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1、蘇州大學博士學位論文膠質(zhì)瘤惡性進展相關(guān)新基因研究姓名:孫繼勇申請學位級別:博士專業(yè):神經(jīng)外科學指導教師:黃強20030401腔質(zhì)瘤惡性進展相關(guān)新基因研究中文摘要析表明,其中有1l條基因的功能信息與誘導分化關(guān)系密切,可能是這一過程的關(guān)鍵基因。結(jié)論:生物信息學是分析基因表達譜的有力工具,可以很好的從表達譜數(shù)據(jù)提取出與膠質(zhì)瘤惡性進展和誘導分化相關(guān)的關(guān)鍵基因,本文利用這一先進工具篩選出了28條可能是膠質(zhì)瘤惡性進展過程中的關(guān)鍵基因供進一步研究。第
2、二部分半定量RTPCR驗證膠質(zhì)瘤相關(guān)新基因的表達利用基因芯片和生物信息學手段從大量的基因中篩選腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中重要的新調(diào)控基因,是目前腫瘤功能基因組研究的一個重要研究方向。但是小樣本量的檢測有時會出現(xiàn)一些假陽性和假陰性結(jié)果,因此很有必要抽取部分樣本和基因進行驗證。本文利用半定量RTPCR檢測了上文中篩選出來的28條基因中的7條基因在膠質(zhì)瘤組織中的表達’情況,目的:一方面驗證以前的基因芯片數(shù)據(jù)的可靠性;另一方面通過對基因表達水平的半定量
3、,進行橫向的對比,希望能夠找出這些基因在不同級別膠質(zhì)瘤中的表達規(guī)律,為進一步的功能研究提供依據(jù)。方法:按照7條基因的GenBank登錄號,檢索GenBank得到這些基因的全長cDNA序列,然后設(shè)計相應的PCR引物,針對22例惡性膠質(zhì)瘤病人的腫瘤組織作檢測,22例膠質(zhì)瘤按照WHO分級其中I級3例,II級8例,III級7例,IV級4例,最后利用SmartView電泳圖像分析軟件對各個基因在不同組織中的表達進行半定量。結(jié)果:這些基因在這些腫瘤
4、中的表達差異是有規(guī)律性的,和以前的基因芯片結(jié)果基本一致。如X54304(肌球蛋白輕鏈)、A1264216(膽堿轉(zhuǎn)運因子2)都是隨著惡性程度的進展而表達升高,而NM019896(DNA多聚酶p12亞基)、NM015962(CGI35蛋自)、AB037886(NESH蛋白)、D38305(Tob蛋白)、M87507(半胱天冬酶1,Caspasel)都是隨著惡性程度的進展而表達降低。結(jié)論:我們對于基因芯片和生物信息學技術(shù)篩選到的7條基因作半定
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