醫(yī)學(xué)信息獲取與管理之2011

1、南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)情報學(xué)教研室 張政寶Tel: 020-61648054 E-mail: newinfoman@163.com,醫(yī)學(xué)信息獲取與管理緒論,緒論,課程簡介信息、知識、情報、文獻的基本概念文獻的類型檢索的概念檢索語言及其應(yīng)用檢索策略與檢索技術(shù),課程簡介,內(nèi)容體系課程安排上網(wǎng)賬號精品課程網(wǎng)站：http://jpkc.fimmu.com/yxxx/,觀察兩張照片有什么區(qū)別？,蘇聯(lián)最早一批宇航員合影,后排站著

2、的格里戈里耶·奈爾尤伯夫(上圖)后來被人從照片上抹去(右圖)。,失蹤的宇航員,,馬家窯。人抬、肩扛。 1959國慶觀禮臺,信息分析無處不在,日本從新聞聯(lián)播和電視劇著手研究中國外國借用互聯(lián)網(wǎng)圖片搜索引擎捕捉中國情報中國電視劇也成日本民間智囊研究課題地質(zhì)專家憑錄像巖石判斷：拉登藏身阿西南深谷,信息素養(yǎng)：信息檢索其實離我們很近,廣州某公司在報紙上刊登了一則招聘營銷人員的招聘啟事，應(yīng)聘條件、工資待遇等內(nèi)容一應(yīng)俱全，參加筆試、面

3、試等要求也非常明確，可通篇啟事從頭看到尾，就是沒有發(fā)現(xiàn)應(yīng)聘的聯(lián)系方法。 多數(shù)人認(rèn)為這是招聘單位疏忽或是報社排版錯誤，于是，便耐心等著報社刊登更正或補充說明。 有3位應(yīng)聘者見招聘的崗位適合自己，不是等待：小王通過因特網(wǎng)搜索小張立即通過114查號臺查詢 小劉依稀記得該公司在某商業(yè)區(qū)有一個廣告牌，于是騎車圍著城區(qū)轉(zhuǎn)了一下午，終于找到了廣告牌,信息、知識、情報、文獻的基本概念,信息：信息是物質(zhì)存在的一種方式、形態(tài)或運動狀態(tài)，是事物的一

4、種普遍屬性，一般指數(shù)據(jù)、消息中包含的意義，可以使消息中所描述事件的不定性減少。知識：人們在改造世界的實踐中所獲得的認(rèn)識和經(jīng)驗的總和，是人的大腦通過思維重新組合的系統(tǒng)化的信息集合。情報：為解決一個特定的問題所需要的激活了的、活化了的特殊知識或信息。情報的基本屬性：知識性、傳遞性、效用性,信息、知識、情報、文獻的基本概念,文獻：記錄有知識的一切載體。 （GB3792.1-83《文獻著錄總則》）文獻的三個基本要素：①記錄知識的具

5、體內(nèi)容；②記錄知識的手段，如文字、圖形、符號、聲頻、視頻等；③記錄知識的物質(zhì)載體，如紙張、光盤、錄像帶等；信息、知識、情報與文獻的關(guān)系,文獻的類型,目,一、文獻的類型（按載體類型分）:印刷型：傳統(tǒng)的圖書、期刊等視聽型：唱片、錄音帶、錄像帶等縮微型：縮微膠卷、縮微膠片等數(shù)字型（或電子型）：電子圖書、電子期刊、數(shù)據(jù)庫等,文獻的類型,二、文獻的級別（按文獻加工深度分）一次文獻：即原始文獻，指著者以其本人的研究成果（如實驗、觀察

6、、調(diào)查研究等的結(jié)果）為基本素材寫成的原始創(chuàng)作。例如：專著、期刊論文、研究報告、會議文獻、專利文獻、學(xué)位論文、會議論文、譯文、電子期刊、電子圖書等。,文獻的類型,二、文獻的級別（按文獻加工深度分）二次文獻：將大量無序、分散的一次文獻收集、整理、加工、著錄，并按一定的順序加以編排，形成可供檢索一次文獻線索的新的文獻形式。因其檢索功能而稱之為檢索工具或檢索系統(tǒng)。例如：題錄、目錄、索引、文摘等。題錄：以期刊論文為例，加下劃線部分為文獻出

7、處。 題名/著者//期刊名.年,卷(期).–頁碼,文獻的類型,二、文獻的級別（按文獻加工深度分）三次文獻：圍繞某一專題，利用二次文獻的檢索，在吸取一次文獻內(nèi)容的基礎(chǔ)上形成的文獻。如綜述、述評、進展等期刊文獻和百科全書、年鑒、指南、手冊等參考工具書。綜述（Survey, Review）是指綜合分析和描述一定時間范圍內(nèi)某一學(xué)科或?qū)I(yè)科研發(fā)展和現(xiàn)狀，并預(yù)測未來的一類文獻。,文獻的類型,二、文獻的級別（按文獻加工深度分）*零次文

8、獻：未經(jīng)信息加工，直接記錄在載體上的原始信息，如實驗數(shù)據(jù)、試驗記錄、調(diào)查材料、設(shè)計草圖、私人筆記、口頭交流的信息等。,檢索的概念,檢索（Retrieval）：利用檢索工具查詢問題答案的全過程。文獻檢索（Literature retrieval）：指以獲取文獻為目的，科學(xué)地借助各種檢索工具，查詢相關(guān)文獻資料的過程。信息檢索（Information retrieval）：指從任何信息集合中查出所需信息的活動、過程和方法，有廣義和狹義兩種

9、理解。廣義的信息檢索還包括信息存儲，合稱信息存儲與檢索。狹義的信息檢索僅指信息的查找過程。,檢索語言及其應(yīng)用,檢索語言是信息存儲與檢索過程中描述信息特征和表達用戶信息提問的一種人工語言。它是根據(jù)文獻的外表特征或者內(nèi)容特征，把某些具有檢索意義的語言或符號加工編制成為文獻信息檢索服務(wù)的特殊語言。檢索語言的主要作用是對文獻的外表特征和內(nèi)容特征進行多層次描述，提供多種檢索途徑，以方便用戶從不同角度進行檢索查找。,檢索語言的結(jié)構(gòu),檢索語言,,

10、描述文獻外表特征,描述文獻內(nèi)容特征,,書刊篇名—題名索引（途徑）著者姓名—著者索引（途徑）文獻序號—序號索引（途徑）引用文獻—引文索引（途徑）,,體系分類語言—分類索引（途徑）主題語言（單元詞、關(guān)鍵詞、敘詞等）代碼語言（分子式、結(jié)構(gòu)式等）,分類語言,中國圖書館圖書分類法（中圖法）國際十進分類法（Universal Decimal Classification, UDC）美國國會圖書館圖書分類法（Library of Con

11、gress Classification, LC）,中圖法基本大類,A 馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想 B 哲學(xué) C 社會科學(xué)總論 D 政治、法律 E 軍事 F 經(jīng) 濟 G 文化、科學(xué)、教育、體育 H 語言、文學(xué) I 文學(xué) J 藝術(shù) K 歷史、地理,N 自然科學(xué)總論O 數(shù)理科學(xué)和化學(xué)P 天文學(xué)、

12、地球科學(xué)Q 生物科學(xué)R 醫(yī)藥、衛(wèi)生S 農(nóng)業(yè)科學(xué)T 工業(yè)技術(shù)U 交通運輸V 航空、航天X 環(huán)境科學(xué)、勞動保護科學(xué)（安全科學(xué)）Z 綜合性圖書,R 醫(yī)藥衛(wèi)生,R1 預(yù)防醫(yī)學(xué)、衛(wèi)生學(xué)R2 中國醫(yī)學(xué)R3 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)R4 臨床醫(yī)學(xué)R5 內(nèi)科學(xué)R6 外科學(xué)R71 婦產(chǎn)科學(xué)R72 兒科學(xué)R73 腫瘤學(xué)R74 神經(jīng)病學(xué)與精神病學(xué)R75 皮膚病學(xué)

13、與性病學(xué)R76 耳鼻咽喉科學(xué) R77 眼科學(xué)R8 特種醫(yī)學(xué)R9 藥學(xué),,主題語言,關(guān)鍵詞：指出現(xiàn)在文獻的標(biāo)題、文摘或全文中，能表達文獻實質(zhì)內(nèi)容的，或者能被人們作為檢索入口的關(guān)鍵性專業(yè)名詞術(shù)語。是一種沒有規(guī)范化的自然語言，又稱為自由詞。主題詞：是一種反映文獻內(nèi)容主題、經(jīng)過嚴(yán)格規(guī)范化了的人工語言。即是將反映文獻主題的各種同義詞進行書寫形式的統(tǒng)一化后定下的檢索語言。,例：肺癌的手術(shù)治療,肺癌 肺鱗狀細胞癌

14、肺母細胞瘤 肺類癌肺腺癌 肺腫瘤外科學(xué),主題詞,,關(guān)鍵詞（自由詞）,副主題詞,,《醫(yī)學(xué)主題詞表》（MeSH詞表）《漢語主題詞表》《中醫(yī)藥學(xué)主題詞表》,主題語言,檢索策略與檢索技術(shù),,檢索策略：  1.課題分析，明確檢索目的； 2.根據(jù)檢索要求，選擇檢索工具； 3.確定檢索途徑，制訂檢索策略； 4.評價檢索效果； 5.調(diào)整檢索策略； 6.根據(jù)文獻出處，獲取原始文獻。,科研課題常見信息需求,查找某概

15、念的確切含義：如“什么是端粒酶” 查找某概念的背景知識 如：“誰最先發(fā)現(xiàn)了傳染性蛋白”查找某些事物的數(shù)值及量化指標(biāo): 如“2003-2004我國肺癌的發(fā)病率” 如“阿司匹林的中毒劑量”查找某一類學(xué)科一般知識： 如“有關(guān)醫(yī)院管理有哪些專著”查找學(xué)科專業(yè)領(lǐng)域的新進展: “有關(guān)醫(yī)院管理發(fā)展趨勢研究的綜述文獻”查找專業(yè)課題相關(guān)的研究文獻；

16、 “有關(guān)醫(yī)院信息系統(tǒng)建構(gòu)”的研究文獻,,,特征型知識（事實、數(shù)值類數(shù)據(jù)庫、搜索引擎）,,,關(guān)聯(lián)型知識（文獻數(shù)據(jù)庫）,檢索效果的評價,檢出的相關(guān)文獻量 檢出的文獻總量,檢出的相關(guān)文獻量 系統(tǒng)中相關(guān)文獻總量,查準(zhǔn)率 =,查全率 =,,,×100%,×100%,數(shù)據(jù)庫（Database）是能滿足某種特定目的或某一特定數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)需要的一種數(shù)據(jù)集合，它可以由一個或多個文檔組成。文檔（File）是數(shù)

17、據(jù)庫中一部分記錄的集合。記錄（Record）是數(shù)據(jù)庫中的基本文獻單元，一條記錄往往記錄著一篇文獻的相關(guān)信息。字段（Field）是組成記錄的基本信息單元。每一個字段都描述文獻的某一方面的特征，包括外表特征和內(nèi)容特征，如題名、作者、刊名、出版年、主題詞等等。各個描述文獻一部分特征的字段組合就成了記錄。,數(shù)據(jù)庫及其結(jié)構(gòu),數(shù)據(jù)庫,,文檔,記錄→字段（如題名、作者、主題詞、摘要等）記錄→字段……,,數(shù)據(jù)庫及其結(jié)構(gòu),文檔……索引索引

18、……,,每條記錄由若干個字段組成,計算機信息檢索主要技術(shù),布爾邏輯檢索位置檢索截詞檢索指定字段檢索,布爾邏輯檢索,布爾邏輯檢索是檢索系統(tǒng)中應(yīng)用最為廣泛的檢索技術(shù)，是最簡單、最基本的匹配模式，其理論基礎(chǔ)是集合論與布爾邏輯。布爾邏輯檢索采用布爾邏輯表達式來表達用戶的檢索要求。布爾邏輯表達式是指通過布爾邏輯運算符來連接檢索詞，以及表示運算優(yōu)先級的括號組成的一種表達檢索要求的算式。例： （肺癌 or 肺腫瘤）and 手術(shù),常用的邏輯

19、運算符有：邏輯“與” （and）邏輯“或” （or）邏輯“非” （not）,布爾邏輯檢索,布爾邏輯運算符,1. 邏輯“與” ：是具有概念交叉關(guān)系和限定關(guān)系的一種組配（通常用 and 表示）。,檢索式A and B，表示檢出的文獻中必須同時包含檢索詞A和B。其作用是縮小檢索范圍，提高查準(zhǔn)率。,例：青霉素 and 肺炎,2. 邏輯“或” ：是具有概念并列關(guān)系的一種組配（通常用 or 表示）。,檢索式A or B ，表示檢出的是含

20、有檢索詞A或檢索詞B，或同時含有A和B的文獻。其作用是擴大檢索范疇，提高查全率。,例：乙肝 or 乙型肝炎,布爾邏輯運算符,3. 邏輯“非”：是具有不包含某種概念關(guān)系的一種組配 （通常用“not”或 “and not”表示）。,檢索式A not B，表示檢出文獻只包含檢索詞A而不包含檢索詞B。其作用是縮小檢索范圍。,例：阿霉素 not 表阿霉素,布爾邏輯運算符,位置檢索（又稱相鄰度檢索、鄰近檢索）：檢索時通過位置算符（又稱鄰近算符）規(guī)定

21、檢索詞之間在原始文獻中的相鄰位置關(guān)系。位置算符都隱含了邏輯算符AND的含義，即由它們連結(jié)的兩個檢索詞（式）都必須出現(xiàn)，但位置算符還對連結(jié)的兩個檢索詞的位置關(guān)系作了進一步的限定。,位置檢索,位置檢索大致包括三種級別的檢索：字段級檢索：限定檢索詞在同一字段范圍內(nèi)，如with（Medline光盤數(shù)據(jù)庫）；子字段或自然句級檢索：限制檢索詞在同一子字段或自然句中，如near（Medline光盤數(shù)據(jù)庫）；詞位置檢索：限定檢索詞的相互位置滿足

22、某些條件，如彼此相隔多少個詞（或字），是否以一定的先后順序出現(xiàn)，一個詞的出現(xiàn)是否不允許另一個詞（或字）同時出現(xiàn)等，如nW、pre（ScienceDirect）。,位置檢索,liver with cancer,,liver and cancer,,liver near4 cancer,,截詞檢索是在檢索時針對檢索詞附加一個截斷符號，指明該檢索詞在與文獻數(shù)據(jù)庫的詞比較時，采取完整匹配還是部分匹配。截詞符分為無限截斷和有限截斷。無限截斷：

23、一個截詞符代表多個字符，常用截詞符 “*”。有前截斷、中截斷、后截斷之分。后截詞符：如: vaccin*,可以查出vaccine; vaccines; vaccination; post-vaccinal 等。,截詞檢索,有限截斷：一個截詞符只能代表一個字符，常用截詞符 “?”（又稱通配符）。例：環(huán)孢?素，可以查出環(huán)孢霉素、環(huán)孢菌素；Leukemi?，可以查出Leukemia、Leukemic、Leukemid等。,截詞檢索,指