1、銹赤扁谷盜Cryptolestes ferrugineus和土耳其扁谷盜Cryptolestes turcicus屬鞘翅目Coleoptera扁谷盜科Laemophloeidae,是一類全球性分布第二食性儲糧害蟲,以在粉類和破碎的糧食、谷物中發(fā)生最多。目前,對于兩種扁谷盜研究主要集中于形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)和生物學(xué)特性等方面,分子研究數(shù)據(jù)較少,只有COI基因用于系統(tǒng)發(fā)育分析。因此,對扁谷盜線粒體基因組的測序可以豐富現(xiàn)有的線粒體全基因組數(shù)據(jù),為進(jìn)
2、一步進(jìn)行比較基因組學(xué)研宄提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本文通過長片段PCR(Long-PCR)技術(shù)對繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體基因組序列進(jìn)行了擴(kuò)增和測序,得到全長并分析其特征。同時基于繡赤扁谷盜及土耳其扁谷盜在內(nèi)的24種農(nóng)業(yè)昆蟲線粒體基因組數(shù)據(jù),利用不同方法(最大似然法、鄰接法和貝葉斯法)構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹,分析它們的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。主要結(jié)論如下:
1.銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體基因組長度分別為15,511bp和15,517bp,注釋得到
3、13個蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs)、16SrRNA和12SrRNA基因、22個tRNA基因和AT富集區(qū)序列。兩種扁谷盜的線粒體基因組序列具有較高的A+T含量,分別為76.4%和76.9%。
2.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體蛋白質(zhì)編碼基因均以ATN起始編碼,而終止密碼子具有多樣性,有完整的終止子TAA、TAG及不完整的TA或單個堿基T。
3.兩種扁谷盜22個tRNA長度在60-71 bp之間,AT含量分別約為76.2%
4、和77.2%。在這22個tRNA基因中,除tRNASer基因二氫尿嘧啶臂(DHU stem)結(jié)構(gòu)有缺失外,其他21個均可折疊成三葉草二級結(jié)構(gòu)。這些tRNA二級結(jié)構(gòu)中普遍存在堿基錯配,銹赤扁谷盜和土耳其扁谷盜線粒體tRNA二級結(jié)構(gòu)分別存在28處和21處。
4.銹赤扁谷盜及土耳其扁谷盜線粒體AT富集區(qū)分別為859bp及857 bp, AT含量高達(dá)86.5%和86.0%。在兩種扁谷盜線粒體AT富集區(qū)中存在不同數(shù)量的Poly-T、Po