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文檔簡介
1、麻瘋樹(Jatropha curcas Linn)是大戟科(Euphorbiaceae)灌木樹種,是一種多用途且有較高潛在價值的生物柴油樹種。具有生長期短、耐旱、造林成本低及含油量高的特點。由于世界范圍的能源緊張和生物質(zhì)能的可再生性,麻瘋樹引起廣泛關(guān)注。
本研究采用cpSSR標(biāo)記技術(shù)對來自云南和四川的10個麻瘋樹野生居群200個樣本的遺傳多樣性進行分析,比較麻瘋樹居群間的遺傳差異,以期為麻瘋樹的良種選育以及種質(zhì)資源保護提供
2、依據(jù)。研究結(jié)果如下:
1.采用改良的CTAB法從麻瘋樹嫩葉中提取DNA。用該法提取的麻瘋樹DNA質(zhì)量完全能滿足cpSSR分析的要求。
2.通過對影響cpSSR-PCR擴增的模板DNA、dNTP、引物、TaqDNA聚合酶以及Mg2+濃度等5因素(不同水平)的優(yōu)化實驗,建立了適合于麻瘋樹cpSSR-PCR擴增的體系:2.00mmol/LMg2+、2U/μLTaqDNA聚合酶、0.2mmol/LdNTP、0.2μm
3、ol/L引物、35ng/μLDNA模板、用超純水補足20μL;與之相適應(yīng)的擴增程序為:95℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,52℃退火30s,72℃延伸1min,循環(huán)36次;最后在72℃延伸5min;4℃保存。
3.從25對cpSSR通用引物中篩選出12對引物,用于200個麻瘋樹樣本的cpSSR分析。12對引物共檢測到25個位點,其中22個位點是多態(tài)性位點,多態(tài)性位點百分率(P)為76.28%,說明這些居群適應(yīng)環(huán)境的能力
4、較強。研究結(jié)果表明,所檢測的10個麻瘋樹野生居群具有較高的遺傳多樣性。其中,四川會理(SCHL)的遺傳多樣性最高,為0.6269;云南瀘水(YNLS)遺傳多樣性最低,為0.4095。
4.cpSSR基因座揭示了麻瘋樹的遺傳變異:觀測等位基因數(shù)A=1.9840,有效等位基因數(shù)Ae=1.7136;Nei基因多樣性指數(shù)H=0.4020以及Shannon指數(shù)I=0.5767。另外,居群內(nèi)的基因多樣性為Hs=0.4051,居群間的基
5、因多樣DsT=0.0357。AMOVA分析得到居群內(nèi)的遺傳多樣性為91.02%,居群間的遺傳多樣性為8.98%。這都說明遺傳變異主要來自于居群內(nèi)個體間。另外,居群間基因流Nm>1,為3.0585,說明居群間存在一定的基因流。
5.基于cpSSR擴增條帶數(shù)據(jù)建立了UPGMA聚類圖。10個麻瘋樹野生居群的遺傳一致度范圍是0.8127-0.9798;遺傳距離范圍是0.0204-0.2073。其中四川雷波(SCLB)和云南西雙版納
6、(XSBN)的遺傳一致度最近(I=0.9798),遺傳距離最小(D=0.0204);而云南瀘水(YNLS)和四川金河(SCJH)的遺傳一致度最遠(yuǎn)(I=0.8127),遺傳距離最大(D=0.1614)。另外,在UPGMA聚類圖中四川金河(SCJH)和四川花棚子(SCHPZ)聚為一類;而四川會理(SCHL)、四川會東(SCHD)和四川雷波(SCLB)與云南的5個居群(YNSB、YNLX、YNPR、XSBN、YNLS)聚為另一類,這可能與四川
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