番茄保守性microRNA對病毒侵染的響應(yīng).pdf

1、MicroRNA.(miRNAs)是一類廣泛存在于動植物中高度保守的非編碼的小分子RNA。通過在番茄核酸數(shù)據(jù)庫中檢索其他植物的已知miRNA，發(fā)現(xiàn)了13條保守的pre-nuRNA對應(yīng)9條成熟miRNAs，其中6條已經(jīng)被克隆到。為了驗證預(yù)測結(jié)果，利用已知植物非冗余的成熟miRNA互補序列做為探針制作了miRNA檢測芯片。與抽提至番茄葉組織的小RNA雜交后發(fā)現(xiàn)，包含上述預(yù)測的miRNA在內(nèi)的78條成熟miRNA被檢測到。Northern雜交

2、結(jié)果顯示預(yù)測得到的miRNA在番茄葉組織、根和莖中均高度累積。用新發(fā)現(xiàn)的番茄保守性miRNA檢測來自NCBI的番茄mRNA后發(fā)現(xiàn)23條潛在的靶基因，主要與番茄營養(yǎng)期向生殖期的轉(zhuǎn)變，花的發(fā)育和對生長素和病毒脅迫的響應(yīng)有關(guān)。
　　 植物病毒已經(jīng)進化出自身的策略對抗寄主的RNA沉默，而在作用過程中寄主的miRNA表達被顯著的改變。本研究廣泛的調(diào)查了各種代表性病毒CMV-Fny、CMV-Fny△2.(2b基因被敲出)、CMV-FnyYn

3、12、CMV-FnyT1和ToMV-N5侵染后，對番茄葉組織中miRNA表達的影響。結(jié)果顯示CM.2b蛋白作為沉默抑制子顯著地改變了miRNAs的表達圖譜，推測88％異常表達是由2b蛋白引起的。結(jié)果顯示CMV不同衛(wèi)星RNA侵染番茄后產(chǎn)生不同的表達圖譜，顯示番茄miRNA表達可能具有不同抗病毒侵染的方式。與ToMV-N5侵染后相比，所有的CMV-Fny侵染引起的差異miRNAs下調(diào)，ToMV-N5侵染引起差異miRNAs表達上調(diào)，暗示To