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文檔簡介
1、文蛤和方形網(wǎng)紋溞都是水產(chǎn)上十分重要的動(dòng)物,前者是我國重要的經(jīng)濟(jì)品種之一,后者常作為魚類的活體餌料。這兩種生物都很少用于分子生物學(xué)的研究。本研究利用分子生物學(xué)手段研究了這2種無脊椎動(dòng)物的富含半胱氨酸小腸蛋白(Cysteine-richintestinalprotein,CRIP)基因,初步探討了CRIP在它們體內(nèi)的生物學(xué)功能。
本研究分為2個(gè)部分。第1部分對文蛤的CRIP基因的克隆與功能展開研究,具體的研究結(jié)果如下:
2、(1)克隆了文蛤的CRIP的cDNA序列,長度為468bp,其中ORF237bp,5’非翻譯區(qū)83bp,3’非翻譯區(qū)148bp。
?。?)對MmCRIP(Meretrixmeretrixcysteine-richintestinalprotein)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。MmCRIP編碼一條由78個(gè)氨基酸殘基組成的多肽,分子式為C379H578N106O110S8,理論分子量為8635.8。其中富含Lys(13.92%)、Gly(1
3、1.39%)和Cys(8.86%),缺乏Gln、Ile。含有負(fù)電氨基酸殘基7個(gè),正電氨基酸殘基13個(gè),等電點(diǎn)為9.01,屬于陽離子多肽。MmCRIP具有CRIP亞家族特征性結(jié)構(gòu)域——LIM結(jié)構(gòu)域。蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測其在碳末端和氮末端分別形成α-螺旋與連續(xù)的兩個(gè)β-折疊。
?。?)利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù)檢測了MmCRIP在不同發(fā)育階段、不同組織中mRNA的表達(dá)差異。結(jié)果顯示,擔(dān)輪幼蟲和D型幼蟲階段MmCRIP表達(dá)量較
4、低,而在從D型幼蟲變態(tài)成殼頂幼蟲時(shí)表達(dá)量升高,后者是前者的3.5倍。此外,在殼頂幼蟲到稚貝的發(fā)育過程中MmCRIP表達(dá)量略有下降。在不同組織中,肌肉中MmCRIP的表達(dá)量最高(P≤0.05,n=3)。
(4)利用qPCR技術(shù)檢測MmCRIP受鰻弧菌刺激后mRNA表達(dá)量的變化。結(jié)果表明菌刺激前后MmCRIP表達(dá)量保持穩(wěn)定。
?。?)用不同濃度MmCRIP的雙鏈RNA(dsRNA)對文蛤D型幼蟲進(jìn)行RNA干擾。結(jié)果發(fā)現(xiàn)0.
5、1、1.0、10μg/mLdsRNA處理組死亡率均顯著高于對照組(P≤0.01,n=6)。處理濃度越大的dsRNA,使得D型幼蟲存活數(shù)目下降得越快。三個(gè)濃度的處理組均在處理48h后,死亡率接近100%。
結(jié)論是,認(rèn)為MmCRIP可能參與文蛤從D型幼蟲到殼頂幼蟲的發(fā)育過程。MmCRIP在成貝肌肉組織中有高表達(dá),提示其可能主要在肌肉組織中發(fā)揮重要生理功能。
第二部分的內(nèi)容是方形網(wǎng)紋溞的CqCRIP基因的克隆和功能分析,具
6、體的研究結(jié)果如下:
(1)克隆了方形網(wǎng)紋溞的CRIP的cDNA序列,長度為693bp,其中ORF237bp,3’非翻譯區(qū)456bp。
(2)對CqCRIP(Ceriodaphniaquadrangulacysteine-richintestinalprotein)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。CqCRIP所編碼多肽由78個(gè)氨基酸殘基組成,分子式為C378H576N110O108S8,理論分子量為8645.8。其中富含Lys(1
7、2.66%)、Gly(11.39%)和Cys(8.86%),缺乏Ile。含有負(fù)電氨基酸殘基6個(gè),正電氨基酸殘基12個(gè),等電點(diǎn)為9.04,屬于陽離子多肽,同MmCRIP一樣具有CRIP家族所擁有的LIM結(jié)構(gòu)域。蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測,亦在碳末端和氮末端分別形成α-螺旋與連續(xù)的兩個(gè)β-折疊?;贑RIP氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示,MmCRIP與CqCRIP與無脊椎動(dòng)物CRIP聚類在一起。
?。?)利用qPCR檢測CqCRIP在不同發(fā)育
8、階段mRNA的表達(dá)差異。結(jié)果顯示各齡期的表達(dá)量基本恒定,但在食物趨于短缺、水質(zhì)下降的環(huán)境下產(chǎn)生的雄體中CqCRIP的mRNA表達(dá)量顯著地大于雌體(P≤0.01,n=3);產(chǎn)休眠卵的雌體的表達(dá)量大于正常孤雌生殖雌體(P≤0.05,n=3)。
?。?)用含有CqCRIPdsRNA的HT115菌投喂方形網(wǎng)紋溞,死亡率相較于對照顯著上升(P≤0.05,n=3),尤其是60-72h時(shí)為極顯著(P≤0.01,n=3)。但84h后總死亡率不大
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