陰道滴蟲氫化酶體蛋白蛋白的預測及其導肽的進化分析.pdf

1、氫化酶體是厭氧原蟲或真菌細胞內(nèi)的亞細胞結構，可通過丙酮酸代謝產(chǎn)ATP和分子氫，現(xiàn)有的研究認為氫化酶體與線粒體具有共同的起源。蛋白組分的確定對深入了解質(zhì)體的生化代謝和進化過程有重要的意義。雖然目前已有多種分子生物學、蛋白組學和計算預測的方法應用于線粒體蛋白的定位分析中，但氫化酶體相關領域的研究進展卻相對緩慢。本文在氫化酶體和線粒體進化關系和蛋白轉運機制的研究基礎上，通過歸納線粒體蛋白與氫化酶體蛋白導肽共有的生物學特征，運用簡單規(guī)則和特異性

2、模式構建與搜索的方法，對陰道滴蟲的氫化酶體蛋白進行預測，為進一步通過實驗方法鑒定氫化酶體蛋白提供了有效的候選蛋白。
　　 應用本文提出的HdPred方法共預測獲得70個可能的氫化酶體蛋白，對該結果的深入評價發(fā)現(xiàn)，其中50％的組分通過實驗方法或在其它預測方法得到了確認，表明該方法能較為有效地對氫化酶體蛋白進行富集。本文的研究報道了多個能量代謝相關的氫化酶體蛋白，進一步說明了氫化酶體在能量代謝過程中的重要作用，同時本文的方法發(fā)現(xiàn)氫化

3、酶體中可能具有的脂肪酸代謝相關的組分，為全面了解該質(zhì)體的生化代謝途徑提供了明確的目標基因，此外，通過比較不同方法對導肽序列的預測結果，顯示本文采用的方法在導肽序列的預測上具有更高的準確性。
　　 本文首次全面地對線粒體蛋白導肽的起源和進化方式進行歸納，并按照其起源方式分為外源性獲得和自身起源兩個類型。在蛋白質(zhì)組學對陰道滴蟲的氫化酶體蛋白鑒定結果的基礎上，本文對其中Hsp60蛋白的導肽的起源和進化進行了探討，分析表明其導肽可能通過