黃瓜分子遺傳圖譜構(gòu)建與整合.pdf

1、黃瓜是我國普遍栽培的主要蔬菜作物，開展黃瓜的分子育種研究具有重要的理論和應(yīng)用意義。構(gòu)建飽和通用的黃瓜遺傳圖譜是開展黃瓜分子育種研究的基礎(chǔ)，它將為新品種選育工作和分子標(biāo)記輔助育種提供準(zhǔn)確快捷的工具。雖然黃瓜分子遺傳圖譜的構(gòu)建已經(jīng)取得了重要進展，但目前已經(jīng)發(fā)表的連鎖圖譜來自不同的實驗室，利用的作圖群體和標(biāo)記各不相同，構(gòu)建的圖譜多數(shù)是以F2為作圖群體的臨時圖譜，并且圖譜的飽和度不高，缺乏通用性和實用性。本試驗采用基于“錨定SSR標(biāo)記"的作圖策

2、略，首先利用2個F2群體，選用940對SSR引物，分別構(gòu)建了黃瓜抗白粉病和抗枯萎病分子遺傳圖譜，然后與原有的黃瓜抗病毒病遺傳圖譜進行整合，獲得一張基于SSR標(biāo)記的黃瓜遺傳圖譜。因此，整合后的黃瓜遺傳圖譜將在黃瓜基因組學(xué)和分子育種研究中具有很強的實用性。在完成圖譜整合構(gòu)建的同時，對枯萎病、白粉病以及病毒病等重要的抗病性狀進行基因定位。 本試驗取得如下主要結(jié)果： 1.圖譜構(gòu)建與整合1.1利用WIS2757×19032的F2分

3、離群體為作圖群體構(gòu)建了黃瓜抗白粉病遺傳圖譜：該遺傳圖譜由10個連鎖組群組成，包含SSRs、AFILP、SCARs等161個標(biāo)記，其中SSRs標(biāo)記為47個，覆蓋基因組總長為824 cM，標(biāo)記平均間隔5.1 cM。每個連鎖群上的標(biāo)記數(shù)在4～90之間，長度在43 cM～158 cM范圍，圖譜密度1.5 cM/標(biāo)記(G1)～19 cM/標(biāo)記(G9)。SSR標(biāo)記均勻分布在10個連鎖群，連鎖群最少含有SSR標(biāo)記2個，最多含有16個標(biāo)記。 1

4、.2利用WIS2757×津研2號的F2分離群體為作圖群體構(gòu)建了黃瓜抗枯萎病遺傳圖譜：該遺傳圖譜由9個連鎖組群組成，包含SSRs、RAPDs、.AFLP、SCARs等164個標(biāo)記，其中SSRs標(biāo)記為41個，覆蓋基因組總長為530 cM，標(biāo)記平均間隔3.2 cM。每個連鎖群上的標(biāo)記數(shù)在5～85之間，長度在22 cM～196 cM范圍，圖譜密度1.2 cM/標(biāo)記(G7)～8.6 cM/標(biāo)記(G1)。圖譜中兩個標(biāo)記間距小于10 cM的區(qū)域覆蓋圖

5、譜長度30％。有15個間隙(gaps)大于15 cM，最大的間隙在連鎖組G9(24.5 cM)。 1.3基于秋棚×歐洲八號重組自交系群體(RIL)的黃瓜抗病毒病遺傳圖譜的整合圖譜：整合后的黃瓜遺傳圖由10個連鎖組群組成，包含SSRs、AFLP、SCARs等311個標(biāo)記，其中SSR標(biāo)記為35個，覆蓋基因組總長為934 cM，標(biāo)記平均間隔3.0 cM，連鎖群長度范圍從40 cM-158 cM，標(biāo)記數(shù)范圍從4～110個。整合后的圖譜新

6、增加了61個SSR標(biāo)記，其中G3、G10連鎖群有較多的標(biāo)記增加。 2.抗病基因定位2.1將黃瓜對.ZYMV-CH、PRSV-W、WMV三種病毒的抗性基因定位在整合遺傳圖譜的G3連鎖群上，并且簇聚在15eM的區(qū)間。本研究首次將黃瓜對ZYMV-CH、PRSV-W、WMV三種病毒的抗性基因同時在遺傳圖譜上定位，在分子水平上確認(rèn)了三種病毒的簇聚性。 2.2將黃瓜對枯萎病的抗性基因pm定位在整合遺傳圖譜的G1連鎖群上，白粉病的抗性