)酵過程劃分為
2、兩個獨立階段,分別保持pH、溫度、攪拌等環(huán)境條件的穩(wěn)定,在48 hr時采用近穩(wěn)態(tài)方式進行平穩(wěn)過渡。實驗證明,該策略有利于維持菌體生長和產(chǎn)物代謝平衡。800L,發(fā)酵實驗獲得了穩(wěn)定的14000 IU ml-1脂肪酶酶活和約500 g l-1細(xì)胞濕菌重。該發(fā)酵工藝高效、廉價,具有大規(guī)模工業(yè)應(yīng)用的潛力。 耐熱脂肪酶研究結(jié)果顯示氨基酸殘基組成、寡肽片段組成和二元模式組成與蛋白耐熱性存在顯著關(guān)聯(lián)。Ala,His,Leu,Gly,Pro,Ph
3、e,Met,Trp,Tyr,KC,EE,KE,RE,VE,YI,EK,VK,EV,YV,EY, KY,VY, YY組成與耐熱性正相關(guān);Asn,Arg,Cys,Ile,Gin,Glu,Lys,Thr,Ser,QC,QH,QN,HQ,MQ,NQ,QQ,TQ,QS,QT組成與耐熱性負(fù)相關(guān)。三種組成從不同層次,不同角度提取耐熱蛋白序列信息,相互關(guān)聯(lián)補充,較為全面的體現(xiàn)了序列性質(zhì)特征。采用SVM算法的嗜熱蛋白分類研究結(jié)果顯示,同時采用三肽片段特征
4、與二元模式特征的平均分類準(zhǔn)確率達(dá)到98%,采用三肽片段特征的平均分類準(zhǔn)確率達(dá)到96%,采用二元模式特征的平均分類準(zhǔn)確率達(dá)到95%,采用二肽片段特征的平均分類準(zhǔn)確率達(dá)到85%,而采用氨基酸殘基組成特征的平均分類準(zhǔn)確率達(dá)到74%。 在參考DNA重排(DNA Shuffling)實驗方法的基礎(chǔ)上,發(fā)展了蛋白質(zhì)序列重排(Sequence Shuffling)技術(shù),構(gòu)建了耐熱脂肪酶電子重組體庫。該文庫包含有15620條由5條嗜熱和常溫脂肪
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