絲氨酸二肽側(cè)鏈與不同種類分子形成氫鍵的理論研究.pdf

1、氫鍵在化學(xué)、生命科學(xué)和功能材料等領(lǐng)域起到至關(guān)重要的作用,對(duì)其能量以及結(jié)構(gòu)的分析非常重要。本文運(yùn)用MP2方法,計(jì)算不同小分子與絲氨酸二肽側(cè)鏈形成氫鍵的二聚體結(jié)構(gòu)、能量以及勢(shì)能曲線。主要工作可以歸納如下方面:
　　 1.主要研究四種氫鍵類型:C=O…H-O、O…H-O、S…H-O以及N…H-O。通過(guò)計(jì)算發(fā)現(xiàn),N…H-O型氫鍵能量最穩(wěn)定；當(dāng)受體分子中O原子兩側(cè)基團(tuán)相同時(shí),sp3雜化的O原子形成氫鍵比sp2雜化的O原子形成氫鍵更穩(wěn)定。<

2、br>　　 2.對(duì)于C=O…H-O型氫鍵,小分子作為質(zhì)子受體,羰基上的基團(tuán)為供電子基團(tuán)時(shí),羰基的鍵長(zhǎng)伸長(zhǎng),質(zhì)子供體上羥基的鍵長(zhǎng)伸長(zhǎng)；當(dāng)取代基為吸電子基團(tuán)時(shí),羰基的鍵長(zhǎng)縮短,質(zhì)子供體上羥基的鍵長(zhǎng)縮短。
　　 對(duì)于O…H-O和S…H-O型氫鍵,小分子作為質(zhì)子受體,當(dāng)O(S)原子上連接供電子基團(tuán)時(shí),質(zhì)子供體上羥基的鍵長(zhǎng)伸長(zhǎng)；當(dāng)O(S)原子上連接吸電子基團(tuán)時(shí),質(zhì)子供體上羥基的鍵長(zhǎng)縮短。
　　 3.采取Sun的參數(shù)對(duì)14種二聚體