長牡蠣糖原代謝酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關性研究.pdf

1、糖原是牡蠣生長和發(fā)育的主要能源物質，并且影響長牡蠣貝肉的質地和味道。糖原合酶和糖原磷酸化酶是參與糖原代謝的一對關鍵酶。糖原代謝的短期調節(jié)主要是通過反饋機制而進行的各種酶的調控作用，而長期調節(jié)則是由參與糖原代謝通路編碼酶基因的表達水平而調控的。糖原合酶基因和糖原磷酸化酶基因的表達水平已被發(fā)現(xiàn)與長牡蠣糖原含量在糖原代謝中的季節(jié)性變化相一致，符合牡蠣將糖原作為主要能量物質用于配子發(fā)生和性腺成熟過程的自然生理現(xiàn)象。
　　長牡蠣基因組中存在

2、的大量SNPs標記為候選基因的多態(tài)性與長牡蠣經濟性狀之間的相關性研究提供了豐富的材料基礎。單倍型是同一染色體上多個SNPs位點中核苷酸堿基的線性排列，以其為分子遺傳標記進行相關性分析比單個SNP標記更加有效。
　　本研究隨機選取來自5個全同胞家系的322個長牡蠣個體，以長牡蠣糖原合酶基因（Cg-GYS）和長牡蠣糖原磷酸化酶基因（Cg-GPH）作為糖原代謝相關性分析的候選基因，將其編碼區(qū)單核苷酸多態(tài)性（SNPs）與生長性狀（包括殼高

3、、殼長、殼寬、總體重以及軟體部重）和糖原含量（％干重）進行了相關性研究。
　　1.長牡蠣糖原合酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關性研究
　　在長牡蠣糖原合酶基因的1420bp擴增片段中共檢測到41個SNPs位點，全部位于外顯子編碼區(qū)域，編碼區(qū)SNPs平均密度為1/35bp。6個編碼區(qū)SNPs位點與糖原含量存在顯著相關性（P<0.01）。與生長性狀相關聯(lián)的SNPs由于數量較少，因此未進行后續(xù)單倍型與性狀之間的相關性分析。通過連鎖

4、不平衡所構建的4種SNP單倍型中，長牡蠣糖原合酶基因的H3（GGAATC）單倍型在糖原含量方面顯著低于其他3種SNP單倍型（P<0.05）。其中，具有H2（GAGGAT）單倍型個體的糖原含量極顯著高于具有H3單倍型個體的糖原含量（P<0.0001），因此，H2單倍型可能是導致長牡蠣高糖原含量的SNP單倍型。
　　2.長牡蠣糖原磷酸化酶基因多態(tài)性與生長及糖原含量相關性研究
　　在長牡蠣糖原磷酸化酶基因的1940bp擴增片段中共

5、檢測到82個SNPs位點，其中63個SNPs位點位于外顯子區(qū)域，1個SNPs位點位于5'-UTR區(qū)，18個SNPs位點位于3'-UTR區(qū)，編碼區(qū)SNPs平均密度為1/25bp；5個SNPs位點與生長性狀存在顯著相關性（P<0.05），未檢測到與糖原含量相關SNPs。生長性狀關聯(lián)SNPs位點構建的6個SNP單倍型中，Cg-GPH基因的H6（CTGAT）單倍型在總體重性狀方面均顯著高于其他5種SNP單倍型（P<0.05），表明H6單倍型可能