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1、分類號(hào)UDC:密級(jí)華東理工大學(xué)學(xué)位論文小球藻異養(yǎng)/光誘導(dǎo)切換過(guò)程的分子響應(yīng)及其功能基因組學(xué)研究范建華指導(dǎo)教師姓名:李元廣教授華東理工大學(xué)徐健研究員中國(guó)科學(xué)院青島生物能源與過(guò)程研究所申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專業(yè)名稱:生物化工論文定稿日期:20120905學(xué)位授予單位學(xué)位授予日期論文答辯日期:魚(yú)!蘭:竺蘭l華東理工大學(xué)答辯委員會(huì)主席評(píng)閱人鼢酗鞭黼華東理工大學(xué)博士學(xué)位論文第1頁(yè)小球藻異養(yǎng)/光誘導(dǎo)切換過(guò)程的分子響應(yīng)及其功能基因組學(xué)研究摘要隨著化石燃料
2、的日益枯竭及實(shí)現(xiàn)低碳經(jīng)濟(jì)的迫切需要,微藻能源已成為世界各國(guó)重點(diǎn)研究與發(fā)展的戰(zhàn)略方向,但是文獻(xiàn)中對(duì)微藻油脂合成和積累及環(huán)境互作機(jī)制這一關(guān)鍵問(wèn)題的研究少有報(bào)道,限制了微藻能源的產(chǎn)業(yè)化?;谑讋?chuàng)的異養(yǎng)稀釋光誘導(dǎo)串聯(lián)技術(shù)和高產(chǎn)油蛋白核小球藻(Chlorellapyrenoidosa)良種,可實(shí)現(xiàn)集“高附加值微藻產(chǎn)品、微藻能源與生物固碳“的一體化開(kāi)發(fā),有望加快微藻能源和微藻固碳的產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程,但目前對(duì)該技術(shù)缺乏機(jī)理方面的認(rèn)識(shí),致使其工藝的優(yōu)化放大缺
3、乏理論指導(dǎo)。此外,目前國(guó)內(nèi)外均未見(jiàn)可戶外大規(guī)模培養(yǎng)的淡水能源微藻的基因組報(bào)道,嚴(yán)重制約了淡水能源微藻生理性狀的進(jìn)一步挖掘和大規(guī)模應(yīng)用。Cpyrenoidosa不僅可生產(chǎn)高附加值小球藻粉,而且高產(chǎn)油脂,是一株具有廣闊應(yīng)用前景的淡水工業(yè)藻種,但迄今未見(jiàn)有關(guān)該藻遺傳背景研究方面的報(bào)道,因而亟待深入研究。本文針對(duì)微藻能源產(chǎn)業(yè)化開(kāi)發(fā)中基礎(chǔ)科學(xué)問(wèn)題一一能源微藻胞內(nèi)代謝及油脂合成與積累的系統(tǒng)生物學(xué)機(jī)制這一熱點(diǎn)方向開(kāi)展研究。首先,圍繞異養(yǎng)稀釋一光誘導(dǎo)串
4、聯(lián)培養(yǎng)過(guò)程,首次發(fā)現(xiàn)小球藻異養(yǎng)細(xì)胞經(jīng)光誘導(dǎo)處理后可在短時(shí)間內(nèi)(12h)提高油脂含量近l倍;據(jù)此開(kāi)展了Cpyrenoidosa的全基因組測(cè)序,揭示了首個(gè)淡水能源微藻的全基因組圖譜:然后,運(yùn)用RNAseq,首次分析了小球藻在異養(yǎng)和光誘導(dǎo)下的基因轉(zhuǎn)錄圖譜,鑒定發(fā)現(xiàn)2800多個(gè)差異表達(dá)基因,并在全局轉(zhuǎn)錄水平闡述了小球藻胞內(nèi)碳流在油脂、蛋白、色素、淀粉之間的協(xié)調(diào)分配和調(diào)控規(guī)律;最后,基于基因組和轉(zhuǎn)錄組信息,首次重構(gòu)了Cpyrenoidosa的中心
5、碳代謝、油脂和淀粉代謝途徑。具體表述如下:(1)異養(yǎng)/光誘導(dǎo)切換過(guò)程的生化和細(xì)胞水平變化規(guī)律。首次發(fā)現(xiàn)異養(yǎng)轉(zhuǎn)入光誘導(dǎo)后,小球藻油脂含量可在12h內(nèi)提高約1倍,預(yù)示著小球藻特殊的油脂代謝調(diào)控能力;此外,Cpyrenoidosa胞內(nèi)蛋白質(zhì)、葉綠素和葉黃素等活性物質(zhì)含量均在短時(shí)間內(nèi)(812h)提高了1倍左右,同時(shí)碳水化合物的含量顯著下降;細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)研究發(fā)現(xiàn)異養(yǎng)轉(zhuǎn)入光誘導(dǎo)后,淀粉粒逐漸消失和蛋白核迅速形成,進(jìn)一步表明蛋白、油脂和色素等組分快速
6、積累和碳水化合物的降解密切相關(guān);上述變化特征在另外兩株小球藻Cvulgaris徊Cellipsoidea中,以及在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)和戶外小型光反應(yīng)器中的分析結(jié)果一致,表明異養(yǎng)稀釋光誘導(dǎo)串聯(lián)培養(yǎng)技術(shù)具有一定的普適性;異養(yǎng)稀釋光誘導(dǎo)技術(shù)培養(yǎng)Cpyrenoidosa的油脂產(chǎn)率最大可達(dá)8989mg/L/d,且脂肪酸碳鏈組成主要為C16C18,滿足制備生物柴油的要求。(2)全基因組圖譜繪制。首次對(duì)一株淡水高產(chǎn)油Cpyrenoidosa進(jìn)行了全基因組測(cè)序,
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