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文檔簡介
1、<p><b> 本科畢業(yè)論文</b></p><p><b> (20 屆)</b></p><p> 三疣梭子蟹Crustin抗菌肽原核表達(dá)載體構(gòu)建</p><p> 所在學(xué)院 </p><p> 專業(yè)班級
2、 生物科學(xué) </p><p> 學(xué)生姓名 學(xué)號 </p><p> 指導(dǎo)教師 職稱 </p><p> 完成日期 年 月 </p><p><b> 目錄</
3、b></p><p><b> 摘要I</b></p><p> AbstractII</p><p><b> 引言1</b></p><p><b> 1材料與方法3</b></p><p> 1.1試劑與方法3<
4、/p><p> 1.1.1材料3</p><p> 1.1.2培養(yǎng)基及試劑3</p><p> 1.1.3儀器3</p><p> 1.1.4實驗所用引物序列3</p><p><b> 1.2方法4</b></p><p> 1.2.1三疣梭
5、子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA的提取4</p><p> 1.2.2目的基因的RT-PCR擴增4</p><p> 1.2.3添加接頭5</p><p> 1.2.4擴增產(chǎn)物純化6</p><p> 1.2.5目的基因片段克隆載體的構(gòu)建6</p><p> 1.2.6pET-28a原核表達(dá)載體的構(gòu)
6、建7</p><p> 2結(jié)果與分析11</p><p> 2.1三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA的提取11</p><p> 2.2RT-PCR與接頭連接11</p><p> 2.3克隆載體的構(gòu)建12</p><p> 2.4表達(dá)載體的構(gòu)建13</p><p>
7、 2.5本章小結(jié)14</p><p><b> 3討論15</b></p><p><b> 參考文獻(xiàn)16</b></p><p> 致謝錯誤!未定義書簽。</p><p><b> 摘要</b></p><p> [摘要] Cr
8、ustin最早由Relf等在青蟹Carcinus maenas中分離鑒定,后續(xù)研究表明Crustin普遍存在于甲殼類中,甲殼類crustin以其C末端的WAP結(jié)構(gòu)域為標(biāo)志,也有8個保守的Cys殘基,形成4對分子內(nèi)二硫鍵。實驗室已從三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞cDNA文庫中克隆出兩個crustin的異構(gòu)體,通過原核表達(dá)載體構(gòu)建研究crustin這兩個異構(gòu)體之間的活性和活性差異。本實驗以三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA為模板,EcruS1和EcruR1
9、,Ecr3S1和Ecru3R1分別為I型Crustin和III型Crustin的上下引物,進行RT-PCR,再在上述引物中添加接頭EcruS2和EcruR1,Ecru3S2和Ecru3R1進行PCR,成功擴增到預(yù)期長度一致的單一擴增帶、以pEASY-Blunt simple vector為克隆載體,成功構(gòu)建目的基因片段克隆載體,目的基因克隆載體質(zhì)粒與空白表達(dá)載體質(zhì)粒pET-28a分別雙酶切、割膠回收后,用T4 DNA ligase 連接
10、,轉(zhuǎn)化E. coli DH 5α后PCR檢測表明連接成功,以M13為引物測序顯示重組載體中有His?Ta</p><p> [關(guān)鍵詞] 三疣梭子蟹;Crustin;原核表達(dá);表達(dá)載體</p><p><b> Abstract</b></p><p> [Abstract] The first rustin identified wa
11、s an 84 amino acid protein isolated from hemocytes of the green crab (Relf et al,),follow-up studies have shown that crustin commonly found in crustaceans,particularly at its C-terminus,where eight cysteine residues form
12、 a WAP domain. Laboratory blood lymphocytes from trituberculatus cloned cDNA library of two isomers crustin by prokaryotic expression vector of crustin between the two isomers of activity and activity differences. This s
13、tudy takes the tot</p><p><b> 引言</b></p><p> 三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus),屬于甲殼綱,十足目是中國沿海的重要經(jīng)濟蟹類。俗稱:梭子蟹、槍蟹、海螃蟹。分布于中國南北各海域。一般從南到北,3~5月和9~10月為生產(chǎn)旺季,渤海灣遼東半島4~5月產(chǎn)量較多。</p><p
14、> 近年來水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)迅速發(fā)展,甲殼動物養(yǎng)殖在水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中占有極其重要的地位,但由于細(xì)菌,病毒等引起的病害也日趨嚴(yán)重,對養(yǎng)殖業(yè)造成了很大的經(jīng)濟損失[1]。我國采用以各種抗生素來解決這問題[2],但是大量并長期使用抗生素導(dǎo)致一些病原體細(xì)菌產(chǎn)生耐藥性,致使部分水產(chǎn)品中的藥物殘留物增加或嚴(yán)重超標(biāo),威脅到食品安全同時也存在對人類的潛在威脅。由于目前水產(chǎn)養(yǎng)殖中抗生素耐藥性菌種出現(xiàn)速度已經(jīng)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過抗生素的研發(fā)速度,而且一些抗生素只針對一部分的
15、病害,并不能抵御各類病原體的入侵。因此,急需研發(fā)與現(xiàn)有抗生素抗菌機理完全不同的新型抗菌物質(zhì)。對此,研究綠色飼料添加劑及抗感染藥劑代替抗生素成為當(dāng)前飼料添加劑領(lǐng)域的一大研究熱點[2]。</p><p> 在甲殼類動物中,最初在食草蟹(Carcinus maenas)的血細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)大小為6.5kDa的富含脯氨酸的陽離子多肽[4],還在其大顆粒血細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了大小為11.5kDa的富含半胱氨酸的疏水蛋白Carcinin
16、[5,6],它只對革蘭氏陽性菌有抗性[7]。Destoumieux等從凡納濱對蝦(Penaeus vannanme)的血細(xì)胞和血漿中分離出幾種抗菌蛋白,其中有3種具有抗真菌和抗革蘭氏陽性菌的活性[8]。盡管抗菌肽的結(jié)構(gòu)不同,但幾乎所有抗菌肽都具有一些共同的特征[9],天然抗菌肽通常是由12-26個氨基酸組成的小分子陽離子多肽,由于富含賴氨酸,精氨酸和組氨酸等堿性氨基酸,抗菌肽通常帶有2-7個正電荷,等電點大于7,表現(xiàn)較強的陽離子特征[1
17、0]</p><p> Crustins是目前報道廣泛存在于甲殼類中的一類具有廣譜抗菌活性免疫因子[11],甲殼類crustins的C末端是WAP域,該結(jié)構(gòu)在其他動物中是一個緊密的蛋白酶抑制劑結(jié)構(gòu)。甲殼類crustins因其獨特的WAP結(jié)構(gòu)為解決蛋白質(zhì)易被蛋白酶降解,影響生物活性及保存期的問題提供了良好的基礎(chǔ)。</p><p> 目前發(fā)現(xiàn)的Crustins均由信號肽和成熟肽兩部分組成,
18、信號肽區(qū)域長16~24 Aa,與其它類型抗菌肽如cathelicidins、defensins的保守性相比,Crustins信號肽保守性較差,而成熟肽區(qū)域相對保守些。根據(jù)信號肽與成熟肽C末端之間結(jié)構(gòu)的差別,可將Crustins分為三個亞型:I型Crustins信號肽和WAP之間存在一個序列長度多變、富含Cys的結(jié)構(gòu)域,但結(jié)構(gòu)域中Cys的數(shù)量不超過6個,因此僅能形成一個4DSC類似結(jié)構(gòu)域,而不能形成完整的4DSC結(jié)構(gòu)域,主要存在于蟹、龍蝦
19、和螯蝦中。II型Crustins不僅有一個富含Cys結(jié)構(gòu)域,而且鄰近信號肽區(qū)還有一個大約40~80Aa的Gly富集區(qū),主要發(fā)現(xiàn)于對蝦中。III型Crustins不僅缺乏II型的Gly富集區(qū),而且也沒有I型和II型中的Cys富集區(qū)。</p><p> 目前研究發(fā)現(xiàn)甲殼類通常能表達(dá)多種Crustins異構(gòu)體,這些異構(gòu)體之間通常僅相差1~4個Aa.由于Crustins異構(gòu)體在序列上差異較小,因此對活性影響可能不大,但
20、可能與不同地理群體環(huán)境的正選擇相關(guān),同時不同的異構(gòu)體在機體中可能根據(jù)需要選擇性表達(dá)。實驗室已從三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞cDNA文庫中克隆得到Crustin的兩個異構(gòu)體,為了研究crustin這兩個異構(gòu)體之間的活性和活性差異,本研究通過構(gòu)建原核表達(dá)體系,在大腸桿菌中表達(dá)三疣梭子蟹crustins,獲得具有生物活性的重組crustins,為開發(fā)梭子蟹飼料添加劑奠定基礎(chǔ)。</p><p><b> 材料與方法&
21、lt;/b></p><p><b> 試劑與方法</b></p><p><b> 材料</b></p><p> 三疣梭子蟹購自北門菜場</p><p><b> 培養(yǎng)基及試劑</b></p><p> 抗凝劑(NaCl 8.2 g、
22、葡萄糖19.8 g、檸檬酸6.3 g、檸檬酸鈉7.6 g、EDTA 3.7 g,pH7.4,加蒸留水定容至1 L,121℃滅菌15 min),marine saline(NaCl 33.9 g、CaCl2 2.95 g、KCl 0.90 g、Na2HPO4 0.2 g、Tris-堿6.05 g,pH7.4,加水定容至1L,121℃滅菌15分鐘),Trizol,氯仿/異戊醇(24∶1),無水乙醇,RPE Solution,無菌RNAas
23、e-free,質(zhì)粒DNA小量制備試劑盒,Easy Pure PCR Purifiction Kit試劑盒,Easy Pure Quick Gel Extraction Kit試劑盒,pEASY-Blunt Simple Cloning Vector試劑盒,DH-5α感受態(tài)細(xì)胞,LB液體培養(yǎng)基,LB固體培養(yǎng)基。</p><p><b> 儀器</b></p><p>
24、 PCR擴增儀(PE9700),恒溫培養(yǎng)箱;電熱恒溫水?。粶缇?;移液槍;高速離心機;恒溫?fù)u床;電泳儀(DYY-6C);電子天平;干燥器;超凈工作臺(ZHJH-C1115C);微生物;冷凍離心機;分光光度計等。</p><p><b> 實驗所用引物序列</b></p><p><b> 表1. 引物序列</b></p>&l
25、t;p> Table 1. primer sequence</p><p><b> 方法</b></p><p> 三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA的提取</p><p> 選健康三疣梭子蟹斷肢采血10 ml,加入10 ml抗凝劑(NaCl 8.2 g、葡萄糖19.8 g、檸檬酸6.3 g、檸檬酸鈉7.6 g、EDTA 3.7 g
26、,pH7.4,加蒸留水定容至1 L,121℃滅菌15 min),3000 rpm離心5 min,棄上清,用marine saline洗滌沉淀一次(NaCl 33.9 g、CaCl2 2.95 g、KCl 0.90 g、Na2HPO4 0.2 g、Tris-堿6.05 g,pH7.4,加水定容1 L,121 ℃滅菌15分鐘),加入0.5 ml Trizol,用槍頭抽吸混勻,用1 ml針筒,6#針頭抽吸勻漿液兩次以剪切基因組DNA后移入1
27、.5 ml Eppendoff管(DEPC處理),加100 ul氯仿/異戊醇(24∶1),劇烈震蕩混勻30 sec,12,000 rpm室溫離心5 min,將上清液(約450 ul)轉(zhuǎn)移到1.5 ml離心管中,加150 ul無水乙醇,混勻后轉(zhuǎn)移到UNIQ-10柱中,室溫放置2 min,8,000 rpm室溫離心1 min,棄去收集管中的廢液,將柱放回收集管中,加入450 ul的RPE Solutio</p><p&g
28、t; 目的基因的RT-PCR擴增</p><p> 根據(jù)表達(dá)載體pET28a和實驗室克隆測定的Crustin基因cDNA核苷酸序列設(shè)計引物,引物由上海捷瑞生物技術(shù)公司合成,引物序列見下表。RT-PCR實驗步驟按上海捷瑞生物技術(shù)公司AMV一步法RT-PCR試劑盒操作說明進行:</p><p><b> 表2. 引物</b></p><p>
29、 Table2. primer</p><p> 1.加下列組分倒置于冰上的小離心管中。如果同時進行多個反應(yīng)可將各組分混合到一管中,然后再分到各個管中。</p><p> 表3. PCR反應(yīng)體系</p><p> Table3. PCR reaction system</p><p> 2. 輕輕混勻,可稍離心確保所有組分都在管底,
30、如需要可在上面覆一層石蠟油,然后進行熱循環(huán)。</p><p> 3. 進行熱循環(huán)擴增:</p><p><b> 表4. PCR梯度</b></p><p> Table4. PCR gradient system</p><p> 4. 1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增產(chǎn)物。</p><p>
31、<b> 添加接頭</b></p><p> 1. 將下列組分加入置于冰上的小離心管中,模板為一次PCR產(chǎn)物50體系</p><p> 表5. PCR反應(yīng)體系</p><p> Table5. PCR reaction</p><p> 2. 輕輕混勻,可稍離心確保所有組分都在管底,然后進行熱循環(huán)。</p
32、><p> 3. 進行熱循環(huán)擴增:</p><p><b> 表6. PCR梯度</b></p><p> Table6. PCRgradient</p><p> 4.1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增產(chǎn)物</p><p><b> 擴增產(chǎn)物純化</b></p>
33、<p> PCR擴增產(chǎn)物的純化按Easy Pure PCR Purifiction Kit試劑盒操作</p><p> 1. 將反應(yīng)液移至干凈的1.5 ml離心管中,加入3倍體積的Binding Buffer I 混勻</p><p> 2. 把混合液轉(zhuǎn)移到套放于收集管的UNIQ-10柱中,室溫放置2 min,離心6000 rpm,1 min</p><
34、;p> 3. 取下UNIQ-10柱,倒掉收集管中的廢液,將UNIQ-10柱放入同一個收集管中,加入500 ul Wash Solution,8000 rpm,室溫離心1 min</p><p> 4. 重復(fù)步驟3一次</p><p> 5. 取下UNIQ-10柱,倒掉收集管中的廢液,將UNIQ-10柱放入同一個收集管中,12000 rpm室溫離心15 s</p>
35、<p> 6. 將UNIQ-10柱放入一根新的1.5 ml離心管中,在柱子膜中央加30 ul去離子水,室溫或37℃放置2 min</p><p> 7. 12000rpm室溫離心1 min,離心管中的液體即回收的DNA片段,儲存在-20℃。</p><p> 目的基因片段克隆載體的構(gòu)建</p><p> 目的基因片段克隆載體為pEASY-Blun
36、t simple vector,操作步驟按試劑盒說明書描述進行。</p><p><b> 1. 連接</b></p><p> 在微型離心管中依次加入溶液:</p><p> PCR 產(chǎn)物 0.5-4 μl,pEASY- Blunt Simple Cloning Vector 1 μl,輕輕混合后,室溫 (20 ℃-37 ℃) 反應(yīng)5分
37、鐘。反應(yīng)結(jié)束后,將離心管置于冰上。</p><p><b> 2. 轉(zhuǎn)化</b></p><p> (1) 加連接產(chǎn)物于50 μl E. coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞中(在感受態(tài)細(xì)胞剛剛解凍時加入連接產(chǎn)物),輕彈混勻,冰浴20-30分鐘。</p><p> (2) 42 ℃熱激30秒,立即置于冰上2分鐘。</p><p
38、> (3) 加250 μl 平衡至室溫的SOC/LB,200 轉(zhuǎn),37 ℃孵育1小時。</p><p> (4) 取8 μl,500 mM IPTG,40 μl,20 mg/ml X-gal混合,均勻地涂于準(zhǔn)備好的平板上,在37 ℃放置30分鐘。</p><p> (5) 待IPTG,X-gal 被吸收后,取200 μl 菌液鋪板,培養(yǎng)過夜(為得到較多克隆,4000 rpm
39、離心1 min,棄掉部分上清,保留100-150 μl,輕彈懸浮菌體,取全部菌液涂板,培養(yǎng)過夜)。</p><p> 3. PCR 方法鑒定陽性重組子</p><p> (1) 挑選白色克隆至10 μl 無菌水中,渦旋混合。</p><p> (2) 25 μl 反應(yīng)體系中取1 μl 混合液用作PCR 反應(yīng)的模板,用M13 F和M13 R鑒定重組子。</
40、p><p> (3) PCR 反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性10分鐘(裂解細(xì)胞,失活核酸酶),94 ℃變性30 秒,55 ℃退火30 秒,72 ℃延伸( 根據(jù)片段的大小確定延伸時間)30個循環(huán),72 ℃后延伸10 分鐘。</p><p> (4) 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物。若載體自連,通用引物擴增,自連帶大小為101 bp。</p><p><b> 4
41、. 測序鑒定</b></p><p> 確認(rèn)包含重組子的克隆,擴大培養(yǎng),500 ul菌液送上海美吉生物技術(shù)有限公司測序,測序引物為M13 F,T7 promoter 引物測序,進行序列分析。</p><p> pET-28a原核表達(dá)載體的構(gòu)建</p><p> 克隆載體中目的基因片段的分離</p><p> 1.克隆載體質(zhì)
42、粒提取</p><p> 按小量質(zhì)粒DNA提取試劑盒說明操作:</p><p> ?。?)挑取少量菌液劃平板(Amp 80 ug/ml),37 ℃過夜培養(yǎng),挑單克隆接種于含Amp(50 ug/ml)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃,180 rpm,培養(yǎng)過夜。(為了增加質(zhì)??截悢?shù),可在培養(yǎng)基變混濁后加入Cam,繼續(xù)培養(yǎng)1~2 h)</p><p> ?。?)在超凈工作臺上
43、,取1-2 ml過夜培養(yǎng)的菌液,12000 rpm離心1 min,棄盡上清;</p><p> ?。?)加入200 ul Solution I,用槍頭或振蕩器充分懸浮細(xì)菌;</p><p> (4)加入200 ul Solution II,立即溫和并充分地上下翻轉(zhuǎn)混合4-6次,使菌體充分裂解,直至形成透亮的蛋清狀溶液,此步驟不宜超過5 min;</p><p>
44、?。?)加入350 ul Solution III,溫和并充分地翻轉(zhuǎn)混合8-10次,室溫放置2-5 min,12000 rpm,10 min。</p><p> (6)將步驟4中的上清轉(zhuǎn)移到套放于2 ml收集管內(nèi)的Gen Clean Column中,室溫12000 rpm,1 min,取出Gen Clean Column,倒掉收集管中廢液。</p><p> ?。?)將Gen Clean
45、 Column重新放回收集管中,加入500 ul Solution IV,12000 rpm,室溫離心1 min,倒掉收集管中廢液。</p><p> ?。?)將Gen Clean Column重新放回收集管中,加入500 ul Wash Solution,12000 rpm,室溫離心1 min,倒掉廢液。</p><p> ?。?)重復(fù)步驟8一次</p><p>
46、 (10)倒掉收集管中廢液,12000 rpm,室溫離心1 min,徹底去除Wash Solution</p><p> ?。?1)將Gen Clean Column放入干凈的1.5 ml離心管中,在Gen Clean Column膜中央加入30-50 ul去離子水,37 ℃放置2 min,12000 rpm,室溫離心1 min。離心管中的液體即為包含載體質(zhì)粒的溶液,取2-5 ul進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,-20
47、 ℃保存。</p><p><b> 2.按下表加樣酶切</b></p><p><b> 表7.酶切反應(yīng)</b></p><p> Table7. digestion reaction</p><p> 混勻,37 ℃,過夜</p><p> ?。?)1%瓊脂糖凝膠
48、電泳檢測</p><p> (4)酶切產(chǎn)物純化方法同1.2.4</p><p> 表達(dá)載體pET-28a的酶切</p><p> 按1.2.6.1步驟2進行酶切,pET-28a載體結(jié)構(gòu)和酶切位點見圖1</p><p> 圖1. pET-28a載體結(jié)構(gòu)示意圖</p><p> Fig. pET-28a vect
49、or structure digaram</p><p> 目的片段與表達(dá)載體的連接</p><p> 按T4 DNA Ligase說明書操作</p><p> ?。?)在微量離心管中制備下列連接反應(yīng)液</p><p><b> 表8.連接反應(yīng)</b></p><p> Table8. l
50、igating reaction</p><p> * DNA片段的摩爾數(shù)應(yīng)控制在載體DNA摩爾數(shù)的3~10。</p><p> *平滑末端的載體與DNA片段進行連接時,應(yīng)首先將載進行去磷酸化處理,以防止其自身環(huán)化</p><p> ?。?)16 ℃過夜反應(yīng)。</p><p><b> 轉(zhuǎn)化</b></p&g
51、t;<p> 1.取200 ulDH-5α感受態(tài)細(xì)胞,加入連接產(chǎn)物5 ul,輕輕混勻,冰上放置30 min</p><p> 42 ℃溫浴90 s,立即放在冰上10 min</p><p> 加800 μl 平衡至室溫的SOC/LB,200 轉(zhuǎn),37 ℃孵育1小時。</p><p> 將細(xì)胞涂布于Kan+的LB平板上,在37 ℃放置30分鐘。&
52、lt;/p><p> pET-28a 空質(zhì)粒作對照。</p><p> 37 ℃,過夜培養(yǎng)。</p><p> PCR方法鑒定陽性重組子</p><p> 1.挑選白色克隆至10 μl 無菌水中,渦旋混合。</p><p> 2. 5 μl 反應(yīng)體系中取1 μl 混合液用作PCR 反應(yīng)的模板,用M13 F和M13
53、 R鑒定重組子。</p><p> 3. PCR 反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性10 分鐘(裂解細(xì)胞,失活核酸酶),94 ℃變性30 秒,55 ℃退火30 秒,72 ℃延伸( 根據(jù)片段的大小確定延伸時間)30個循環(huán),72 ℃后延伸10 分鐘。</p><p> 4. 1%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物。若載體自連,通用引物擴增,自連帶大小為101 bp。</p><p>
54、; 重組表達(dá)載體的測序驗證</p><p> 確認(rèn)包含重組子的克隆,擴大培養(yǎng),500 ul菌液送上海美吉生物技術(shù)有限公司測序,測序引物為M13 F引物測序,進行序列分析。保留至少兩個陽性克隆繼續(xù)培養(yǎng)至菌液足夠濃后,取500 ul甘油保菌,剩余菌液按1.2.1進行質(zhì)粒提取。取1 ul電泳定量。</p><p><b> 結(jié)果與分析</b></p>&
55、lt;p> 三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA的提取</p><p> 按照Trizol試劑使用說明提取三疣梭子蟹血細(xì)胞總RNA,經(jīng)紫外可見分光光度計檢測,其A260 = 0.194,A280 = 0.101,RNA 純度:A260/280 = 1.93 (在正常范圍1. 8~2. 0 之間),RNA 濃度= A260×轉(zhuǎn)換因子40 μg/ml ×稀釋倍數(shù)100 = 0.766 μg/μl
56、,滿足RACE反應(yīng)所需純度和濃度。取5 μl上樣進行RNA電泳,rRNA帶型完整,RNA未降解(圖2)。</p><p> 圖2 三疣梭子蟹血細(xì)胞總RNA</p><p> Fig2. Total RNA of Portunus trituberculatus blood cells</p><p> RT-PCR與接頭連接</p><p&
57、gt; 以三疣梭子蟹血淋巴細(xì)胞總RNA為模板,I型crustin引物組合:EcruS1 X EcruR1和 III型crustin 引物組合:Ecru3S1 X EcruR1,按上海捷瑞生物技術(shù)公司AMV一步法RT-PCR試劑盒操作說明進行RT-PCR,成功擴增到與預(yù)期長度一致I型和III型crustin的單一擴增帶。</p><p> 以RT-PCR產(chǎn)物為模板,I型crustin引物組合:EcruS
58、2 X EcruR1和 III型crustin 引物組合:Ecru3S2 X EcruR1進行二次PCR,給目的基因添加腸激酶酶切位點與限制性內(nèi)切酶酶切位點,反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測取得成功。</p><p> 圖3. 目的基因PCR擴增膠圖</p><p> Fig3. PCR detection of the target gene</p><p><
59、;b> 克隆載體的構(gòu)建</b></p><p> 目的基因PCR產(chǎn)物與克隆載體質(zhì)粒pEASY-Blunt simple vector用T4 DNA ligase 連接,轉(zhuǎn)化E. coli DH5α后經(jīng)載體引物M13F/M13R擴增檢測后有目的條帶,表明克隆載體成功。菌液送上海美吉公司測序,表明挑取的克隆沒有發(fā)生變異,可用于后續(xù)表達(dá)研究(見圖A,B)。</p><p>
60、 A. B.</p><p> 圖4.克隆載體構(gòu)建檢測</p><p> Fig4.construction of cloning vector detection</p><p> A.克隆載體PCR檢測 B.克隆載體酶切檢測</p><p> A. PCR detect
61、ion of cloning vetor B. Digested cloning vector detection</p><p> 注: 圖A:1:CruI 菌液PCR 2:CruIII 菌液PCR</p><p> 圖B:CruI:CruI酶切 CruIII3、CruIII:CruIII酶切</p><p><b> 表達(dá)載體的構(gòu)建
62、</b></p><p> 目的基因克隆載體質(zhì)粒與空白表達(dá)載體質(zhì)粒pET28a分別雙酶切、割膠回收后,用T4 DNA ligase 連接,轉(zhuǎn)化E. coli DH5α后PCR檢測,表明連接成功。重組表達(dá)載體送上海美吉公司測序,測序結(jié)果表明重組表達(dá)載體質(zhì)粒沒有發(fā)生突變,預(yù)期的表達(dá)產(chǎn)物將由His?Tag、thrombin酶切位點、T7?Tag、腸激酶酶切位點與成熟目的基因組成(見圖4,5)。</p
63、><p> 圖5 pET-28a-r CrustinI重組表達(dá)載體測序圖</p><p> Fig5. Recombinant expression vector pET28a-rCrustinI sequence</p><p> 圖6 pET-28a-rCrustinIII重組表達(dá)載體測序圖</p><p> Fig6. Reco
64、mbinant expression vector pET28a-rCrustinIII sequence</p><p><b> 本章小結(jié) </b></p><p> 在本研究中,RNA的抽提、目的基因片段的RT-PCR擴增、克隆載體的構(gòu)建、表達(dá)載體的構(gòu)建均成功。</p><p><b> 討論</b></
65、p><p> 目前用于重組表達(dá)的系統(tǒng)可以分為兩大類:原核表達(dá)系統(tǒng)和真核表達(dá)系統(tǒng),不同的表達(dá)系統(tǒng)各有優(yōu)缺點,如酵母和昆蟲細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)蛋白表達(dá)水平高,生產(chǎn)成本低,但它們的加工修飾體系與哺乳動物細(xì)胞不完全相同;哺乳動物細(xì)胞產(chǎn)生的蛋白質(zhì)更接近于天然蛋白質(zhì),但其表達(dá)量低、操作繁瑣。各種表達(dá)系統(tǒng)由于翻譯后的加工不完全相同,因而產(chǎn)生的重組蛋白的生物學(xué)活性和免疫原性有時會有差別。因此,選擇表達(dá)系統(tǒng)時,必須充分考慮各種因素,如所需表
66、達(dá)的蛋白質(zhì)性質(zhì)、實驗條件、生產(chǎn)成本、表達(dá)水平、安全性等,權(quán)衡利弊后再選擇相應(yīng)的表達(dá)系統(tǒng)。</p><p> 在現(xiàn)有關(guān)于Crustins的重組表達(dá)研究報道中,采用原核表達(dá)系統(tǒng)的居多,也有采用酵母表達(dá)系統(tǒng)(Supungul, P, 2008; Zhang, J, 2007a.b)。如Amparyup P等(2008)將黑虎蝦(Penaeus monodon)Crustin 連接如表達(dá)載體pET28b,構(gòu)建表達(dá)載體p
67、ET28b-Crus-likePm,轉(zhuǎn)化E. coli BL21-Codon Plus (DE3)-RIL成功表達(dá),純化的rCruslikePm,對革蘭氏陽性菌和陰性菌均有很強的抑菌活性,最小抑菌濃度為0.312 to 20 uM(Amparyup P,2008)。本研究中采用的表達(dá)載體pET28a與pET28b是同一系列的表達(dá)載體,只是相位不同。在研究中首先將重組表達(dá)載體pET28a-CrustinPtI和pET28a-Crustin
68、PtIII轉(zhuǎn)化表達(dá)菌株E. coli BL21,但沒有檢測到表達(dá)產(chǎn)物。分析表達(dá)失敗的原因認(rèn)為極有可能是因為稀有密碼子造成的,故后又轉(zhuǎn)化表達(dá)菌株Transetta,Transetta菌株中添加了稀有密碼子Arg密碼子AGG和AGA,Ile 密碼子AUA,L</p><p><b> 參考文獻(xiàn)</b></p><p> [1] 欣華. 水產(chǎn)飼料發(fā)展趨勢. 農(nóng)村養(yǎng)殖技術(shù)
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