梔子屬藥用植物DNA條形碼的研究.pdf

1、目的:DNA條形碼技術(shù)能實(shí)現(xiàn)對(duì)物種的快速成功鑒定，通常情況下是用一段有足夠變異、相對(duì)通用、易擴(kuò)增和相對(duì)較短的片段來(lái)進(jìn)行的研究。核基因ITS2序列和葉綠體rbcL、matK、psbA片段用于對(duì)茜草科植物梔子屬的鑒別能力的評(píng)價(jià)，探索梔子屬植物鑒定的新方法。
　　方法:對(duì)4條不同的DNA條形碼序列(ITS2、rbcL、matK、psbA)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增并進(jìn)行雙向測(cè)序，所得序列經(jīng)過(guò)CodonCodeAligner拼接后，序列變異位點(diǎn)采

2、用PAUP4.0b10進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，利用MEGA5.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，比較各序列的擴(kuò)增成功率、長(zhǎng)度、種內(nèi)和種間變異并構(gòu)建鄰接(NJ)樹，再利用已建立的ITS2數(shù)據(jù)庫(kù)及其網(wǎng)站預(yù)測(cè)ITS2的二級(jí)結(jié)構(gòu)。
　　結(jié)果:梔子及其近緣茜草科植物、混偽品ITS2序列長(zhǎng)度為201～235bp，系統(tǒng)發(fā)育樹上顯示不同來(lái)源的樣本根據(jù)親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近各聚一支，表現(xiàn)出單系性;而同時(shí)又與混偽品明顯分開。比較ITS2二級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)，梔子及其近緣茜草科植物、混偽品在