番茄HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族生物信息學(xué)分析及HD-ZipⅠ亞族抗逆相關(guān)基因鑒定分析.pdf

1、隨著番茄種植規(guī)模的不斷擴(kuò)大，高鹽、干旱、低溫、病原菌等各種非生物和生物脅迫對(duì)番茄的生長(zhǎng)及生產(chǎn)造成了嚴(yán)重的危害。目前為止，大量研究顯示，植物轉(zhuǎn)錄因子在植物適應(yīng)和抵御各種非生物及生物脅迫的過(guò)程中起著重要的調(diào)控作用。近年來(lái)對(duì)于植物不同轉(zhuǎn)錄因子家族的研究越來(lái)越深入，HD-Zip是植物中特有的一類轉(zhuǎn)錄因子，參與植物多種生物功能，尤其對(duì)植物在非生物脅迫下的應(yīng)答反應(yīng)有著重要調(diào)控作用。
　　在本研究中，對(duì)番茄HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子基因家族進(jìn)行了生物

2、信息學(xué)分析，對(duì)番茄HD-Zip蛋白家族的成員進(jìn)行了分類、理化特性、保守區(qū)、基因結(jié)構(gòu)、染色體分布、二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)的分析。同時(shí)對(duì)番茄HD-ZipⅠ亞家族組織特異性及非生物脅迫下的表達(dá)模式進(jìn)行了分析，對(duì)應(yīng)答表現(xiàn)明顯的兩個(gè)基因進(jìn)行了基因沉默分析。為番茄HD-Zip基因家族在非生物脅迫應(yīng)答過(guò)程中的調(diào)控功能研究提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:
　　鑒定出番茄HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族共包含58個(gè)成員（SlHZ1-SlHZ58），分為SlHD-Z

3、ipⅠ-Ⅳ亞家族。這些基因不均勻的分布在12條染色體上，番茄HD-Zip基因擴(kuò)增方式主要為片段復(fù)制，家族成員的二級(jí)結(jié)構(gòu)主要為螺旋，三級(jí)結(jié)構(gòu)具有相似性。
　　對(duì)HD-ZipⅠ亞族15個(gè)基因進(jìn)行了組織特異性表達(dá)分析，結(jié)果顯示，這些成員在根、莖、葉、花以及果實(shí)中均有不同程度的表達(dá)。大部分基因都能在根中進(jìn)行表達(dá)，而SlHZ30基因僅在花中表達(dá)。
　　逆境脅迫表達(dá)分析中，在鹽脅迫處理下14個(gè)基因表達(dá)上調(diào)，1個(gè)基因（SlHZ14）表達(dá)下