石刁柏SUPERMAN基因的克隆及初步分析.pdf

1、THESUPERMANGENECLONINGANDPRELIMINARYANALYSISINASPARAGUSoFFlCINALlSADissertationSubmittedtotheGraduateSchoolofHenanNormalUniversityinPartialFulfillmentoftheRequirementsfortheDegreeofMasterofScienceBySuJunxiangSupervisor：P

2、rofGaoWujunMay，2012摘要植物SUPERMAN類(lèi)鋅指蛋白是C2H2型鋅指蛋白中的單鋅指蛋白，該類(lèi)蛋白只含一個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)域，具有N端保守序列QALGGH和C端富吉亮蟹酸的保守序列L(I)DLXLR(K)L，其豐要在植物花、側(cè)根、種子和胚發(fā)育過(guò)程起重要作用。最近研究表明SUPERMAN基因可能參與了雌雄異株植物性別決定和分化調(diào)控。因此為了研究SUPERMAN基因是否參與了石刁柏性別決定及其分化過(guò)程，本文以雌雄異株植物石刁柏為材

3、料，根據(jù)已經(jīng)報(bào)道的SUPERMAN糞單辭指蛋自的氨基酸保守序列設(shè)計(jì)引物，利用RACE技術(shù)從石刁柏中分離了一個(gè)SUPERMAN類(lèi)單鋅指蛋白的基因AoSUP，并對(duì)AoSUP的基因序列、蛋白結(jié)構(gòu)、雌雄株不同營(yíng)養(yǎng)組織表達(dá)差異進(jìn)行了初步分析。結(jié)果如下：1、利用RACE技術(shù)擴(kuò)增了AoSUP基因的cDNA全長(zhǎng)序列并進(jìn)行了初步分析，結(jié)果表明：AoSbP的保守區(qū)片段為長(zhǎng)度409bp，其cDNA全長(zhǎng)1052bp，5UTR區(qū)長(zhǎng)63bp，3UTR區(qū)長(zhǎng)213bp

4、，該全長(zhǎng)序列中包含個(gè)長(zhǎng)度為786bp的ORFl開(kāi)放閱讀框)，該閱讀框編碼261個(gè)氨基酸的多肽鏈，其氨基酸序列包含該類(lèi)單鋅指蛋白的核心鋅指結(jié)構(gòu)域QALGGHMRR，以及c端的L／IDLELRLG保守序列。AoSUP的氨基酸序列同其他植物11種代表性SUPERMAN類(lèi)基因氨基酸序列比對(duì)和NJ進(jìn)化樹(shù)結(jié)果顯示，AoSUP同該婁蛋白的氫基酸相似度介于15％到49％之間，其中相似度最高的是擬南芥的KUN基因的氨基酸睜列，為49％。2、利用ProtP

5、aram、ProtScale、SOPMA、NetPhos20Serve等軟件分析對(duì)AoSbP基因蛋白生物信息學(xué)分析表明：AoSUP蛋白氨基酸相對(duì)分子量為283610，等電點(diǎn)(∥)為lo16：AoSUP蛋白多肽鏈親水性氨基酸均勻分布于整個(gè)蛋白質(zhì)中，且多于疏水性氯基酸，因此AoSUP屬于親水性蛋白：AoSUP氨基酸序列的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為a一螺旋、B一折疊和B一轉(zhuǎn)角，所占比例分別為2720％、1264％$n536％；AoSUP氨基酸序列共有l(wèi)7