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文檔簡介
1、鼠疫是由鼠疫耶爾森氏菌(以下簡稱鼠疫菌)引起的一種烈性傳染病,其具有傳染性強(qiáng)、病死率高、傳播速度快、自然疫源性等諸多特點(diǎn)。人類歷史上,曾經(jīng)發(fā)生過三次鼠疫大流行,引起數(shù)以億計(jì)人死亡,給人類帶來過沉重災(zāi)難。在我國,鼠疫被列為甲類傳染病。隨著現(xiàn)代醫(yī)學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,鼠疫疫情雖已得到有效控制,但近年來,動(dòng)物間鼠疫的流行區(qū)域不斷擴(kuò)大,人間鼠疫病例呈上升態(tài)勢。與此同時(shí),鼠疫菌作為一種典型的生物戰(zhàn)劑及生物恐怖制劑,時(shí)刻威脅著人類的安全。由此可見,鼠疫
2、的監(jiān)控對(duì)人類健康安全、經(jīng)濟(jì)發(fā)展和社會(huì)穩(wěn)定具有重要意義。
眾所周知,對(duì)鼠疫菌快速、有效的檢測是控制其傳染的重要手段。目前,對(duì)鼠疫菌的常規(guī)檢測主要包括細(xì)菌學(xué)檢測、免疫學(xué)檢測、分子生物學(xué)檢測等。細(xì)菌學(xué)檢測一般分四步進(jìn)行——顯微鏡鏡檢、細(xì)菌培養(yǎng)、鼠疫噬菌體裂解實(shí)驗(yàn)、動(dòng)物實(shí)驗(yàn)。該方法耗時(shí)長、需要大量人力物力,不適用于鼠疫菌大量篩查及現(xiàn)場檢測。分子生物學(xué)檢測,即通過體外擴(kuò)增特異性的核酸片段實(shí)現(xiàn)對(duì)鼠疫菌的檢測,該方法雖然具有快速、靈敏、特異
3、等優(yōu)點(diǎn),但其往往需要特定儀器才能進(jìn)行,且價(jià)格昂貴,操作不便。因此,不適用于偏遠(yuǎn)地區(qū)實(shí)驗(yàn)室及野外檢測。免疫學(xué)方法是一種基于抗原抗體特異性反應(yīng)的檢測方法,主要以膠體金、酶聯(lián)免疫吸附實(shí)驗(yàn)等方法為代表。這些方法具有操作簡便、安全性高、特異性好且靈敏度高等優(yōu)點(diǎn),但在檢測前一般都需要進(jìn)行增菌培養(yǎng),耗費(fèi)大量時(shí)間,并且該方法抗干擾能力較差。因此,建立一種可快速、高效、適用于偏遠(yuǎn)地區(qū),且抗干擾能力強(qiáng)的檢測方法十分重要。
環(huán)介導(dǎo)恒溫核酸擴(kuò)增技術(shù)(
4、loop-mediated isothermal amplification of DNA,LAMP)是由Notomi等人于2000年報(bào)道的一種分子生物學(xué)檢測新技術(shù)。此技術(shù)針對(duì)靶基因的4—6個(gè)特異性區(qū)域,分別設(shè)計(jì)特異性引物,在一種具備鏈置換活性的DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用下,在恒溫條件即可實(shí)現(xiàn)對(duì)目的基因快速、高效、特異性檢測。LAMP擴(kuò)增反應(yīng)過程中會(huì)形成大量的、白色焦磷酸鎂(Mg2P2O7)沉淀,因此,可
5、通過肉眼或運(yùn)用實(shí)時(shí)濁度儀檢測沉淀生成量的多少來判斷擴(kuò)增反應(yīng)進(jìn)行的程度。若在反應(yīng)前向反應(yīng)體系中加入鈣黃綠素這種復(fù)合熒光素,則可通過肉眼直接觀察反應(yīng)體系顏色是否由黃色變?yōu)榫G色來判斷反應(yīng)是否發(fā)生。
實(shí)際檢測中,待檢樣本通常是復(fù)雜的混合物,多種雜質(zhì)往往會(huì)對(duì)檢測結(jié)果產(chǎn)生干擾,難于直接進(jìn)行檢測。免疫磁珠技術(shù)(immunomagnetic beads techniquces)能將靶標(biāo)物與雜質(zhì)分離,從而實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)物的富集。免疫磁珠技術(shù)是20世紀(jì)
6、70年代興起的一種基于免疫學(xué)原理的分離技術(shù)。此技術(shù)是一種利用具有超順磁性的磁性微球作為載體對(duì)目標(biāo)物進(jìn)行捕獲、富集的生物學(xué)技術(shù)。這種具有超順磁性的微球在經(jīng)過一系列活化后,并與生物基團(tuán)或者生物配體有效地結(jié)合在一起才可形成免疫磁珠,實(shí)現(xiàn)對(duì)待檢物的特異性分離。
本研究將免疫磁珠分離技術(shù)(immunomagnetic separation,IMS)與環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplifica
7、tion of DNA, LAMP)相結(jié)合,以LAMP特異性檢測為基礎(chǔ),以磁珠捕獲DNA或免疫磁珠捕獲菌體為條件,分別建立了磁珠捕獲DNA法結(jié)合環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)快速檢測鼠疫菌以及免疫磁珠捕獲菌體法結(jié)合環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)快速檢測鼠疫菌。分別對(duì)兩種檢測方法的LAMP檢測體系、磁珠捕獲體系、免疫磁珠制備體系進(jìn)行優(yōu)化,以及分別對(duì)每種方法的靈敏度、特異性、抗干擾能力、實(shí)際樣本應(yīng)用等多個(gè)方面均進(jìn)行了全面的評(píng)價(jià)。
本研究基于鼠疫菌3a保守
8、序列,設(shè)計(jì)LAMP引物,并以擴(kuò)增效率、特異性為標(biāo)準(zhǔn)從設(shè)計(jì)出的多組引物中篩選出最佳引物。并以篩選出的最佳引物為基礎(chǔ),對(duì)LAMP反應(yīng)體系中,Bst DNA聚合酶加入量、dNTPs加入量、鎂離子濃度等反應(yīng)條件進(jìn)行了優(yōu)化,最終建立了25μl體積的LAMP反應(yīng)體系,具體為:10×Thermopol buffer2.5μl,MgSO4(100mM)1.5μl,dNTP MIX(2.5mM)14μl,F(xiàn)IP(100mM)0.4μl,BIP(100mM
9、)0.4μl,F(xiàn)3(10mM)0.5μl,B3(10mM)0.5μl,LF(10mM)0.2μl,Bst DNAPolymerase,Large Fragment(8,000U/ml)1μl,水3μl,模板1μl。65℃反應(yīng)60min。并對(duì)建立的LAMP反應(yīng)體系在鼠疫菌檢測方面的靈敏度、特異性及抗干擾能力等性能進(jìn)行評(píng)價(jià)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,建立的LAMP反應(yīng)體系在鼠疫菌檢測方面有良好的特異性、抗干擾能力,靈敏度可達(dá)100copy/ml。
10、> 在磁珠捕獲DNA法結(jié)合LAMP技術(shù)快速檢測鼠疫菌研究中,將LAMP技術(shù)與磁珠捕獲DNA技術(shù)相結(jié)合,依據(jù)磁珠加入量、DNA富集程度對(duì)磁珠捕獲DNA體系進(jìn)行優(yōu)化,得到最佳體系。并對(duì)該檢測方法的靈敏度、特異性及抗干擾能力進(jìn)行了評(píng)價(jià),將該方法與常規(guī)PCR檢測技術(shù)進(jìn)行對(duì)比。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法特異性良好,對(duì)鼠疫菌檢測靈敏度可達(dá)10copy/ml,較常規(guī)PCR技術(shù)靈敏度高100倍。在脾臟、肺臟干擾情況下其靈敏性依然可以達(dá)到10copy/ml,
11、比常規(guī)PCR技術(shù)高出1000倍。在肝臟懸液干擾情況下該檢測方法的靈敏度稍有降低至103copy/ml,仍然比常規(guī)PCR技術(shù)高出10倍。
在免疫磁珠捕獲菌體法結(jié)合LAMP技術(shù)快速檢測鼠疫菌研究中,首先,基于實(shí)驗(yàn)室已有的鼠疫菌F1單克隆抗體,采用EDC/NHSS化學(xué)偶聯(lián)法將鼠疫菌抗體與磁珠相偶聯(lián)制備免疫磁珠。按實(shí)際捕獲效率、抗體偶聯(lián)率、抗體添加量、檢測中免疫磁珠用量等進(jìn)行了優(yōu)化,并對(duì)該檢測方法的靈敏度、特異性、抗干擾能力等方面進(jìn)行
12、了全面評(píng)價(jià),并將該方法與常規(guī)PCR檢測技術(shù)進(jìn)行對(duì)比。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法可特異地捕獲待檢混合物中的鼠疫菌,靈敏度為1copy/ml,較常規(guī)PCR技術(shù)靈敏度高100倍。在脾臟、肺臟干擾情況下其靈敏性為10copy/ml,其靈敏度比常規(guī)PCR技術(shù)高出1000倍。在肝臟干擾情況下靈敏性為100copy/ml,較常規(guī)PCR技術(shù)高100倍。隨后,采用滅活鼠疫菌為免疫原免疫小鼠,經(jīng)小鼠免疫、細(xì)胞融合、雜交瘤細(xì)胞篩選、細(xì)胞株克隆、腹水制備、抗體純化等
13、步驟制備出不同于F1抗體的鼠疫菌單克隆抗體,并將制備出的單抗應(yīng)用于免疫磁珠捕獲菌體法結(jié)合環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測鼠疫菌。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,制備出的抗體效價(jià)較高,且在檢測方法上有較好的靈敏度,可應(yīng)用于鼠疫菌的快速檢測。
本研究建立了兩種較為成熟的鼠疫菌檢測方法,這兩種檢測方法操作簡便、無需大型儀器、成本低廉,且具有較高的靈敏性、極強(qiáng)的特異性、很強(qiáng)的抗干擾能力,所以,這兩種檢測技術(shù)適合用于現(xiàn)場篩查、野外作業(yè)及偏遠(yuǎn)地區(qū)檢測工作的應(yīng)用。
14、r> 在現(xiàn)有免疫學(xué)檢測方法中,表達(dá)于鼠疫菌表面的F1抗原已成為唯一的靶標(biāo)物,而鼠疫菌只有以37℃人工培養(yǎng)或哺乳動(dòng)物體內(nèi)為條件才可在表面形成F1抗原,而鼠疫菌最適生長溫度為26℃,且自然環(huán)境中溫度遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于37℃,因此,自然環(huán)境下,鼠疫菌表面并不表達(dá)F1抗原。這一現(xiàn)象的存在,對(duì)現(xiàn)有鼠疫菌免疫學(xué)方法的檢測帶來諸多不便。本研究制備出的單克隆抗體對(duì)表面不表達(dá)F1抗原的鼠疫菌有良好的特異性,彌補(bǔ)了現(xiàn)階段免疫學(xué)檢測的漏洞,為鼠疫菌的檢測提供了更廣闊
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