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1、本實(shí)驗(yàn)采用RACE PCR技術(shù)和巢氏PCR方法分別從褶紋冠蚌和三角帆蚌中克隆到硫氧還蛋白(Trx)和葡萄糖調(diào)節(jié)蛋白78(Grp78)基因的cDNA全長(zhǎng)序列。通過(guò)熒光定量PCR技術(shù)分析了Trx在褶紋冠蚌血細(xì)胞、肝胰腺、鰓、外套膜和肌肉組織中的表達(dá),以及PBS刺激和金黃色葡萄球菌刺激后其在褶紋冠蚌五種組織中的表達(dá)變化。利用半定量RT-PCR分析Grp78基因在三角帆蚌的五個(gè)組織中表達(dá),以及冷、熱休克誘導(dǎo)后Grp78基因在三角帆蚌的五個(gè)組織中
2、表達(dá)變化。
1、CpTrx基因序列1169 bp(登錄號(hào):KC209545),其中5'非編碼區(qū)(UTR)長(zhǎng)11bp,3'非編碼區(qū)長(zhǎng)840 bp,含有PolyA尾和典型的腺苷酸信號(hào)序列AATAAA,開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF)長(zhǎng)度為318 bp,編碼105個(gè)氨基酸。預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)分子量為11.79 kDa,等電點(diǎn)為5.38,不含有信號(hào)肽。氨基酸序列中含有1個(gè)Thioredoxin結(jié)構(gòu)域(T3-K10
3、4),區(qū)域內(nèi)包含一個(gè)保守的CGPC活化位點(diǎn)。序列同源性比較結(jié)果顯示褶紋冠蚌Trx與太平洋牡蠣(Crassostrea gigas)和紫貽貝(Mytilus galloprovincialis)的氨基酸序列一致性分別為56%和52%。預(yù)測(cè)的Trx空間結(jié)構(gòu)由5個(gè)β折疊和4個(gè)α-螺旋組成,α-螺旋包圍β折疊形成緊密的球形,這一結(jié)構(gòu)與人的Trx空間結(jié)構(gòu)相似。Trx mRNA在血細(xì)胞、肝胰腺、鰓、外套膜、閉殼肌中均有表達(dá),在鰓中表達(dá)量最高,其次是
4、肝胰腺。金黃色葡萄球菌刺激褶紋冠蚌后,與PBS相比,各組織中的Trx表達(dá)量上升,血細(xì)胞中12h達(dá)到最高點(diǎn)后逐漸降低,48h最低但仍比空白對(duì)照高;肝胰臟中12h到48h一直升高到最大;鰓中12h明顯升高,并達(dá)到最大值,然后開始降低直至空白對(duì)照以下;外套膜中12h和24h的表達(dá)量逐漸降低,36h的表達(dá)量升高,達(dá)到最大值,48h的表達(dá)量再次降低至空白對(duì)照以下;閉殼肌中12h明顯升高,并達(dá)到最大值,24h、36h、48h的表達(dá)量明顯降低并至空白
5、對(duì)照以下。
2、HcGrp78基因cDNA全長(zhǎng)為3721 bp,其中5'UTR長(zhǎng)度為148 bp,3'UTR長(zhǎng)度為1578 bp,包含1個(gè)AATAA加尾信號(hào)和一個(gè)多聚腺苷酸ploy(A)尾,開放閱讀框長(zhǎng)度為1995 bp,預(yù)測(cè)編碼664個(gè)氨基酸。預(yù)測(cè)HcGrp78蛋白分子量為73.27kDa,理論等電點(diǎn)為4.99。N端有一段長(zhǎng)度為22個(gè)氨基酸的信號(hào)肽(Met-Gla22)。第44-51個(gè)氨基酸、第232-245個(gè)氨基酸及第
6、369-383個(gè)氨基酸為3個(gè)HSP70家族的簽名序列(Signature sequence),分別為IDLGTTYS、VFDLGGGTFDVSLL和VVLVGGSTRIPKVQQ.含有16個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)和、8個(gè)蘇氨酸磷酸化位點(diǎn)、4個(gè)酪氨酸磷酸化位點(diǎn)。序列同源性比較結(jié)果顯示三角帆蚌Grp78與其他物種高度保守,同源性在92%以上。HcGrp78 mRNA在三角帆蚌肌肉、外套膜、鰓、肝胰腺和血細(xì)胞中均有表達(dá)。4℃冷刺激后,與正常溫度20
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