植物化感作用代謝途徑模擬預(yù)測系統(tǒng)的構(gòu)建與應(yīng)用.pdf

1、生物信息學(xué)是當(dāng)今比較重要和前沿的科學(xué)發(fā)展領(lǐng)域之一，被廣泛用于生物研究的各個(gè)方面，特別是應(yīng)用生物信息學(xué)的研究方法來研究植物化感作用代謝途徑受到了國內(nèi)外同行的關(guān)注。本文通過構(gòu)建化感作用代謝途徑預(yù)測系統(tǒng)，應(yīng)用生物信息學(xué)方法對未知序列進(jìn)行比對，從而實(shí)現(xiàn)對該序列功能與代謝途徑的預(yù)測.主要結(jié)果總結(jié)如下： 1、應(yīng)用改進(jìn)型Smith-waterman動態(tài)規(guī)劃算法為核心構(gòu)建化感作用代謝途徑模擬系統(tǒng)。并選用Java語言作為整個(gè)系統(tǒng)的開發(fā)環(huán)境，配合M

2、ySql數(shù)據(jù)庫使之在各個(gè)平臺上具有移植性與良好的交互性。 2、根據(jù)與化感作用密切相關(guān)的酚酸類代謝途徑以及萜類代謝途徑上的數(shù)據(jù)，通過NCBI上的基因序列號查詢并運(yùn)用站內(nèi)網(wǎng)頁爬行技術(shù)搜集其相關(guān)的cDNA序列以及氨基酸序列進(jìn)行初始數(shù)據(jù)庫的建立以及數(shù)據(jù)的自動錄入。 3、運(yùn)用本文所建立的化感作用代謝途徑預(yù)測系統(tǒng)來研究植物化感作用方面的可行性與實(shí)用性，主要是進(jìn)行基因序列比對并分析比對的結(jié)果。 4、最后結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)提出使序列匹