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文檔簡介
1、揚州大學碩士學位論文基因序列顯示與分析系統(tǒng)姓名:沈玲玲申請學位級別:碩士專業(yè):計算機應用技術指導教師:徐永安20090501AbstractBioinformaticsisacrossingdisciplinewhichcontainsallaspectsofdisposing、storage、distributing、analysisingandexplainingofbiologicalinformation,usingmathem
2、atics、computerscienceandalltechnologysofbiologytoillustrateandunderstandthelifeactivitiesinagreatdealofdatumSequencealignmentisthefoundationandpreconditionofbioinformaticsresearch,anditisthebasicmethodofkindsofsequencean
3、alysistask,providingvaluableinformatinsforGeneticSciencessuchasExpectingthefunctions&structuresofProtein,discoveringtheEvolutionaryRelationshipsanddevelopingnewmedicineButthisisstillanunsettledproblemintheComputedMolecul
4、arBiologyyetItisprovedthatsequencealignmentisaNPCompleteproblem,itisachallengingtaskInpracticeappliance,thescaleofsequencealignmentislarge,andittakestimeAlongwiththeincreasingofsequencedatasinbiologysequencedatabase,prov
5、idingextensiveforegroundforlifescienceresearch,bringingrigorouschallengestothecapacityofdisposingbi0109icaldatanowItseemsveryinstancytoexploitallalgorithmwithhighsensitivityandhighefficiencyInrecentyears,withtheincreasin
6、gofgenesequence,thegraphicalrepresentationisbecominganimportantmeansforstudinggenesequencesSohowtogiveeffectivegraphicalrepresentationofgenesequences,toclassifygenesandtostudythephylogeneticrelationshipsaretheimportantpr
7、oblemsinBioinformaticsThisthesisisresearchinthegraphicalrepresentationofDNAsequences、genesequencealignmentandconstructingevolutionarytreeWehavedonetheresearchasfollows:(1)Simplyintroducingseveralfrequently—usedtypicalgra
8、phicalrepresentationofgenesequencesmainlyresearchingtheZcurvetheoryraisebyZhangChunTingacademicianinTinjinUniversity,andusingtheNon—uniformB—splineCurvesinGraphicstofitZcurves;(2)Analysisingthestatisticalcharacteristicsp
9、arameterofcharactersandgeometricalcharacteristicsparameterofZcurvesofgenesequences;(3)Simplyintroducingtheclassicalalgorithmsofsequencealignment,speciallydiscussingtheDynamicProgrammingAlgorithmwhichistheearliestraisedan
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