Markush結(jié)構(gòu)分析與檢索系統(tǒng).pdf

1、化學(xué)專利中普遍應(yīng)用的Markush結(jié)構(gòu)是由一個新穎的母體基團和可變?nèi)〈M成,由于可變?nèi)〈膹?fù)雜性使得Markush結(jié)構(gòu)的檢索和匹配成為化學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域的一個難題.本論文在深入研究了現(xiàn)有Markush結(jié)構(gòu)處理方案和本課題組已有研究成果的基礎(chǔ)上,提出了一個處理Markush結(jié)構(gòu)的兩階段方案.首先進行篩選,將Markush結(jié)構(gòu)中相對穩(wěn)定的環(huán)和環(huán)之間的連接片斷提取出來構(gòu)成族性結(jié)構(gòu)的骨架(Scaffold),利用SMILES擴展算法程序?qū)Νh(huán)和非

2、環(huán)原子,特別是對芳香環(huán)原子的識別算法,實現(xiàn)了結(jié)構(gòu)式的程序分析,刪除環(huán)上的連接片斷,保留了環(huán)和環(huán)之間的連接片斷,利用程序自動生成了Markush結(jié)構(gòu)的骨架.第二階段是在每一個骨架結(jié)構(gòu)上添加非環(huán)的可變?nèi)〈?提取其中的官能團信息加以分析歸類,作為環(huán)的屬性描述.用面向?qū)ο蟪绦蛟O(shè)計方法(OOP)實現(xiàn)了骨架編碼方案的一系列算法,用Java語言完成了能夠運行于網(wǎng)頁的Applet程序StruDraw,對提問結(jié)構(gòu)式能夠?qū)崿F(xiàn)結(jié)構(gòu)的分析,對于檢索用戶起向?qū)?/p>