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1、M I N I N G o F E L I T E A L L E L E S F o R o U T C R o S S I N GR E L A T E D T R A I T S I N R I C E ( O R V Z a S A T I V A L ．)T H R o U G H A S S O C I A T I O N A N A L Y S I SC a l e bM a n a m i k B r e r i aA

2、T h e s i sS u b m i t t e d t oN a n j i n g A g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t yI nP a r t i a lF u l f i l l m e n t o f R e q u i r e m e n t s f o r t h eM a s t e r o f S c i e n c eD e g r e e( C r o p G e n

3、 e t i c sa n d B r e e d i n g )S u p e r v i s e dB yP r o f e s s o r H o n g D e —L i nS t a t e K e y L a b o r a t o r yo f C r o p G e n e t i c sa n dG e r m p l a s mE n h a n c e m e n tN a n j i n g A g r i c

4、u l t u r a lU n i v e r s i t yN a n j i n g 2 1 0 0 9 5 ，P ．R ．C h i n aT a b l e o f C o n t e n t sT a b l e o f C o n t e n t sA B S T R A C T ?????????????????????????????????????????．IL i s to f A b b r e v i a t

5、i o n s ???．????????????????????．????????????．．VC h a p t e r 1 ：L i t e r a t u r eR e v i e w ????????????????????????????????11 ．1 H y b r i d R i c e i nC h i n a ?????????????????????????????????11 ．2 R i c e F l o

6、w e r i n g H a b i t s ，O u t - C r o s s i n gT r a i t sa n d G e n e t i cR e s e a r c h P r o g r e s s ????21 ．3 R i c e F l o w e r L a y e rS 觚t u r e ，F(xiàn) h g L e a f T r a i t sa n d I t sG e n e t i c R e s e a

7、 r c hP r o g r e s s ?．31 ．4 C o n c e p t sa n d P r i n c i p l e so f A s s o c i a t i o n A n a l y s i s ??????????????????．71 ．5 B a s i cM e t h o d s o f A s s o c i a t i o n A n a l y s i s ??????????????????

8、??．???91 ．6 O b j e c t i v e so f t h e S t u d y ????????．??????????．???????．?????11C h a p t e r 2 ：M a t e r i a l sa n d M e t h o d s ????????????????????????????．．1 32 ．1 T e s tM a t e r i a l s ?????????????????

9、???????????????????l ：；2 ．2 T e s tM e t h o d s ????????????????????????????????????．1 72 ．3 D N A E x t r a c t i o na n d P C R A m p l i f i c a t i o n ．．?．?．????．?．．?．??．．?．．?．?．?．?．?．．1 72 ．4 D a t a A n a l y s i

10、 s ????????????????????????????????????．2 22 ．5 M e a s u r e o f L i n k a g e D i s e q u i l i b r i u m ?．?．?．．?．?．．??．??．???．．?．．．????．?．．?2 32 ．6 P o p u l a t i o nS 臼m c t I l r e ????????????????????????????????

11、．．2 32 ．7 I d e n t i f y i n gM o l e c u l a r M a r k e r s A s s o c i a t e d 、析m T r a i t s ???????????????2 42 ．8 I d e n t i f y i n gE l i t e A l l e l e s A s s o c i a t e d w i t h T r a i t s ???．．?．??．???

12、．．．．??．．?．．．??2 4C h a p t e r 3 ：R e s u l t s a n d A n a l y s i s ．．．．．．．．．．．．．．?．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．?．．．．．．．．．．．．．．．。．．2 73 ．1 D e s c r i p t i v eS t a t i s t i c sa n d H e r i t a

13、 b i l i t y o f O u t - C r o s s i n g T r a i t sw i t h i n t h e P o p u l a t i o n．??．??．．?．?．???．?．?．?．?．．???．?．．?．?．?．??．?．?．??．．?．??．．?．。?．?．?．?．。?：Z 73 ．2 F r e q u e n c y D i s t r i b u t i o no f T r a i t

14、 sa c r o s st h e2 Y e a r s ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．2 83 ．3 P h e n o t y p i cC o r r e l a t i o n sa m o n g T r a i t s ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．