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1、M I N I N G o F E L I T E A L L E L E S F o R G R A I N S I Z E A N D W E I G H TI N R I C E ( O R Y Z A S A T I V A L ．)W i s d o m M a w u l i E d z e s iA T h e s i sS u b m i t t e d t oN a n j i n g A g r i c u l t

2、u r a lU n i v e r s i t yI nP a r t i a lF u l f i l l m e n t o f R e q u i r e m e n t s f o rt h eM a s t e ro f S c i e n c e D e g r e e( C r o p G e n e t i c sa n d B r e e d i n g )S u p e r v i s e dB yP r o f

3、e s s o r H o n g D e —L i nS t a t eK e y L a b o r a t o r yo f C r o p G e n e t i c sa n dG e r m p l a s mE n h a n c e m e n tN a n j i n g A g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t yN a n j i n g 2 1 0 0 9 5 ，P ．R

4、．C h i n aC o m p l e t e d i nM a y 1 5 ，2 0 1 5T a b l eo f C o n t e n t sT a b l e o f C o n t e n t sA B S T R A C T ?????????????????????????????????????????????．．IL i s to f A b b r e v i a t i o n s ??．．．．．．．．?．．

5、．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．?．．．．．????．????．????．．．．?．．．．．．．．VC H A P T E R 1 L I T E R A n H i E R E V I 邑W ???????????????????????????????11 ．1 G l o b a l R i c eP r o d u c t i o n a n dM a r k e t I m

6、p a c t ??????????????????????????11 ．2G l o b a lT r a d e a n d P o l i o i e so f R i c e ?????????????????．??．???????????．21 ．3 C h i n a ’sR i c eM a r k e t ???????????．??????????????????????????．．31 ．4P h y s i c

7、a lQ u a l i t i e so f R i c e C u l t i v a r s a n dR e g i o n a l D i s t r i b u t i o nP r e f e r e n c e ??????????41 ．5G e n e t i c R e s e a r c h o f E l i r e A l l e l e s M i n i n g ?????????????????????

8、??????61 ．6M o d e l s a n dP r i n c i p l e so f A s s o c i a t i O l lA n a l y s i s ????????????????????????71 ．7 M e t h o d s o f A s s o c i a t i o n A n a l y s i s ．???????????????????????????????81 ．8O b j e

9、 c t i v e so f t h e S m d y ?．?????????????．?????????，????????????1 0C H A P T E ] R 2 M A T E R I A I ．，SA N D M E T H O D S ??????????????????????????．1 l2 ．1 P l a n t M a t e r i a l s ?????????????????????????????

10、??．?????????112 ．2F i e l d P l a n t i n ga n d T r a i t I n v e s t i g a t i o n M e t h o d s ???????????????????????．1 12 ．3D N A e x t r a ．i o na n d P C R a m p l i f i c a t i o n ???????????????????????????．1

11、12 ．4D a t a A n a l y s i s ????????????．???????????????????????????．?．1 32 ．5M e a s u r eo f L i n k a g e D i s e q u i l i b r i u m ????????????????????????????．?1 42 ．6P o p u l a t i 0 1 3S 仃u c t u r e ?????????

12、????????????????????????????．1 42 ．7 I d e n t i f y i n g M o l e c u l a r M a r k e r s A s s o c i a t e dw i t h n 鼉i t s ?????????????????1 52 ．8 I d e n t i ～i n g E l i t eA l l e l e s A s s o c i a t e d w i t

13、h T r a i t s ???????????????????．．1 52 ．9 D e s i g n o f N o v e l P a r e n t a lC o m b i n a f i o n s ??????????．????????????????．．1 6C H A P T E R 3 R E S U L T S A N D A N A L Y S I s ????????????????????????????

14、1 73 ．1 D e s c r i p t i v eS t a t i a i c sA n d H e r i t a b i l i t yo f G r a i n S i z e sa n d W e i g h t w i t h i nt h eP o p u l a t i o n ?．．1 73 ．1 ．1P h e n o t y p i c e v a l u a t i o n s ?????????????

15、????????????????????．．1 73 ．2 F r e q u e n c y D i s t r i b u t i o n o f G L ，G W ，G T ，G L ／G W a n d T G W a c r o s s t h e2 Y e a r s ?????1 83 ．3 P h e n o t y p i c C o r r e l a t i o n sa m o n g T r a i t s ?

16、???????????????????????????2 03 ．4M o l e c u l a r M a r k e r sD i v e r s i t y ．．．．．．．??．．．．．??．???．．．??．．．．．．．．．．．．．．．．．．?．．．．．．．．．．．．．．．．．．．?．．．?．．．．．．．2 03 ．5 P o p u l a t i o n S t r u c t u r e ????????????????

17、???．??????????????????2 63 ．6G e n e t i c D i v e r s i t y a n d P I C f o r t h eS u b p o p u l a t i o n s ??????????????????????2 83 ．7 L i n k a g e D i s e q u i l i b r i u m ??????????????????．?????????????????

18、．2 83 ．8 A s s o c i a t i o n M a p p i n g o f S S R L o c i w i t h5s e e dg r a i nC o m p o n e n t s T r a i t s ??????????3 13 ．9 S S R L o c i A s s o c i a t e d w i t hG r a i n L e n g t h ???????．．??．????．???