豬疥螨副肌球蛋白基因的擴增及序列分析.pdf

1、豬疥螨病則豬常見的多發(fā)性寄生蟲病，主要引起豬劇癢、疼痛、結(jié)痂而導致生長停滯，迅速消瘦。本病傳播快、流行廣、發(fā)病重劇，對養(yǎng)豬業(yè)危害極大。長期以來，動物疥螨病的防治均以藥物殺螨為主，但殺螨藥物均不同程度地存在副作用且長期使用可能產(chǎn)生抗藥性以及造成環(huán)境污染等問題，因此需要進行防治新技術的研究。目前有關豬疥螨病的免疫防治，尚無研究報道。
　　 根據(jù)GenBank中報道的紅狐疥螨蟲株和兔疥螨蟲株的副肌球蛋白基因全序列設計合成1對特異性引物

2、，首次擴增出豬疥螨副肌球蛋白基因的全序列，經(jīng)測序并進行生物信息學和系統(tǒng)發(fā)生分析。結(jié)果表明，豬疥螨副肌球蛋白基因全長2628bp，GenBank登錄號為EU606031，其中A、T、C和G的含量分別為37.2％、20.7％、18.6％、23.5％，A+T含量(57.9％)高于G+C含量(42.1％)。核苷酸同源性分析表明，3個疥螨分離株間同源基因的相似性均較高(99.5％～99.9％)，其中分離自豬和紅狐的疥螨同源基因的相似性最高(99.

3、9％)，以分離自紅狐的疥螨與分離自兔的疥螨同源基因相似性最低(99.5％)。測定的豬疥螨蟲株與其他科的螨蟲同源基因相似性比較發(fā)現(xiàn)，與熊貓足螨(EU543652)間相似性最高(83.0％)，與牛足螨(EF053124)、綿羊癢螨(AM114275)間相似性次之(82.7％)，與刺翼塵螨(AY189697)間的相似性較高為82.0％，與熱帶無爪螨(AF525465)的相似性最低(78.4％)。氨基酸同源性也表現(xiàn)出相似的結(jié)果；而它們之間推導的

4、氨基酸同源性分析發(fā)現(xiàn)，3個疥螨分離株間同源氨基酸的相似性均較高(99.7％～99.9％)，其中以分離自豬和兔的疥螨同源氨基酸的相似性最高，以分離自紅狐的疥螨與分離自兔的疥螨同源基因相似性最低；測定的豬疥螨蟲株與牛足螨(EF053124)、熊貓足螨(EU543652)間的同源氨基酸相似性分別為95.1％和95.3％；與綿羊癢螨(AM114275)間的同源氨基酸相似性為95.5％；與刺翼塵螨(AY189697)的同源氨基酸相似性較高為94.

5、3％；與熱帶無爪螨(AF525465)的同源氨基酸相似性較高為88.8％。
　　 生物信息學分析發(fā)現(xiàn)，豬疥螨副肌球蛋白全基因共編碼875個氨基酸，其中以谷氨酸、亮氨酸和賴氨酸的含量最高，而半胱氨酸、脯氨酸和色氨酸的含量最少；該蛋白分子理論值為102.383KD，其理論等電點pI=5.59，具有較強的親水性，蛋白抗原性分析顯示其抗原位點分布于整個蛋白質(zhì)多肽鏈，有29個T淋巴細胞抗原決定簇位點，不存在跨膜結(jié)構(gòu)域，是一種膜外蛋白，該蛋