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文檔簡介
1、本文應用RNA干擾技術(shù)化學合成siRNA及構(gòu)建短發(fā)夾狀RNA(short hairpin RNA,shRNA)表達質(zhì)粒,研究其作用于E6AP基因后對E6AP基因mRNA及蛋白表達的影響,對宮頸癌細胞增殖和凋亡的影響。同時對比干擾前后hTERT表達和端粒酶活性的變化,探討E6AP與hTERT的關(guān)系。研究E6AP基因在宮頸癌發(fā)病機制中的作用和意義,為宮頸癌的基因診斷和藥物治療提供科學的實驗依據(jù)。 研究材料和方法: 1、半定量
2、RT-PCR法。選取2004年5月至2006年5月中國醫(yī)科大學第二附屬醫(yī)院婦產(chǎn)科手術(shù)切除和活檢的浸潤宮頸癌標本35例,選擇慢性宮頸炎組織、CIN組織各10例,按Trizol試劑盒說明進行組織總RNA的提取,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。E6AP引物序列:5’-AATCCTGCAGACTTGAAGAA-3’和5’-TCCACATICCCTTCATACTC-3’。PCR反應體系反應條件:93℃變性1min后,以93℃30s、56℃30s、72℃45s的
3、順序循環(huán)30次,最后72℃延伸10min。 2、體外合成siRN,A。模板設(shè)計采用Ambion公司提供的網(wǎng)上在線設(shè)計工具,每對模板長29個堿基,含與T7啟動子序列互補的8個堿基和與靶基因?qū)?1個堿基。用AmbionSilencerTM siRNA Construction Kit合成21個堿基的正義鏈和反義鏈RNA并退火形成雙鏈RNA。E6APsiRNA如下:Antisense:5’-UALJCUCAGAGCAGGAGUUG
4、UU-3’,Sense:5’-CAACACCUGCUCUGAGAUAUU-3’; Non-sense control: Antisense:5’-AGGUGACUAGCACUGUUAGUU-3’,Sense:5’-GUAACAGUGCUAGUCACCUUU-3’。 3、shRNA的設(shè)計和真核表達質(zhì)粒的構(gòu)建。根據(jù)GenBank報道的E6AP序列,利用Ambion公司提供的軟件設(shè)計E6AP基因的RNAi序列,中間loop環(huán)序列選用:
5、TTCG四個堿基,兩側(cè)為與載體連接的酶切位點序列。RNAi-E6AP模板:A:5’-TCGACCAACTCCTGCTcTGAGATATTCGTATCTCAGAGCAGGAGTTGTTTTTTT A-3’:B:5’-AGCTT AAAAA AACAACTCCTGCTCTGAGA ACGAATATCTCAGAGCAGGAGTTGG-3’。RNAi.Non-sense模板:A:5’-TCGACCTAACAGTG CTAGTCACCTTTCGA
6、GGTGA CTAG CACTGTTAGTTTTTTTA.3’:B:5’-AGCTTAAAAAAACTAACAGT GCTAGTC ACCTCGAA AGGTGA CTAGCACTG TTAGG-3’。合成DNA序列退火成雙鏈DNA。 SaⅡ/HindⅢ酶切質(zhì)粒,1%瓊脂糖電泳后回收載體,然后與RNAi-E6AP模板連接,獲得的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化DH5a感受態(tài)大腸桿菌,挑選陽性克隆后提取質(zhì)粒,測序驗證后轉(zhuǎn)染細胞。 4、細胞培養(yǎng)和質(zhì)粒轉(zhuǎn)
7、染。Hela細胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清、1%雙抗的RPMI1640培養(yǎng)液。利用轉(zhuǎn)染試劑TransMessenger轉(zhuǎn)染化學合成的siRNA。采用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamin 2000轉(zhuǎn)染質(zhì)粒。 5、半定量RT-PCR。各組細胞加入Trizol試劑提取總RNA。反應條件為:93℃變性1min后,以93℃30s、56℃ 30s、72℃ 45s的順序循環(huán)30次,最后72℃延伸10min。E6AP引物序列:5’-AATCCTG
8、CAGACTTGAAGAA-3’和5’-TCCACATTCCCTTCATAC TC-3’。以β-肌動蛋白基因作為內(nèi)對照,PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,紫外線照相并進行分析。 6、E6AP蛋白質(zhì)的檢測。采用蛋白印跡法,細胞經(jīng)4%十二烷基硫酸鈉(SDS)裂解,勻漿,離心,提取細胞總蛋白質(zhì)。考馬斯亮藍法蛋白質(zhì)定量。各組樣本分別取總蛋白質(zhì)300μg,經(jīng)10%SDS聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳后轉(zhuǎn)PVDF膜。與特異性單克隆一抗4℃過夜。
9、與二抗室溫孵育2h后,ECL顯色。 7、噻唑藍(MTT)檢測細胞增殖。各組細胞胰酶消化,稀釋成2 X 10<'5>/ml濃度,加入96孔板中,設(shè)3重復孔,培養(yǎng)12h,加入MTT,繼續(xù)培養(yǎng)4h,吸去培養(yǎng)液,加入二甲基亞砜(DMSO),震蕩5min,繼續(xù)培養(yǎng)30 min。在入=570 nm處測定吸光度。 8、流式細胞儀分析細胞凋亡。按照Anexin V流式細胞儀檢測試劑盒說明進行操作。收集細胞,在PBS中洗滌,Annexin
10、 V抗體及PI標記后,用FACS流式細胞儀進行雙色熒光細胞流式計數(shù),觀察凋亡細胞百分比。 9、hTERTmRNA的檢測。應用半定量RT-PCR法,反應條件為:93℃變性1min后,以93℃30s、55℃30s、72℃45s的順序循環(huán)32次,最后72℃延伸10min。引物序列:5’-GTGGATGATTTCTTGTTGT-3’:5’-GCAGGAGGATCTTGTAGATG-3’,以β-肌動蛋白基因作為內(nèi)對照。hTERT/β-ac
11、tin光密度比值作為hTERT mRNA的表達水平。 10、TRAP-PCR-ELISA。細胞端粒酶活性檢測,分別收集各組細胞,依據(jù)TRAP式劑盒提供的方法進行檢測,每份標本同時在酶標儀上讀取A450和A690吸收值,根據(jù)△A=A450-A690計算結(jié)果,△A值代表細胞端粒酶活性。 研究結(jié)果: 1、通過RT-PCR技術(shù)檢測組織中E6AP的表達,發(fā)現(xiàn)E6AP基因在慢性宮頸炎、CIN組織、癌性組織中均有表達。宮頸癌組
12、的表達量高于慢性宮頸炎組和CIN組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。E6AP基因表達隨著疾病臨床分期的進展而增加,Ⅰ、Ⅱ期表達與Ⅲ期的表達相比較差異有統(tǒng)計學意義(p<0.05)。而與腫瘤的類型、大小、組織分化、是否存在淋巴節(jié)轉(zhuǎn)移等無關(guān)。 2、體外合成特異性E6APsiRNA轉(zhuǎn)染入Hela細胞系,檢測干涉效果表明siRNA有效轉(zhuǎn)染Hela細胞并抑制基因的表達,細胞增殖明顯抑制,凋亡明顯增加,hTERT、基因表達明顯下調(diào),端粒酶活
13、性明顯降低,隨著干涉效果的消失逐漸恢復。 3、成功構(gòu)建靶向E6AP基因的shRNA真核表達質(zhì)粒,通過質(zhì)粒測序證實合成的siRNA基因序列正確,符合要求。pNeo-RNAi-E6AP表達載體有效轉(zhuǎn)染Hela細胞并抑制功能基因的表達,細胞增殖明顯抑制,凋亡明顯增加,hTERT、基因表達明顯下調(diào),端粒酶活性明顯降低。干涉后第20天,干涉效果與對照組比較差異有統(tǒng)計學意義,干涉時間明顯延長。 研究結(jié)論: 1、E6AP基因在
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