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1、目的:研究3號(hào)染色體短臂(3p)相關(guān)抑癌基因CpG島甲基化表型(CIMP),及hOGG1基因變異與非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患病關(guān)系,以作為早期診斷非小細(xì)胞肺癌和評(píng)估預(yù)后生存情況的生物學(xué)指標(biāo)。
方法:1:對(duì)4株NSCLC細(xì)胞株(SPC—A—1,A549,95—D和LTEP—α—2)進(jìn)行培養(yǎng);細(xì)胞去甲基化效應(yīng)由5—雜氮—2’—脫氧胞苷酸(5—aza—CdR)處理;MTT法檢測(cè)細(xì)胞增殖;對(duì)80例NSCLC患者和無(wú)腫瘤歷史的正常
2、對(duì)照外周血(PBMC)樣本進(jìn)行3號(hào)染色體短臂抑癌基因CpG島甲基化表型(3pCIMP)分析,3pCIMP指的是每份樣本中有3個(gè)或多于3個(gè)3號(hào)染色體相關(guān)抑癌基因同時(shí)甲基化,甲基化特異性PCR(MSP)檢測(cè)6個(gè)基因的甲基化狀態(tài),2:Haploview software V4.1軟件分析選取hOGG1基因htSNP,RFLP和SSCP法對(duì)117例非小細(xì)胞肺癌外周血樣本和121例無(wú)腫瘤歷史正常對(duì)照外周血樣本進(jìn)行基因分型,然后進(jìn)行單倍型分析;對(duì)5
3、株NSCLC細(xì)胞株(SPC—A—1,A549,95—D,NCI—H460和LTEP—α—2)進(jìn)行培養(yǎng),5—雜氮—2’—脫氧胞苷酸(5—aza—CdR)去甲基化處理并收集DNA和RNA,117對(duì)NSCLC患者腫瘤組織樣本和匹配的非腫瘤組織樣本進(jìn)行hOGG1基因甲基化分析,以上結(jié)果最終通過(guò)Logistic回歸分析對(duì)性別、年齡、吸煙史進(jìn)行校正。
結(jié)果:去甲基化實(shí)驗(yàn)顯示3pCIMP狀態(tài)在NSCLC細(xì)胞增殖中起到了重要作用,NSCL
4、C患者外周血樣本中有97.5%樣本3號(hào)染色體短臂(3p)上6個(gè)基因中(hOGG1,RAR—B,SEMA3B,RASSF1A,BLU,F(xiàn)HIT)任一基因的甲基化。讓人感興趣的是,NSCLC的PBMC樣本中3pCIMP+為43.8%但是在正常對(duì)照的PBMC樣本中僅有6.3%。以上數(shù)據(jù)顯示3pCIMP狀態(tài)在NSCLC和正常對(duì)照中有顯著差異(P<0.001)。更重要的是,結(jié)果進(jìn)一步表明在中國(guó)人群中,3pCIMP陽(yáng)性攜帶者非小細(xì)肺癌患病風(fēng)險(xiǎn)增加了
5、12.8倍(校正后OR,12.8;95%CI,4.38—37.4,P<0.001)。
117例NSCLC外周血樣本和121例正常對(duì)照外周血樣本中hOGG1基因多態(tài)性分析無(wú)顯著差異,但讓人感興趣的是,5株非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株經(jīng)去甲基化藥物處理前后,hOGG1基因甲基化狀態(tài)發(fā)生了變化,其中3株細(xì)胞在去甲基化藥物處理前后mRNA表達(dá)有顯著差異;進(jìn)一步對(duì)117例NSCLC和配對(duì)的非腫瘤組織樣本中hOGG1基因甲基化狀態(tài)檢測(cè)顯示,NS
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