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文檔簡介
1、阿爾茨海默病和帕金森病等常見的神經(jīng)退行性疾病,發(fā)病率隨年齡增長而升高,我國老齡化人口日益增加,此類疾病的藥物設(shè)計有著充分的現(xiàn)實意義。GPCRs是神經(jīng)系統(tǒng)疾病的一類重要靶標(biāo),但是單晶結(jié)構(gòu)難于獲得,于是獲取有效的GPCRs結(jié)構(gòu)信息并探索配體的作用機制,最終設(shè)計新的配體分子,就是本文的主要研究內(nèi)容。
甘丙肽2型受體、大麻素Ⅱ型受體和GPR17是三種與神經(jīng)退行性疾病相關(guān)的GPCRs,采用計算機輔助藥物設(shè)計,根據(jù)同源建模得到相應(yīng)受體的空
2、間結(jié)構(gòu)后,在分子對接研究機制的基礎(chǔ)上,根據(jù)研究發(fā)現(xiàn)的正構(gòu)位點和變構(gòu)位點關(guān)鍵氨基酸,虛擬篩選得到化合物以供后續(xù)活性測試。
以鴉片受體(PDB∶4N6H)為模板建立了甘丙肽2型受體的模型,分子對接和分子動力學(xué)模擬研究發(fā)現(xiàn)Ile1053.32,Met1093.36,Tyr1604.60,Tyr163和Arg2747.35為配體結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸;首次對甘丙肽2型受體的變構(gòu)調(diào)節(jié)進行研究,發(fā)現(xiàn)可能的變構(gòu)位點是由TM2,TM3,ECL2和E
3、CL3形成的PocketⅢ,提出正性變構(gòu)調(diào)節(jié)劑CYM2503的結(jié)合會阻斷鈉離子的結(jié)合或影響鈉離子通路這一可能的變構(gòu)機制,并分別針對正構(gòu)位點和變構(gòu)位點進行虛擬篩選,為發(fā)現(xiàn)以GALR2為靶點的小分子藥物奠定了基礎(chǔ)。
同源建模得到大麻素Ⅱ型受體模型,利用本單位構(gòu)建的具有類藥性骨架的3000個新結(jié)構(gòu)的小分子化合物庫,進行虛擬篩選后選取6個化合物進行生物活性測試,其中以CYC-YX-2102活性最佳(Ki=0.35μM),分子對接研究C
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