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1、用NTSYSpc2.10e制作聚類圖(實(shí)例講解)1.在EXCEL表中先建立一個(gè)0,1構(gòu)成的矩陣:按如下規(guī)則輸入數(shù)據(jù),A1=1表示有帶記為1,B1=38表示AFLPSSRRFLP有38個(gè)條帶,C1=60表示樣本數(shù),D1=0表示無帶記為0。如圖(每個(gè)列為一個(gè)樣本的條帶情況):2.將EXCEL數(shù)據(jù)復(fù)制粘貼到文本格式,命名保存sz2.txt。3.打開ntsys軟件的將文本文件導(dǎo)入軟件中:點(diǎn)Similarity選中Qualitativedatai
2、nputfile欄導(dǎo)入保存的sz2.txt。在Outputfile欄輸入sz3,點(diǎn)Compute,會(huì)出現(xiàn)一個(gè)報(bào)告:4.點(diǎn)Clustering選SAHNinputfile欄導(dǎo)入sz3.NTSOutputtreefile欄輸入sz4點(diǎn)Compute,又會(huì)出現(xiàn)一個(gè)報(bào)告:因?yàn)槟J(rèn)設(shè)置顯示樣本數(shù)是30,需改變設(shè)置為60點(diǎn)聚類圖的Options選plotoptions在Phenogram中的OTUspage欄改30為60:點(diǎn)OK全部樣本的聚類圖就出
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