整合組學(xué)數(shù)據(jù)、尋找神經(jīng)膠質(zhì)瘤相關(guān)通路.pdf

1、神經(jīng)膠質(zhì)瘤是神經(jīng)系統(tǒng)最為常見的惡性腫瘤。神經(jīng)膠質(zhì)瘤的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)多步驟、多階段、多基因參與的過程，伴隨著復(fù)雜的基因改變。微陣列技術(shù)具有高信息量、高通量等突出優(yōu)點(diǎn)，現(xiàn)已廣泛地應(yīng)用于腫瘤機(jī)制的研究中。
　　 然而很多的研究都是關(guān)注疾病差異基因的表達(dá)，為了尋找神經(jīng)膠質(zhì)瘤相關(guān)的重要生物通路，本文整合了神經(jīng)膠質(zhì)瘤相關(guān)的組學(xué)數(shù)據(jù)，如基因表達(dá)譜芯片、MicroRNA芯片以及ChIP-Seq的數(shù)據(jù)，驗(yàn)證了不同數(shù)據(jù)集的分子特征在系統(tǒng)水平上的相

2、似性高于基因水平的相似性這一假設(shè)，并發(fā)現(xiàn)了新穎的神經(jīng)膠質(zhì)瘤相關(guān)通路，如：Regulation of epithelial-to-mesenchymal transition(EMT),TGF-beta-dependent induction of EMT via SMADs等。這些通路仍需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證，同時(shí)也為神經(jīng)膠質(zhì)瘤的臨床研究、個(gè)性化治療和分子機(jī)制研究提供有意義的信息。在差異基因篩選的過程中，本文采用了一種新穎的特征基因鑒別方