SET基因家族的分子進化機制和基于RNa-Seq技術的擬南芥花轉錄組學研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目錄目錄Ej錄I摘要1Abstract3前言5一日U舌第一部分研究綜述和背景。711植物基因組研究現(xiàn)狀7111基因組重復7112基因組的進化速率lO12基因家族13121基因家族的定義13122植物基因家族1413基因重復17131基因重復機制18132基因重復后的保留19133基因重復后分化機制19134基因重復后表達分化2l14基因家族進化模型2215轉錄組技術發(fā)展及應用23151轉錄組技術發(fā)展23152RNASeq技術的應用241

2、53花發(fā)育轉錄組研究現(xiàn)狀2516參考文獻26第二部分SET基因家族的分子進化3321摘要。3322引言3323材料與方法38231基因家族成員識別38232多序列聯(lián)配和構建系統(tǒng)發(fā)生樹39233基因在染色體組上的定位和基因重復類型分析40目錄第四部分基于RNASeq技術的擬南芥花轉錄組學研究。8741摘要。8742慧::=lIillllllllllllllllllllllllllllllllllllllll87lllllll43材料與方法

3、‘Y270611589431樣本收集及測序89432樣本與基因組比對89433計算基因表達量及差異表達基因89434Zscore計算90435基因家族和GO注釋9044結果和討論90441RNASext技術檢測到大量基因表達90442RNA—Seq技術比傳統(tǒng)芯片多檢測到的8512個基因93443擬南芥至少有多少基因表達95444全局分析花發(fā)育的轉錄組96445鑒定參與花發(fā)育過程中的基因98446不同的花發(fā)育階段中富集調控基因99447一

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