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文檔簡介
1、背景:
泌尿系結(jié)石是一種病因復(fù)雜的全球性疾病,其中草酸鈣結(jié)石是最常見的結(jié)石類型。由于發(fā)病機制不明,缺乏有效的預(yù)防手段,泌尿系結(jié)石的發(fā)病率及復(fù)發(fā)率較高。微小核糖核苷酸(microRNA,miRNA)是一類非編碼的單鏈小分子RNA,可通過促進信使RNA(messenger RNA,mRNA)降解和/或抑制其翻譯從而發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后基因表達的調(diào)控功能,其表達量的改變與各種生理及病理狀態(tài)密切相關(guān)。然而迄今為止,miRNA在草酸鈣結(jié)石形成中的
2、作用及具體機制尚未得到證實。目的
比較草酸鈣結(jié)石模型大鼠與正常大鼠腎組織miRNA表達譜和mRNA表達譜的差異,篩選出差異性表達的miRNA和mRNA,并通過預(yù)測差異性表達的miRNA所調(diào)控的靶基因,初步分析miRNA在草酸鈣結(jié)石形成過程中的功能及相關(guān)機制,為進一步研究提供理論依據(jù)和實驗基礎(chǔ)。
方法:
將16只6—8周齡的雄性SD大鼠隨機分為兩組,每組8組。正常組每天自由飲水,造模組使用乙二醇和氯化銨誘導(dǎo)法
3、構(gòu)建大鼠腎草酸鈣結(jié)石模型,28天后收集大鼠24小時尿液并處死大鼠提取腎臟組織標本進行檢驗以評估造模成功性。提取兩組大鼠腎皮質(zhì)組織總RNA,應(yīng)用微陣列芯片檢測其miRNA及mRNA表達譜,篩選出兩組間差異表達的miRNA和mRNA,運用實時定量熒光聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)驗證芯片結(jié)果,并通過 TargetScan等數(shù)據(jù)庫及 mRNA差異表達譜結(jié)果預(yù)測差異性表達miRNA調(diào)控的靶基因,應(yīng)用Gene Ontology數(shù)據(jù)庫和KEGG信號
4、通路數(shù)據(jù)庫初步分析miRNA及其靶基因在草酸鈣結(jié)石形成過程中的功能及作用機制。
結(jié)果:
造模組大鼠24小時尿液草酸排泄量相比正常組更高,而尿鈣則較低。偏光顯微鏡下觀察腎臟組織切片,正常組未見草酸鈣晶體,造模組可見大量草酸鈣晶體。微陣列芯片結(jié)果表明,兩組之間共38個miRNA表達有顯著差異(與正常組相比,造模組上調(diào)18個,下調(diào)20個);兩組之間共2728個mRNA表達有顯著差異(與正常組相比,造模組上調(diào)1350個,下調(diào)
5、1378個)。選取15個差異表達的miRNA和10個mRNA進行qRT-PCR驗證,結(jié)果表明與芯片結(jié)果基本吻合,芯片檢測結(jié)果可靠。預(yù)測34個差異表達的miRNA共調(diào)控328個靶基因表達,Gene Ontology分析及KEGG信號通路分析表明這些靶基因與離子轉(zhuǎn)運、炎癥損傷、氧化應(yīng)激等方面密切相關(guān),并可能通過細胞因子-細胞因子受體相互作用,縫隙連接,細胞粘附,趨化因子信號通路等相關(guān)的生物學通路參與結(jié)石形成的過程。
結(jié)論:
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