額爾齊斯河貝加爾雅羅魚微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及其遺傳多樣性分析.pdf

1、本研究以額爾齊斯河貝加爾雅羅魚（Leuciscus leuciscus baicalensis）為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，聯(lián)合二代測(cè)序技術(shù)和熒光毛細(xì)管電泳技術(shù)，開發(fā)微衛(wèi)星位點(diǎn)30個(gè)，其中19個(gè)來(lái)自基因組，11個(gè)來(lái)自轉(zhuǎn)錄組;利用這30個(gè)位點(diǎn)對(duì)哈巴河、布爾津及北灣三個(gè)群體進(jìn)行遺傳多樣性分析，并探究這些位點(diǎn)在其他9種鯉科魚類中的通用性。主要結(jié)果如下:
　　1.共合成160對(duì)引物，64對(duì)來(lái)自基因組，96對(duì)來(lái)自轉(zhuǎn)錄組;在擴(kuò)增（以北灣群體樣品為模板）過(guò)程中

2、出現(xiàn)不同程度的擴(kuò)增失敗:3對(duì)基因組微衛(wèi)星引物和25對(duì)轉(zhuǎn)錄組微衛(wèi)星引物未擴(kuò)增出任何條帶或者未得到目的條帶。
　　2.用30個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記評(píng)估北灣、布爾津和哈巴河三個(gè)群體的遺傳多樣性，共檢測(cè)出等位基因339個(gè)，各位點(diǎn)等位基因數(shù)范圍在4-27之間，平均11.3個(gè);有效等位基因數(shù)一共154.28個(gè)，介于1.56-15.34之間，平均5.14個(gè);觀測(cè)雜合度在0.37-1.00之間，平均值是0.68;期望雜合度在0.36-0.94，平均值是0.

3、75;多態(tài)性信息含量在0.31-0.93之間，平均值是0.71。
　　3.遺傳分化指數(shù)和遺傳距離顯示，三個(gè)群體沒(méi)有發(fā)生顯著分化;分子方差分析結(jié)果顯示，大部分變異來(lái)自個(gè)體間，極少數(shù)變異來(lái)自種群間。
　　4.位點(diǎn)多態(tài)性比例:基因組31.1％，轉(zhuǎn)錄組15.5％;用于遺傳多樣性評(píng)估的指數(shù)，基因組微衛(wèi)星位點(diǎn)的指數(shù)均大于轉(zhuǎn)錄組SSR微衛(wèi)星的指數(shù)。
　　5.30個(gè)位點(diǎn)在擬鯉中的通用率最高，為80％，其次是高體雅羅魚，為76.7％;轉(zhuǎn)