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文檔簡介
1、研究目的
探索PPARα/γ8個SNPs(single nucleotide polymorphism, SNP)與原發(fā)性高血壓(Essential Hypertension, EH)之間的關聯(lián)和多個SNPs之間的基因-基因交互作用對EH的影響;在有顯著交互作用同一亞型的 SNPs之間構建單體型,以發(fā)現(xiàn)與 EH顯著相關的單體型;分析與EH關聯(lián)的單體型與BMI之間的交互作用。
材料與方法
來自于―江蘇省多代謝
2、異常和代謝綜合征綜合防治研究(PMMJS)‖隊列人群,采用單純隨機抽樣方法共抽取了820名研究對象(男性270名,女性550名),其中血壓正常者551名,EH269名。選取PPARα3個和PPARγ5個基因位點進行多態(tài)性檢測,其中 rs4253778使用聚合酶鏈反應—限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法分析,其余位點應用Taqman熒光探針法。采用Logistic回歸模型分析SNPs與原發(fā)性高血壓的關聯(lián)。應用廣義多因子降維(GM
3、DR)模型分析SNPs之間的交互作用。采用R語言分析軟件HAPLO.STATS對滿足條件的SNPs構建單體型并在調整環(huán)境變量后分析單體型與BMI的交互作用對EH的影響。
研究結果
1.對所有基因位點進行Hardy-Weinberg平衡檢驗,結果顯示PPARα/γ8個基因位點各基因型頻數(shù)的實際值與期望值不存在統(tǒng)計學差異(P﹥0.05)。對選取的PPARα/γ8個SNPs進行連鎖平衡檢驗,結果顯示每兩個SNPs之間均不存
4、在強烈的連鎖不平衡狀態(tài)(D'<0.75)。
2.單因素Logistic回歸分析顯示,與野生型相比,rs135539位點C等位基因攜帶者(AC+CC)和rs1800206 V等位基因攜帶者(LV+VV)發(fā)生EH的危險性顯著降低,在調整年齡、性別、吸煙、飲酒、高脂飲食、低纖飲食、職業(yè)體力活動(下同)后rs1800206的V等位基因攜帶仍為顯著保護因子。PPARγ五個位點中, rs1805192的A等位基因攜帶者(PA+AA)發(fā)生E
5、H的危險性顯著降低,調整年齡、性別等因素后不再顯著。rs10865710和rs4684847的突變等位基因均顯示為危險因素,與野生型相比,rs10865710位點G等位基因攜帶者(CG+GG)和rs4684847 T等位基因攜帶者(CT+TT)發(fā)生EH的危險性顯著增加,在多因素調整后均依然顯著。
3. GMDR結果顯示,rs1800206、rs4253778、rs135539、rs1805192、rs3856806和rs108
6、651706個SNPs之間的交互作用達到統(tǒng)計學顯著水平(p=0.0107),交叉驗證一致性為10/10,平均檢驗準確度為0.6000。
4.單體型分析結果顯示,PPARα rs135539 rs4253778 rs1800206的A-G-V和C-G-V單體型與 EH均存在顯著關聯(lián), OR(95%CI)分別為0.56(0.33~0.82)、0.53(0.30~0.84);PPARγ的rs10865170 rs1805192 rs
7、3856806的G-P-T單體型與EH存在顯著關聯(lián),OR(95%CI)=2.39(1.44~3.96)。
5.單體型與 BMI交互作用分析結果顯示,PPARα上,與 EH關聯(lián)的單體型A-G-V以及單體型 C-G-V與 BMI的交互作用 P值分別為0.911和0.294,OR(95%CI)分別為1.07(0.35-3.27)和2.10(0.52-8.43);與PPARγ上與EH關聯(lián)的單體型G-P-T與BMI的交互作用P值為0.0
8、43,OR(95%CI)值為1.16(1.07-1.26)。
結論
1、PPARαrs135539以及PPARγ的rs10865170和rs4684847與EH顯著關聯(lián)。
2、Rs1800206、rs4253778、rs135539、rs1805192、rs3856806和 rs10865170對EH存在顯著的基因-基因交互作用。
3、單體型分析中,PPARαrs4253778 rs135539
9、rs1800206的A-G-V和C-G-V單體型與較低的EH風險顯著相關;PPARγ的rs10865170 rs1805192 rs3856806的G-P-T單體型與較高的 EH風險顯著相關。因此 PPARα rs4253778 rs135539 rs1800206的A-G-V和C-G-V以及PPARγ的rs10865170 rs1805192 rs3856806的G-P-T可能是中國漢族人EH的遺傳標記。
4、單體型與環(huán)境交
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