知識發(fā)現(xiàn)工具scifinder入門

1、楊眉高分子化學,知識發(fā)現(xiàn)工具SciFinder入門,誰能讀這么多？ 誰需要讀這么多? 發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新是不是一個數(shù)字的游戲?,“首先必需認識到，科研工作者都十分寶貴自己的時間，除極少數(shù)和自己工作關系十分密切的論文以外，絕大多數(shù)讀者都不會閱讀全文?！? 鄒承魯 “我的科學之路”，2003年10月,序言：為什么我們需要知識發(fā)現(xiàn)工具？,內容綱要,12/04/2014,3,SciFinder的前世今生,12/04/2014,4,S

2、ciFinder的前世今生,12/04/2014,5,SciFinder與CA（CD/Print）的區(qū)別,SciFinder的前世今生,12/04/2014,6,覆蓋多個學科傳統(tǒng)化學有機化學、高分子、應用化學和化學工程、物理化學、無機化學和分析化學。生命科學遺傳學, 基因組學, 酶學, 蛋白質組學, 實驗內科學, 生物化學, 生物技術學, 分子生物學, 微生物學, 細胞生物學 ,藥理學等,SciFinder的前世今生,數(shù)據(jù)多元化

3、CA（1907-）Medline醫(yī)學庫專利全文（歐洲、美國等61家機構授權）180多國的文獻50多個語種,12/04/2014,7,SciFinder的前世今生,12/04/2014,8,SciFinder涵蓋了化學相關領域超過98%的文獻,溶劑，催化劑，產率等,SciFinder的前世今生,SciFinder內容模塊,12/04/2014,9,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,文獻檢索（References）CAPLUSSM

4、 文摘數(shù)據(jù)庫Medline National Library of Medicine數(shù)據(jù)庫物質檢索（Substances）CAS REGISTRYSM 物質數(shù)據(jù)庫CHEMCATS--商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫CHEMLIST--管制數(shù)據(jù)庫反應檢索（Reaction）CASREACT 化學反應數(shù)據(jù)庫,12/04/2014,10,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,,12/04/2014,11,SciFinder知識發(fā)現(xiàn)途徑,知識發(fā)現(xiàn)目標

5、：獲得不知道的信息知識發(fā)現(xiàn)過程,12/04/2014,12,SciFinder初體驗,SciFinder Web的系統(tǒng)要求Windows用戶支持IE 7.x或者FireFox 2.xMac 用戶支持 Firefox 和 Safari首次需注冊@sjtu.edu.cnOR@shsmu.edu.cnJava 安裝（初次畫分子結構時提示）信息來源：圖書館主頁,12/04/2014,13,SciFinder初體驗,通過圖書館主

6、頁獲取相關信息www.lib.sjtu.edu.cn,12/04/2014,14,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,15,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,16,,,SciFinder初體驗,進入數(shù)據(jù)庫介紹頁面,12/04/2014,17,,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,18,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/

7、2014,19,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,20,交大郵箱醫(yī)學院郵箱,,,,便于找回密碼,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫注冊,12/04/2014,21,,通過鏈接確認,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫登錄（http://scifinder.cas.org）,12/04/2014,22,,SciFinder初體驗,數(shù)據(jù)庫主界面,12/04/2014,23,,,,,,保存過的結果集,郵件提醒結果集,,

8、3個主要檢索入口及檢索選項,,,,對多個檢索式進行邏輯運算,,實戰(zhàn)演練,文獻檢索主題檢索例1: 納米材料在藥物領域的研究物質檢索標示符檢索例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析結構式檢索例3: 結構檢索反應檢索官能團檢索例4: 由酰鹵化物生成醛的反應,12/04/2014,24,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究策略制定nanostructured materials of pharmaceutic

9、als檢索結果,12/04/2014,25,,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,12/04/2014,26,,,,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,12/04/2014,27,,,,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,12/04/2014,28,一共12種分析方式,一共6種精煉途徑,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領

10、域的研究結果分析與精煉,12/04/2014,29,,,,12/04/2014,30,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,,,12/04/2014,31,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,,,12/04/2014,32,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,,12/04/2014,33,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的

11、研究結果分析與精煉,,12/04/2014,34,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,,,12/04/2014,35,實戰(zhàn)演練：文獻檢索,例1: 納米材料在藥物領域的研究結果分析與精煉,,,文獻類型,內容分類,實戰(zhàn)演練：文獻檢索小結,構建主題檢索策略以介詞連接主要檢索詞能夠自動識別同義詞，近義詞，縮寫，并有截詞，斷詞等功能選擇恰當?shù)慕Y果集合使用分析精煉功能縮小范圍學會Analyze/Ref

12、ine功能的組合使用使用Categorize自動分類通過跳轉獲取更多信息可實現(xiàn)從文獻到物質，反應，引文的跳轉,12/04/2014,36,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析baidu獲取物質信息紫杉醇: Paclitaxel , TAXOL…CAS No: 33069-62-4,12/04/2014,37,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析檢索獲得物質詳細信息,12/04/201

13、4,38,檢索框，可輸入物質學名、俗名、CAS No等信息,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析檢索獲得物質詳細信息,12/04/2014,39,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析查看生物活性,12/04/2014,40,,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例2: 紫杉醇的生物活性及靶點分析查看靶點,12/04/2014,41,,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索精確結構檢索亞結構檢索相似

14、結構檢索Markush檢索,12/04/2014,42,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3: 結構檢索,12/04/2014,43,,畫圖版，用于輸入結構式,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,不需要安裝JAVA的結構編輯器,12/04/2014,44,實戰(zhàn)演練：物質檢索,需要安裝JAVA的結構編輯器,12/04/2014,45,,輸入物質信息獲取結構式,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—精確結構檢索繪制結構式,12/04/2014,46,,,實戰(zhàn)演

15、練：物質檢索,例3：結構檢索—精確結構檢索選擇立體構型匹配度,12/04/2014,47,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—精確結構檢索得到物質的鹽、聚合物、混合物或者配合物等等,12/04/2014,48,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—亞結構檢索,12/04/2014,49,33069-62-4,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—亞結構檢索,12/04/2014,50,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—亞結構

16、檢索得到物質的所有修飾信息1547條,12/04/2014,51,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—亞結構檢索分析與精煉,12/04/2014,52,八大限定結構再次限定同位素限定金屬包含限定商業(yè)化限定可提供性質限定性質數(shù)據(jù)限定可提供參考限定原子附屬性限定,六大分析生物活性分析商業(yè)化分析元素分析反應可行性分析物質角色分析靶點分析,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—相似結構檢索,12/04/2014,5

17、3,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—相似結構檢索,12/04/2014,54,,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—相似結構檢索,12/04/2014,55,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—相似結構檢索,12/04/2014,56,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—Markush結構檢索特定物質[Specific Substance] 以特定化學結構所陳述的特定物質，會被標示CAS No.預測性物質[Prophet

18、ic Substance]不會被標示CAS No. 一個Markush可以陳述上百或上千的化學物質找到其他途徑無法檢索到的專利幫助進行初步的專利評估,12/04/2014,57,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—Markush結構檢索,12/04/2014,58,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—Markush結構檢索,12/04/2014,59,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—Markush結構檢索,12/04/20

19、14,60,,實戰(zhàn)演練：物質檢索,例3：結構檢索—Markush結構檢索,12/04/2014,61,,實戰(zhàn)演練：結構檢索小結,精確結構檢索：結果包含鹽和混合物等，母體結構不能修改，不能修飾亞結構檢索：結構必須存在，母體結構不能修改，但可以被修飾相似結構檢索：母體結構可修改可被修飾，給出相似度Markush檢索：獲得專利文獻中的預測性物質,12/04/2014,62,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應,12/04/

20、2014,63,,,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應acid halide ——aldehyde,12/04/2014,64,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應,12/04/2014,65,,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應,12/04/2014,66,,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應,12/04/2014,67,,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反

21、應分析與精煉,12/04/2014,68,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應產率〉70%的反應,12/04/2014,69,實戰(zhàn)演練：反應檢索,例4: 由酰鹵化物生成醛的反應以Pd為催化劑的反應,12/04/2014,70,實戰(zhàn)演練：反應檢索小結,官能團反應適用于只涉及基團之間變化的反應，可獲得更多參考信息多用Analyze/Refine，來獲得催化劑，溶劑，產率等信息當無法找到具體反應，或者檢索結果并不滿意，

22、嘗試用亞結構反應查 詢，可以獲得更多的參考信息,12/04/2014,71,課程小結與習題,全面檢索，避免漏檢數(shù)據(jù)庫后臺支持多級精煉，層層篩選組合運用精煉、分析等多種后處理功能不斷修正策略與結構找不到反應，或檢索結果不盡如人意時,12/04/2014,72,課程小結與習題,更多參考信息iGroup(http://www.igroup.com.cn/cas/)更多案例上海辦公室: 021-64453167小木蟲論壇(ht

23、tp://emuch.net/bbs/)檢索求助,12/04/2014,73,課程小結與習題,習題1：文獻檢索的入口有幾個？請給 出數(shù)據(jù)庫中的具體名稱。習題2：如何檢索青蒿素的合成方法？ 2種及以上途徑可獲加分。附加題：你了解SciFinder的特殊功能么？舉1個例子即可獲得加分！提示：請?zhí)峤煌暾倪^程信息提交郵箱：myans@sjtu.edu.c