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1、目的:利用GeXP多重基因表達(dá)遺傳分析系統(tǒng),建立一種能夠同時(shí)檢測(cè)腦炎相關(guān)的8種蟲媒病毒的多重逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(mRT-PCR)方法,并對(duì)此方法作出初步評(píng)價(jià)。
方法:以腦炎相關(guān)的8種蟲媒病毒為研究對(duì)象,包括版納病毒(Bannavirus,BAV),乙型腦炎病毒(Japaneseencephalitisvirus,JEV),蜱傳腦炎病毒(Tick-borneencephalitisvirus,TBEV),Tahyna病毒(
2、Tahynavirus,TAHV),遼寧病毒(Liaoningvirus,LNV),科薩努爾森林病病毒(Kyasanurforestdiseasevirus,KFDV),辛德畢斯病毒(Sindbisvirus,SINV)及云南環(huán)狀病毒(Yunnanorbivirus,YUOV)并加入小鼠腦脊髓炎病毒(Theiler'sMouseEncephalomyelitisvirus,TMEV)做為內(nèi)部對(duì)照。利用GeXP系統(tǒng)建立多重RT-PCR檢測(cè)
3、方法,設(shè)計(jì)各病毒特異引物并進(jìn)行篩選,以病毒分離培養(yǎng)物和陽性標(biāo)本來驗(yàn)證引物及多重反應(yīng)體系的特異性,根據(jù)PCR結(jié)果來優(yōu)化多重反應(yīng)體系及反應(yīng)條件,構(gòu)建單克隆質(zhì)粒并進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄并制備標(biāo)準(zhǔn)品即體外轉(zhuǎn)錄RNA的梯度稀釋液來檢測(cè)多重體系的靈敏度。用該方法對(duì)未知標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè),并將檢測(cè)結(jié)果與其它方法進(jìn)行比較,根據(jù)比較的結(jié)果對(duì)該方法做出評(píng)價(jià)。
結(jié)果:篩選后的各病毒引物擴(kuò)增片段大小與設(shè)計(jì)相符且特異性強(qiáng),相互之間無交叉反應(yīng)。優(yōu)化后的多重檢測(cè)體系,
4、可擴(kuò)增出各病毒對(duì)應(yīng)的特異片段,可在102拷貝/μL水平同時(shí)并特異地檢測(cè)出8種(共13個(gè)特異片段)腦炎相關(guān)蟲媒病毒RNA。通過對(duì)37份蚊蟲碾磨液提取核酸的標(biāo)本檢測(cè),可看出GeXP多重檢測(cè)方法特異性強(qiáng),且靈敏度明顯高于病毒分離及半巢式PCR。
結(jié)論:成功建立了一種基于GeXP的多重RT-PCR技術(shù)平臺(tái)的8種腦炎相關(guān)蟲媒病毒的檢測(cè)新方法,該方法具有高通量、靈敏度高、特異性強(qiáng)且快速等優(yōu)點(diǎn),對(duì)病毒性腦炎的分子診斷及流行病學(xué)調(diào)查具有重
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