生存分析ppt課件

1、生存分析Survival Analysis,第一節(jié) 生存分析的基本概念,問題的引出基本概念資料收集生存分析的基本方法,問題的引出,生存分析,是將事件發(fā)生的結(jié)果和隨訪時間兩個因素結(jié)合在一起進(jìn)行分析的一種統(tǒng)計方法。它能充分利用所得到的研究信息，更加準(zhǔn)確地評價和比較隨訪資料。,一、基本概念,生存時間失效事件與起始事件截尾值生存率與風(fēng)險函數(shù)死亡概率與死亡密度函數(shù),1. 生存時間（survival time）,從某種起始事件到

2、終點事件所經(jīng)歷的時間跨度腎移植術(shù)后到死亡的時間跨度急性白血病病人從治療開始到復(fù)發(fā)的緩解期,2. 失效事件與起始事件,失效事件（failure event， terminating event ）：指反映治療效果特征的事件，又稱死亡事件、終點事件。起始事件（initial event）：是反映生存時間起始特征的事件，如確診、治療開始。,3. 完全數(shù)據(jù)（complete data）,指從起點至終止事件（如死亡）所經(jīng)歷的時間，即死者

3、的存活時間。如對乳腺癌病人的術(shù)后生存情況進(jìn)行隨訪，觀察到病人死于乳腺癌疾病，可得到準(zhǔn)確的生存時間，這類數(shù)據(jù)稱為完全數(shù)據(jù)。,4. 截尾值 （censored value）,由于中途失訪、死于其它原因、改變防治方案和研究工作結(jié)束時終止事件尚未發(fā)生，使得部分病人不能隨訪到底，稱為截尾。從起點到截尾點所經(jīng)歷的時間，稱為截尾數(shù)據(jù)。習(xí)慣記為140+天，3 +月。截尾數(shù)據(jù)也能提供部分信息，說明病人在某時刻之前沒有死亡。。,5. 生存概率與生存率,

4、生存概率：表示一個觀察對象從開始觀察到時間t為止的生存概率，它是一個隨時間下降的函數(shù)。 1 - 生存概率 = 死亡概率生存函數(shù)（survival function）又稱為累積生存率，簡稱生存率。表示觀察對象生存時間大于t的概率。S(t)=P(T > t )=p1.p2 . p3…pk,1個月（術(shù)后至30天）2個月（31至60天）3個月（61天至90天）,生存函數(shù)又稱為累積生存率，簡稱生存率,如3

5、年生存率的表達(dá)：S(3)=P(T > 3) = p1.p2 . p3 p1，p2和p3為1年，2年和3年各個時段的生存概率。3年生存率是第1年存活，第2年存活，第3年還存活的累積結(jié)果。習(xí)慣上仍稱之為生存率。,,指將各個時點的生存率連接在一起的曲線,6. 生存曲線,7. 半數(shù)生存期(median survival time),表示恰好有50%的個體可以活這么長時間。計算方法不同于普通的中位數(shù)，需要處理缺

6、失值,二、資料收集,隨訪內(nèi)容隨訪方式隨訪資料的記錄與整理生存分析的主要內(nèi)容,（一）隨訪的內(nèi)容,每個觀察對象有明確的開始隨訪時間，如：入院時間、出院時間、確診時間、開始治療時間隨訪的結(jié)局和終止隨訪時間（研究結(jié)束時間）死與本?。ㄍ耆珨?shù)據(jù)）死于它病 、失訪、終止隨訪時觀察對象仍存活（截尾值）。 記錄影響生存的有關(guān)因素，如年齡，組織類型，術(shù)后放療等。,（二）隨訪方式,（三）隨訪資料的記錄與整理,項目包括；開始觀察日期， 終

7、止觀察日期結(jié)局死于本病 死亡事件（完全數(shù)據(jù)） 死于它病失訪 截尾值（不完全數(shù)據(jù)）終止觀察時還生存有關(guān)因素：年齡、性別等,,,,,,5例肝癌病人隨訪記錄,,,,（四）生存分析的主要內(nèi)容,描述生存過程比較生存過程生存過程的影響因素分析,1. 描述生存過程,包括研究生存時間的分布特點，估計生存率，生存率曲線等。例如，根據(jù)白血病化療后的緩解

8、年數(shù)資料，可以估計不同年數(shù)的緩解率P（T > t），如 P（T > 4）、 P（T > 10）等 ，也可以獲得這些病人的緩解率曲線。,2. 比較生存過程,在獲得生存率及其標(biāo)準(zhǔn)誤的估計值后，進(jìn)行兩組或多組生存率比較。例如比較不同方案治療白血病的緩解率曲線，以了解哪種方案較優(yōu)。,3. 生存過程的影響因素分析,例如，為了改善食管癌手術(shù)后的預(yù)后，應(yīng)該了解影響病人預(yù)后的主要因素，從而在手術(shù)前、后加以預(yù)防和干預(yù)。這些因素可以是病人

9、的年齡、腫瘤部位、侵及深度、TNM分期、腫瘤長徑、切緣長度、殘端情況、組織類型、術(shù)前放療、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移數(shù)，等。通常用Cox回歸模型分析。,第二節(jié) 生存率的估計與生存曲線,Kaplan-Meier法（乘積極限法）：直接用概率乘法原理估計生存率，主要用于小樣本，也可用于大樣本。壽命表法（life-table method）:當(dāng)樣本例數(shù)足夠多時，乘積極限法可按時間劃分組段后計算（少用，不講）。,生存率的Kaplan-Meier法估計,例17

10、-1：有人研究了甲種手術(shù)方法治療腎上腺腫瘤病人的生存情況，定義從手術(shù)后到病人死亡的時間為生存時間，得到的生存時間（月）如下，其中有“+”者是截尾數(shù)據(jù)，表示病人仍生存或失訪，括號內(nèi)為重復(fù)死亡數(shù)。1，3，5（3），6（3），7，8，10（2），14+，17，19+，20+ ，22+，26+，31+，34， 34+，44，59。試計算其生存率與標(biāo)準(zhǔn)誤。,數(shù)據(jù)文件,Analyze? Survival ? Kaplan-Meier,單擊Defin

11、e Event 按鈕，打開定義完全數(shù)據(jù)對話框,,選擇：Plots:Survival,單擊OK,結(jié)果解釋,,,,圖1 甲種手術(shù)方法治療腎上腺腫瘤患者的Kaplan-Meier生存率曲線,第三節(jié) 生存曲線的log-rank檢驗,將生存曲線作為整體進(jìn)行曲線與曲線之間的比較。屬于非參數(shù)檢驗，其無效假設(shè)為兩總體生存曲線相同，利用死亡數(shù)和死亡率函數(shù)作統(tǒng)計推斷。,,一、log-rank檢驗的計算步驟,例：兩組兒童橫紋肌肉瘤治療后復(fù)發(fā)時間（月數(shù)）如表所

12、示，對照組為“摘除+放療”，處理組為“摘除+放療+化療”，問在“摘除+放療”基礎(chǔ)上附加“化療”是否可提高緩解率（相當(dāng)于壽命表資料的生存率）？,兩組兒童橫紋肌肉瘤治療后復(fù)發(fā)時間（月數(shù)，“+”表示未復(fù)發(fā)）,1. 檢驗假設(shè),H0：兩總體緩解曲線相同 H1：兩總體緩解曲線不同 ?=0.05,2. 計算檢驗統(tǒng)計量,檢驗統(tǒng)計量為：,3. 確定P值作結(jié)論,Log–rank檢驗結(jié)果顯示：兩組緩解率曲線的差別有統(tǒng)計學(xué)意義（?2=5.61，P

13、=0.018），故可認(rèn)為附加放療（處理組）可提高病人的緩解率。,兩組兒童橫紋肌肉瘤治療后復(fù)發(fā)時間（月數(shù)，“+”表示未復(fù)發(fā)）,二、SPSS過程和結(jié)果解釋,建立數(shù)據(jù)文件,,從菜單選擇Analyze? Survival ? Kaplan-Meier,選擇time變量進(jìn)入Time欄中,分組變量或因素變量（如group）進(jìn)入Factor欄中，status變量進(jìn)入Status欄中。,單擊Define Event 按鈕，打開定義完全數(shù)據(jù)對話框,在S

14、ingle value欄填入 1 表示完全數(shù)據(jù),單擊Continue返回,單擊Compare Factor按鈕，打開因素各水平間比較對話框,兩組生存率曲線的比較：選擇Log-rank,? Pooled over strata：將各層合并，對各水平作總的比較。默認(rèn)選擇項（本例選此項）?！?Pairwise over strata：不分層對各水平作兩兩比較。,單擊 Save 按鈕，打開保存新變量對話框,可將Kaplan-Meier表中的

15、主要內(nèi)容以新變量的形式保存在正在使用的數(shù)據(jù)文件中。選擇第1、2項。,Survival: 生存函數(shù)（survival function），是指病人經(jīng)歷t個單位時段之后仍存活的概率。生存函數(shù)在某時點的值就是生存率。Standard error of surv: 生存率的標(biāo)準(zhǔn)誤。,單擊Options 按鈕,Survival table(s)（ 默認(rèn)選擇項）。Mean and median survival（ 默認(rèn)選擇項）:平均生存期(me