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文檔簡介
1、目的:對融合蛋白 d-EGF二級、三級結(jié)構(gòu)進行預測并分析其活性部位的可能影響,進行原核表達,并對表達產(chǎn)物進行分析鑒定。
方法:以融合蛋白質(zhì)基因序列為基礎,用DNAStar軟件預測其蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu);用Insight II軟件對其三級結(jié)構(gòu)進行建模預測。在對融合蛋白理論預測的基礎上,分別構(gòu)建含β-defensin-3、EGF的重組質(zhì)粒,應用重組PCR等方法,將EGF的基因序列融合到β-defensin-3 DNA序列的3’末端,將
2、融合基因克隆入原核表達載體pET-SUMO,構(gòu)建目的重組質(zhì)粒 pET-SUMO-d-EGF。采用 PCR、測序等方法對目的基因是否正確重組進行鑒定;以重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌E.coli BL21(DE3),以IPTG誘導表達目的蛋白質(zhì),表達產(chǎn)物經(jīng)過Ni-trap柱純化,SDS-PAGE檢測表達初產(chǎn)物及純化產(chǎn)物。最后用Western-blot對其特異性進行鑒定;用MTT法檢測其促細胞增殖活性;用紙片擴散法藥物敏感試驗、微量稀釋法檢測其抗菌活
3、性。
結(jié)果:采用DNAStar軟件的Gamier Robson方法預測的結(jié)果表明,融合蛋白質(zhì)d-EGF含較多的β折疊結(jié)構(gòu);Charge Density-Charge法預測蛋白質(zhì)3-22、31-48區(qū)段帶豐富的正電荷;Insight II軟件分析顯示重組蛋白d-EGF中原蛋白β-defensin-3、EGF三級結(jié)構(gòu)中的活性必須的六個鏈內(nèi)二硫鍵在融合蛋白中都能夠正確形成,維持β-defensin-3三級結(jié)構(gòu)的3個反向平行的β折疊片
4、結(jié)構(gòu)在融合蛋白中能夠形成。融合蛋白的結(jié)構(gòu)含有原蛋白β-defensin-3、EGF的生物活性結(jié)構(gòu)。成功構(gòu)建β-defensin-3、EGF重組質(zhì)粒,經(jīng)重組PCR成功擴增出294bp的目的片段,重組體PCR結(jié)果與預期結(jié)果一致,測序正確。轉(zhuǎn)入重組質(zhì)粒的E.coli BL21(DE3)經(jīng)IPTG誘導、SDS-PAGE分析得到28 kD左右的目的蛋白條帶。用Western-blot鑒定出融合蛋白含有EGF,β-防御素-3的相應蛋白抗原表位。用
5、MTT法測得融合蛋白 d-EGF EC50約為0.4ng/ml,與EGF標準品EC500.08-0.8 ng/ml相符;用紙片擴散法藥物敏感實驗檢測對金黃色葡萄球菌有明顯抑菌環(huán)出現(xiàn),抑菌濃度25μg/ml相對標準品 hβ-defensin-3的MIC12.5μg/ml,說明d-EGF抑菌活性比標準品相對弱一些。
結(jié)論:在預測融合蛋白 d-EGF的二、三級結(jié)構(gòu)的基礎上,成功構(gòu)建原核表達載體pET-SUMO d-EGF,并表達出純
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