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文檔簡介
1、目的:通過分析肺表面活性蛋白C(Surfactant Protein,SP-C)基因及其啟動子區(qū)域單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs)及單倍體頻率,探討SP-C基因多態(tài)性與廣西漢族早產(chǎn)兒呼吸窘迫綜合征(Respir-atory Distress Syndrome,RDS)和支氣管肺發(fā)育不良(Bronchopulmonary Dys-plasia,BPD)易感性之間的關(guān)系。
2、方法:選擇SP-C基因的4個標簽單核苷酸多態(tài)性(Tagging Single Nucle-otide Polymorphisms,tSNPs)位點及其啟動子區(qū)域的3個SNP位點為研究位點,即rs8192325、rs2070684、rs4715、rs1124、rs8192321、rs8192335和rs8192337,以207例胎齡<32周的早產(chǎn)兒為研究對象,包括病例組(RDS)123例和對照組(非RDS)84例,其中RDS組并發(fā)BPD3
3、6例,未并發(fā)BPD59例(另有28例因在28天內(nèi)死亡或自動出院,未能診斷是否并發(fā)BPD)。應(yīng)用Mass Array基因分型技術(shù)對7個SNP進行基因分型,并對每個位點隨機抽取10個樣本應(yīng)用Sanger測序進行驗證。對各組基因分型結(jié)果進行哈迪-溫伯格平衡檢驗、最小等位基因頻率(Minor Allele Frequency,MAF)、基因型頻率、單體型、連鎖不平衡分析進行比較,并將啟動子區(qū)域的3個SNP位點與Hapmap數(shù)據(jù)庫中其他種族的基因
4、型頻率進行比較分析。
結(jié)果:①4個tSNP位點的MAF在RDS組與非RDS組中差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);在BPD組與非BPD組中差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。②在RDS組與非RDS組中,共有6種單體型頻率大于0.03,其中單體型GCAA的頻率在RDS組顯著低于非RDS組,差異有統(tǒng)計學意義(0.000 vs0.031,P<0.05)。在BPD組與非BPD組中,發(fā)現(xiàn)6種單體型頻率大于0.03,其中單體型ACCG和GAA
5、A的頻率在BPD組顯著低于非BPD組,差異有統(tǒng)計學意義(0.002 vs0.068,0.139 vs0.280,P<0.05)。單體型ACAA在BPD組顯著高于非BPD組,差異有統(tǒng)計學意義(0.041 vs0.000,P<0.05)。③在啟動子上的3個SNPs中,rs8192321和rs8192335位點只檢出一種基因型,未發(fā)現(xiàn)變異基因型;rs8192337位點僅在對照組中檢出1例雜合基因型。所有位點的基因型頻率在病例組和對照組間分布差
6、異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。經(jīng)與Hapmap數(shù)據(jù)庫中其他種族比較發(fā)現(xiàn),SP-C基因在廣西漢族早產(chǎn)兒中的基因型與北京人群的基因型相似,MAF均顯著低于歐洲人群。
結(jié)論:①在中國廣西漢族早產(chǎn)兒中,SP-C基因多態(tài)性與新生兒RDS及BPD易感性之間無關(guān)聯(lián);但單體型GCAA可能是RDS發(fā)病的保護因素,單體型ACCG和GAAA可能是BPD發(fā)病的保護因素,ACAA可能是BPD發(fā)病的危險因素。②在中國廣西漢族早產(chǎn)兒中,SP-C基因啟動子
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