部分中國黃牛BoLA-DQB、DRB-,3-基因及其上游調(diào)控區(qū)序列分析.pdf

1、MHC即主要組織相容性復(fù)合體(Major Histocompatibility Complex)是由緊密連鎖、高度多態(tài)的基因位點(diǎn)所組成的染色體上的一個(gè)區(qū)域,在機(jī)體的免疫應(yīng)答調(diào)控和免疫識(shí)別過程中發(fā)揮著重要作用.該研究采用測(cè)序法,分別對(duì)恩施黃牛、秦川牛、皖南牛、溫嶺高峰牛、廷邊牛的MHC-Ⅱ類基因DQB和DRB<,3>及其上游調(diào)控區(qū)序列進(jìn)行分析,以揭示中國黃牛MHC基因的分子遺傳多樣性,得到以下結(jié)果:(1)該研究在中國黃牛中共發(fā)現(xiàn)127種D

2、QB<'*>exon2等位基因,恩施黃牛中36個(gè),秦川牛中42個(gè),皖南牛中35個(gè),溫嶺高峰牛中40個(gè),延連牛中42個(gè).(2)127種DQB<'*>exon2等位基因之間共存在85個(gè)(79Pi+6S)多態(tài)位點(diǎn),占序列總長度的31.48﹪.在DQB<'*>exon2等位基因和DQB<,3><'*>exon2等位基因中,發(fā)生非同義替換的多態(tài)位點(diǎn)均主要分布在抗原結(jié)合位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的編碼序列中.(3)127種DQB<'*>exon2等位基因編碼的氨基酸

3、序列之間共存在41個(gè)(40Pi+1S)變異位點(diǎn).按照品種劃分,恩施黃牛40個(gè)(36Pi+4S);延邊牛39個(gè)(36Pi+3S);秦川牛37個(gè)(36Pi+1S);溫嶺高峰牛37個(gè)(34Pi+3S);皖南牛最少,為36個(gè)(34Pi+2S).將各個(gè)變異位點(diǎn)的氨基酸組成進(jìn)行品種間比較,通過卡方檢驗(yàn)證明,第13、77和86位點(diǎn)的氨基酸組成在品種間具有顯著差異(p<0.05),第28位和第75位差異極顯著(p<0.01).其中包含了第13、28和8

4、6位共3個(gè)抗原結(jié)合位點(diǎn).(4)在35種BoLA-DQB<'*>exon2等位基因上游共檢測(cè)到28種DQB-URR等位基因.DQB<'*>exon2等位基因中除了Q-19、Q-36、Q-38分別只與一種DQB-URR等位基因相對(duì)應(yīng)外,其余的均分別對(duì)應(yīng)兩種DQB-URR等位基因.(5)在28種BoLA-DQB-URR等位基因和12種BoLA-DRB-URR等位基因中均存在與HLA-Ⅱ類基因上游調(diào)控區(qū)中類型一致,且排列順序一致的與基因表達(dá)調(diào)控

5、有關(guān)的調(diào)控元件,包括W box、X box、Y box、CCAAT box以及類TATA box.(6)BoLA-DQB-URR等位基因中,調(diào)控元件W box、X box、Y box以及類TATA box是多態(tài)的,CCAAT box是保守的.另外,在調(diào)控元件之間也分布著多態(tài)位點(diǎn).(7)對(duì)于BoLA-DQB、DRB基因,相同的結(jié)構(gòu)基因都可以與不同的URR相對(duì)應(yīng),反之亦然.說明啟動(dòng)子與結(jié)構(gòu)基因之間并不存在嚴(yán)格的對(duì)應(yīng)關(guān)系,其對(duì)應(yīng)關(guān)系是可變的.