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文檔簡(jiǎn)介
1、為了研究傳染性法氏囊病在我國(guó)不同地區(qū)的毒株流行特點(diǎn)及遺傳變異規(guī)律,本研究應(yīng)用RT-PCR方法對(duì)2005~2011年間分離的37株傳染性法氏囊病病毒分離株進(jìn)行了VP2基因高變區(qū)的測(cè)序和分析。通過(guò)與vvIBDV的七肽區(qū)、兩個(gè)親水區(qū)氨基酸、四個(gè)特征性氨基酸(222A、256I、294I、299S)及毒力細(xì)胞嗜性主要決定位點(diǎn)(253Q、279D、284A、330S)比較發(fā)現(xiàn):分離株CK/JL/DH21005和CK/SD/LY21005的七肽區(qū)3
2、33位氨基酸由S變?yōu)镹。CK/SD/LX61003等9株分離株的兩個(gè)親水區(qū)氨基酸均發(fā)生變化,但并沒(méi)有規(guī)律性。分離株CK/SD/RZ20904、CK/SD/GM21105和CK/SD/ZC10706222位氨基酸由A變?yōu)門(mén)。所有分離株在253、284、330位的氨基酸比較保守,但CK/SD/LX30901等8株分離株在279位點(diǎn)出現(xiàn)規(guī)律性的氨基酸變化D279N。
對(duì)37株分離株進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)、基因同源性及主要特征性氨基酸的綜
3、合分析推測(cè):分離株CK/SD/LY10810和CK/LN/PJ1103為2512中等毒力疫苗毒株;分離株CK/SD/GM21105為變異株;剩余34株分離株為超強(qiáng)毒株。但該結(jié)果還需要結(jié)合動(dòng)物實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步進(jìn)行判定。2010年間分別從三個(gè)省份分離到的3個(gè)毒株CK/XJ/WLMQ1007、CK/LN/DL1001、CK/SD/LX81007處于同一基因群VV1,彼此之間同源性較高,但是這三個(gè)省份之間的空間距離較遠(yuǎn),說(shuō)明在空間上相距較遠(yuǎn)的地區(qū)有同
4、一基因群的毒株在流行。2007-2011期間對(duì)山東青島地區(qū)某規(guī)?;B(yǎng)雞場(chǎng)進(jìn)行了持續(xù)分離的七株病毒。除CK/SD/LX30901D279N以外,這七株分離株雖然都具有超強(qiáng)毒株的特征性氨基酸,但是在基因進(jìn)化樹(shù)中CK/SD/LX30901、CK/SD/LX61003、CK/SD/LX81007、CK/SD/LX101102位于VV1分支,CK/SD/LX10706、CK/SD/LX20809、CK/SD/LX50912位于VV4分支,是不同群
5、的毒株。這說(shuō)明在同一地區(qū)不同時(shí)間內(nèi)流行的毒株比較復(fù)雜,往往有幾個(gè)群的毒株同時(shí)在流行。
結(jié)論:所調(diào)研地區(qū)雞IBDV毒株的流行狀況很復(fù)雜,沒(méi)有出現(xiàn)明顯的時(shí)間和地域特征。近七年流行的毒株以超強(qiáng)毒株為主,并且?guī)в刑卣餍园被嶙儺怐279N的毒株曾在不同地區(qū)流行。
本研究應(yīng)用RT-PCR方法對(duì)分離株CK/SD/LX30901和CK/DB(Ⅰ)09全基因A、B兩片段進(jìn)行了測(cè)序和分析。對(duì)其全基因序列進(jìn)行分析后表明兩株分離株
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