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1、1中文 中文 3195 字出處: 出處:Lin L, Prescott M S, Zhu Z, et al. Identification and characterization of a 19q12 amplicon in esophageal adenocarcinomas reveals cyclin E as the best candidate gene for this amplicon.[J]. Cancer Resea
2、rch, 2000, 60(24):7021-7.對(duì)食管癌 對(duì)食管癌 19q12 19q12 擴(kuò)增子的鑒定和描述顯示 擴(kuò)增子的鑒定和描述顯示 Cyclin Cyclin E 是這 是這個(gè)擴(kuò)增子的最佳候選基因 個(gè)擴(kuò)增子的最佳候選基因摘要腫瘤基因組擴(kuò)增常與癌基因和其他的腫瘤相關(guān)基因拷貝數(shù)增加有關(guān)。我們用一種二維全基因掃描技術(shù)來(lái)檢測(cè)食管癌中基因擴(kuò)增事件。腫瘤雙向凝膠上的多拷貝基因片斷被克隆,包含這個(gè)片斷的擴(kuò)增產(chǎn)物用 Southern blot
3、 來(lái)確定。相應(yīng)的 DNA 序列用 BLAST 匹配到BAC 毗連 DNA 序列,后者用電子 PCR 定位在 19q12。我們實(shí)驗(yàn)室最近用序列標(biāo)記位點(diǎn)擴(kuò)增圖的方法描述這個(gè)擴(kuò)增子。從 11 個(gè)胃癌和 65 個(gè)賁門(mén)癌病例中的基因組 DNA 用定量 PCR在克隆的片段上 11 個(gè)序列標(biāo)記位點(diǎn)附近檢測(cè) 19q12 擴(kuò)增子。擴(kuò)增子在 D19S919 和D19S882 之間。這個(gè)區(qū)域包括 Cyclin E 基因。在 14 個(gè)表達(dá)的 ESTs 覆蓋的
4、區(qū)域中用定量RT-PCR 時(shí)分析潛在的基因過(guò)表達(dá)。其中有 7 個(gè) ESTs 既有擴(kuò)增又有過(guò)表達(dá)。在這 7 個(gè)ESTs 中,Cyclin E 基因擴(kuò)增和過(guò)表達(dá)的頻率最高,這使我們把和擴(kuò)增的區(qū)域限制在137 kb 的 DNA,含有Cyclin E 序列,但無(wú)相鄰的 ESTs。ESTs 10, 11, 12,和 14 序列與 AC008507 匹配。發(fā)現(xiàn)ESTs 3, 7, 8 和 9 被包含在 AC010513。ESTs 4 和 5 在
5、AC010505 (表 3)。對(duì)具有 ESTs 的微小關(guān)鍵區(qū)的分割和物理作圖清楚的顯示,Cyclin E 位于 ESTs7, 8,9 和 ESTs 10,11 之間,而不是在 GeneMap’99 中顯示的在 ESTs5 和 ESTs7 之間。而且,一個(gè)未知的 ESTs,sts-X95406,位于 ESTs9 和 ESTs10 之間,與 Cyclin E 同源。在這 7 個(gè)擴(kuò)增和過(guò)表達(dá)的 ESTs中,ESTs4,5,7 的擴(kuò)增包含 1
6、9q12 擴(kuò)增子。說(shuō)明 Cyclin E 是基因擴(kuò)增和 mRNA 過(guò)表達(dá)頻率最高。討論我們用雙向基因掃描方法檢測(cè) 19q12 上 NotI 片段的擴(kuò)增。這些說(shuō)明 19q12 擴(kuò)增子的特性在食管癌和胃癌的發(fā)展過(guò)程中起著重要作用。用 QG-PCR 分析 STS 擴(kuò)增作圖的方法顯示19q12 擴(kuò)增子的微小關(guān)鍵區(qū)域在 D19S919 和 D19S882 之間。用定量 RT-PCR 分析在微小區(qū)域的 14 個(gè) ESTs 來(lái)確定包含 19q12 擴(kuò)
7、增子的腫瘤的表達(dá)類(lèi)型。Cyclin E 是基因擴(kuò)增和過(guò)表達(dá)頻率最高在被檢查的腫瘤中,而且定位于 19q12 擴(kuò)增子<300-kb 的核心區(qū)域。Cyclin E的基因擴(kuò)增和過(guò)表達(dá)可能是早期事件,因?yàn)樵?Barrett’s 粘膜化生和 50% (5 of 10)的 II 期腫瘤均有這個(gè)擴(kuò)增子的過(guò)表達(dá)和擴(kuò)增。本研究第一次全面地描述了 19q12 擴(kuò)增子的特性,也第一次對(duì)這個(gè)包含 Cyclin E 的<300-kb 的核心區(qū)域進(jìn)行物
8、理作圖?;驍U(kuò)增使基因數(shù)量選擇性增加。由于擴(kuò)增涉及到一個(gè)大的染色體片斷,所以有相鄰基因的共擴(kuò)散 24。盡管程序化的基因擴(kuò)增是低等生物的正常發(fā)展過(guò)程中的一部分(25 , 26),但在哺乳動(dòng)物暴露于細(xì)胞毒藥物和發(fā)癌過(guò)程中有顯著的不規(guī)律的基因擴(kuò)增(28 , 29)。因此,探討腫瘤基因擴(kuò)增對(duì)發(fā)現(xiàn)起主要作用的癌基因和腫瘤相關(guān)基因有著重要的作用。在本研究和其他的研究中雙向 RLGS 方法是達(dá)到這一目的的有效的方法(9 , 10 , 18)。我們運(yùn)用
9、的 STS擴(kuò)增圖的方法有效的得出微小關(guān)鍵區(qū)域的范圍,從而縮小了選擇潛在候選基因的范圍(10)。Cyclin E 是 cdk2-E 復(fù)合體的調(diào)節(jié)亞基,后者在 G1 期到 S 期之間確實(shí)細(xì)胞進(jìn)入 S 期(11 , 12)。在本研究中,Cyclin E 基因的擴(kuò)增是含有 Cyclin E 擴(kuò)增子腫瘤 cyclin E mRNA 和蛋白水平上調(diào)的基礎(chǔ)。在果蠅屬卵子發(fā)生中 Cyclin E 的出現(xiàn)需要另一個(gè)基因 chorion 的擴(kuò)增(30)。
10、解除管制的 Cyclin E 可能是促使腫瘤基因不穩(wěn)定的一個(gè)因素(34 , 35)。在 cyclin D1 不足時(shí),Cyclin E 可起類(lèi) cyclin D1 作用,解除管制的 cyclin D1 作用類(lèi)似癌基因(36),在許多人類(lèi)腫瘤中均有擴(kuò)增和過(guò)表達(dá)(37 , 38,39 )。在卵巢(12.5–21%),結(jié)腸(9.4%),和胃 (15.6%)癌(13, 14, 15, 16)中均發(fā)現(xiàn)有 Cyclin E 擴(kuò)增。在 Barrett’
11、s 粘膜化生和腺癌中都報(bào)道了有 Cyclin E 蛋白的表達(dá),而且隨著 Barrett’s 糜爛和潰瘍周?chē)掀さ脑偕驮鲋?,核染色加?40)。cyclin E mRNA 和蛋白的過(guò)表達(dá)在化學(xué)導(dǎo)致的大樹(shù)食管癌中也有過(guò)表達(dá)(41)。總之,先前的證據(jù)和我們的研究結(jié)果表明,Cyclin E 是 19q12 上擴(kuò)增事件最可能的候選基因。腫瘤的基因擴(kuò)增通常不只包括核心區(qū)域,而是可能擴(kuò)展到幾百 k,甚至幾兆個(gè)堿基(42 , 43)。一個(gè)假說(shuō)認(rèn)為,
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