我國一些Potyvirus屬和Carlavirus屬成員的鑒定和分子變異研究.pdf

1、用馬鈴薯Y病毒科(familyPotyviruidae)特異性簡并引物(Sprimer,M4)和香石竹潛隱病毒屬(genus Carlavirus)簡并引物[Pcar1 (+),M4]對12科40個植物樣品進(jìn)行了RT-PCR擴(kuò)增來檢測植物病毒,結(jié)合序列分析,鑒定了了13種植物病毒共23個分離物,其中一些樣品已存在兩種病毒的復(fù)合侵染.測定了杭州地區(qū)侵染葫蘆科作物的冬瓜(WG-BS)、西瓜(WM-BS)、絲瓜(SG-BS)、黃瓜(CU-BS

2、)4個西葫蘆黃花葉病毒(Zucchiniyellowmosaicvirus,ZYMV)分離物的全序列(9592-9593個核苷酸)和南瓜日本品種(S-JP)、下沙南瓜(S-XS)、中國南瓜(P)和香瓜(MM-BS)等4個分離物3′-末端部分序列(1683-1684個核苷酸),外殼蛋白基因(CP)進(jìn)化樹分析表明存在一個全部由中國分離物(S-JP、WM-BS、MM-BS和S-XS)構(gòu)成,彼此間高度相似的類群(第Ⅲ類群).用引物Sprimer

3、在表現(xiàn)花葉癥狀的半夏(Pinellia)上檢測到1個Potyvirus屬病毒,測定了其RNA基因組3′-末端1733個核苷酸,同源性比較和進(jìn)化樹分析表明該病毒與大豆花葉病毒(Soybean mosaic virus,SMV)有較近的親緣關(guān)系.用特異性科屬簡并引物檢測患病百合的線狀植物病毒,在引進(jìn)的歐洲百合品種Sorbonne(HZ2)中存在在百合無癥病毒(Lilysymptomless virus,LSV)和百合斑駁病毒(Lily mo

4、ttle virus,LMoV)的復(fù)合侵染,杭州麝香百合(L.Longirlorum)和引進(jìn)的歐洲百合品種Siberia(HZ4)中僅含有LSV.測定LMoV-HZ2 RNA 基因組的3′-末端1660個核苷酸序列,經(jīng)外殼蛋白序列同源性和進(jìn)化樹分析,LMoV-HZ2分離物與LMov杭州龍牙百合分離物(LMoV-HZ)分屬于兩個差異明顯的群體.測定3個LSV杭州分離物基因組3′-末端1796個核苷酸序列,經(jīng)外殼蛋白同源性和進(jìn)化樹分析,3個

5、LSV 杭州分離物高度相似,除韓國分離物(AJ13812)、和日本分離物(D43801)外,其它分離物外殼蛋白核苷酸和氨基酸同源性高達(dá)98.2-99.3﹪,它們可能有著共同的起源.測定了菜豆黃花葉病毒(Bean yellow mosaic virus,BYMV)杭州菜豆分離物(BYMV-HZ)基因組3′-末端1629個核昔酸序列,包括NIb基因部分離列、CP基因和3′-UTR.推測NIb/CP裂解位點雙氨基酸序列為Q/S,產(chǎn)生一分子量為

6、31.0kDa的外殼蛋白,蚜傳相關(guān)基序DAG被置換成了NAG.外殼蛋白氨基酸序列進(jìn)化樹分析顯示杭州分離物與侵染長柄蘭屬(Masdevallia)植物的澳大利亞分離物(AF185961)進(jìn)化相關(guān)性最高.測定了萵苣花葉病毒(Lettuce mosaic virus,LMV)杭州分離物(LMV-HZ)的基因組3′-末端1688個核苷酸序列.測定了復(fù)合侵染杭州馬鈴薯的馬鈴薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)和馬鈴薯S病毒(Potao