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文檔簡介
1、DNA條形碼已經(jīng)被用于異翅亞目多個(gè)類群的鑒定,但這些研究缺乏對同屬近緣種及同種不同地理種群間和種群內(nèi)不同個(gè)體遺傳距離變異幅度的分析。
本研究選取半翅目異翅亞目緣蝽科棘緣蝽屬(Cletus St(a)l)為研究材料,探討DNA條形碼用于鑒定同屬近緣種及同種不同地理種群間和種群內(nèi)不同個(gè)體的可行性。棘緣蝽屬是我國較為常見的緣蝽種類,中國已知7種,種間外觀非常相似,但由于在某些重要分類特征上存在種間與種內(nèi)變異的交叉,為物種的準(zhǔn)確鑒定帶
2、來困擾。本研究通過分析棘緣蝽屬共計(jì)52個(gè)采樣點(diǎn)、366頭個(gè)體(包括中國的360頭標(biāo)本,以及尼泊爾的6頭標(biāo)本)的長度為982bp的COI序列,得到以下主要結(jié)論:
NJ/ML/BI系統(tǒng)發(fā)育樹、jMOTU(Cutoff=3%)、ABGD(P=1%-3%)及指標(biāo)向量(Indicator vector)分析雖仍將中國分布的棘緣蝽屬劃分為7個(gè)種,但支持稻棘緣蝽C.punctiger(Dallas,1852)和禾棘緣蝽C.graminis
3、Hsiao&Cheng,1964為同一個(gè)種并且確定短肩棘緣蝽C.pugnator(Fabricius,1787)在中國也有分布。不同地理種群的稻棘緣蝽和禾棘緣蝽形成相互嵌合的一個(gè)分支,生殖節(jié)等形態(tài)特征也極為相似,C graminis應(yīng)當(dāng)為C.punctiger的異名。盡管稻棘緣蝽和禾棘緣蝽形成的支系內(nèi)部存在較大的遺傳分化(0-4.36%),然而其內(nèi)部最大遺傳距離依然小于屬內(nèi)最小種間遺傳距離(6.57%)。同理,分布于中國云南、臺灣等地區(qū)
4、的短肩棘緣蝽與較為廣布的長肩棘緣蝽C.trigonus(Thunberg,1783)各自形成不同的支系,并且互為姊妹群,而這兩個(gè)分支之間的平均遺傳距離為7.1%(由此估計(jì)的分歧時(shí)間為7-11.83百萬年),大于屬內(nèi)最小種間遺傳距離,生殖節(jié)等形態(tài)特征也存在細(xì)微的穩(wěn)定的差異。用TaxonDNA對這七個(gè)種進(jìn)行鑒定成功率分析,以3%為閾值,“Best match/Best close match/All species barcodes”三項(xiàng)指
5、標(biāo)的值均為100%。此外,種內(nèi)及種間遺傳距離分析也表明存在明顯的條形碼間斷(barcoding gap)。
綜上所述,對于中國棘緣蝽屬種類的鑒定,DNA條形碼可以作為一種快速有效的鑒定方法,但是同時(shí)要考慮屬內(nèi)種間最小遺傳距離和系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果。本研究也為DNA條形碼解決同一個(gè)屬內(nèi)的近緣種的鑒定問題提供了例證。另外,在某些類群中不能以3%的遺傳距離閾值作為物種界定的標(biāo)準(zhǔn)。在利用遺傳距離初步界定是否存在隱存種時(shí),應(yīng)考慮以屬內(nèi)最小種
6、間遺傳距離為閾值,而不是3%的經(jīng)驗(yàn)值,否則可能會高估物種的多樣性。
通常認(rèn)為取樣地點(diǎn)及取樣個(gè)體數(shù)會影響DNA條形碼鑒定的準(zhǔn)確性,但很少有實(shí)例對此觀點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證,本研究同時(shí)也分析了綜合取樣對于DNA條形碼準(zhǔn)確鑒定的影響。研究表明,部分種類最大種內(nèi)遺傳距離并非隨著地理距離的增加而增加,即使是同一個(gè)地點(diǎn),同一個(gè)物種的遺傳距離也會大于1%,甚至超過3%,所以1個(gè)地點(diǎn)只選取1-2頭個(gè)體并不能充分地估計(jì)一個(gè)物種的遺傳多樣性。綜合取樣(每個(gè)種
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